本文選題：豬巨細(xì)胞病毒 + DPOL基因��； 參考：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年02期

【摘要】：為了明確豬巨細(xì)胞病毒(porcine cytomegalovirus,PCMV)福建株(PCMV-FJ01株)DPOL基因特征,本研究根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫中PCMV DPOL基因序列特征,利用引物設(shè)計軟件Oligo 7.0設(shè)計針對DPOL基因的引物,以PCMV-FJ01株核酸DNA為模板,對其進(jìn)行分段PCR擴(kuò)增。將分段擴(kuò)增的產(chǎn)物經(jīng)膠回收試劑盒回收后進(jìn)行克隆測序,對測序結(jié)果進(jìn)行拼接后獲得PCMV-FJ01株DPOL基因序列,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,PCMV-FJ01株DPOL基因全長為3 021bp,編碼1 006個氨基酸;其與GenBank中的PCMV分離株DPOL基因核苷酸和氨基酸同源性分別在98.7%和99.1%以上。遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),相對于巨細(xì)胞病毒屬其他種代表株,PCMV分離株DPOL基因在遺傳進(jìn)化上和玫瑰皰病毒屬代表株更近。建議根據(jù)PCMV DPOL基因遺傳進(jìn)化特征,將其劃歸為玫瑰皰病毒屬的一個病毒新種——豬玫瑰疹病毒(porcine roseolovirus)。
[Abstract]:In order to identify the characteristics of PCMV DPOL gene of porcine cytomegalovirus (PCMV) Fujian strain PCMV-FJ01 strain, a primer design software Oligo 7.0 was used to design primers for DPOL gene based on the sequence characteristics of PCMV DPOL gene in GenBank database. The nucleic acid DNA of PCMV-FJ01 strain was used as template. It was amplified by segmental PCR. The fragment amplified product was recovered by gel recovery kit and cloned and sequenced. The sequence of DPOL gene of PCMV-FJ01 strain was sequenced and analyzed by bioinformatics. The results showed that the total length of DPOL gene of PCMV-FJ01 strain was 3 021 BP, encoding 1 006 amino acids, and the nucleotide and amino acid homology between PCMV-FJ01 strain and PCMV isolate was 98.7% and 99.1%, respectively. Genetic evolution analysis showed that the DPOL gene was closer to the representative strain of Rosa in genetic evolution compared with other representative strains of cytomegalovirus. According to the genetic and evolutionary characteristics of PCMV DPOL gene, it is suggested that it be classified as porcine roseolovirusa, a new virus species of Rosa genus.
【作者單位】： 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所福建省畜禽疫病防治工程技術(shù)研究中心;福安市動物疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：福建省屬公益類科研院所基本科研專項(2014R1023-13、2014R1023-16)
【分類號】：S852.651

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1785936