本文選題：中國(guó)地方豬 + 線粒體DNA　； 參考：《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年08期

【摘要】：為從分子水平上探究中國(guó)地方豬種遺傳多樣性和分類地位,本試驗(yàn)采用生物信息學(xué)方法比較了6個(gè)類型共22個(gè)中國(guó)地方豬種的線粒體基因組全序列,分析了其多態(tài)性,并構(gòu)建了6個(gè)類型豬種線粒體D-loop區(qū)單倍型的網(wǎng)絡(luò)中介圖以及基于線粒體D-loop序列、Cytb基因、完整編碼區(qū)序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果表明,6個(gè)類型22個(gè)豬種中共檢測(cè)到了144個(gè)多態(tài)位點(diǎn),22種單倍型,說(shuō)明地方豬種具有豐富的遺傳多樣性;地方豬線粒體基因組序列中核苷酸變異以轉(zhuǎn)換為主,且Ti/Tv大于轉(zhuǎn)換/顛換比臨界值(2.0),變異位點(diǎn)均符合中性突變。6個(gè)類型豬種間遺傳距離均較小,且有共享單倍型。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)結(jié)果表明,6種類型地方豬種主要聚為兩個(gè)支系。表明線粒體D-loop序列及Cytb基因均可作為研究種內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育、起源進(jìn)化的分子標(biāo)記。
[Abstract]:In order to explore the genetic diversity and taxonomic status of Chinese local pig breeds at the molecular level, the total mitochondrial genome sequences of 6 types of 22 local Chinese pigs were compared and their polymorphisms were analyzed by bioinformatics. The network intermediary map of mitochondrial D-loop haplotype and phylogenetic tree based on mitochondrial D-loop gene and complete coding region were constructed in 6 pig breeds. The results showed that a total of 144 polymorphic loci and 22 haplotypes were detected in 22 pig breeds of 6 types, indicating that local pig breeds have abundant genetic diversity, and that the nucleotide variation in mitochondrial genome sequence of local pigs is dominated by transformation. The Ti/Tv was larger than the critical value of the conversion / transversion ratio, and the mutation sites were all in accordance with neutral mutation. The genetic distances among the six types of pigs were smaller and shared haplotypes. Phylogenetic tree results showed that six local pig breeds were mainly clustered into two branches. The results showed that mitochondrial D-loop sequence and Cytb gene could be used as molecular markers to study the phylogeny and evolution of intraspecific phylogeny.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;國(guó)家北方山區(qū)農(nóng)業(yè)工程技術(shù)研究中心;河北省山區(qū)農(nóng)業(yè)工程技術(shù)研究中心;河北工程大學(xué)生命科學(xué)與食品工程學(xué)院;
【基金】：河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)(HBCT2013070202)
【分類號(hào)】：S828

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王希彪;不應(yīng)把地方豬種說(shuō)成“劣種”[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2001年05期

2 胡友根;地方豬種開(kāi)發(fā)利用求生存[J];上海畜牧獸醫(yī)通訊;2002年01期

3 魏述東,曹洪防;中國(guó)優(yōu)良地方豬種——萊蕪豬[J];農(nóng)村百事通;2004年08期

4 魏述東,曹洪防;中國(guó)優(yōu)良地方豬種——萊蕪豬[J];河北畜牧獸醫(yī);2004年06期

5 張永泰;應(yīng)重視保持和利用我國(guó)地方豬種的肉質(zhì)優(yōu)勢(shì)[J];養(yǎng)豬;2005年02期

6 老兵;;全國(guó)地方豬種保護(hù)和利用協(xié)作組第三次年會(huì)暨學(xué)術(shù)研討會(huì)于11月15～16日在江西省玉山縣召開(kāi)[J];養(yǎng)豬;2005年06期

7 王林云;曾勇慶;高勤學(xué);談?dòng)浪?周波;劉梅;黃瑞華;;對(duì)我國(guó)地方豬種若干特性的分子生物學(xué)研究[J];畜禽業(yè);2006年01期

8 王天喜;嚴(yán)達(dá)偉;譚鴻明;袁躍云;楊榮昆;連林生;;地方豬種在云南養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)中作用的調(diào)研報(bào)告[J];養(yǎng)豬;2006年01期

9 羅明;;地方豬種商機(jī)何在[J];豬業(yè)科學(xué);2006年04期

10 張偉力;朱建和;;論中國(guó)地方豬種優(yōu)良肉質(zhì)的形成因素[J];養(yǎng)豬;2006年06期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 連林生;;中國(guó)地方豬種的保種及開(kāi)發(fā)[A];《2010中國(guó)豬業(yè)進(jìn)展》論文集[C];2010年

2 黃瑞華;;地方豬種資源保護(hù)與利用協(xié)作組的成立與活動(dòng)[A];養(yǎng)豬三十年記——紀(jì)念中國(guó)改革開(kāi)放養(yǎng)豬30年文集（1978-2007）[C];2010年

3 經(jīng)榮斌;;江蘇省地方豬種的保存和選育的演變[A];養(yǎng)豬三十年記——紀(jì)念中國(guó)改革開(kāi)放養(yǎng)豬30年文集（1978-2007）[C];2010年

4 尚麗娟;邊連全;劉顯軍;陳靜;王胤;;遼寧地方豬種間肉質(zhì)的分析[A];第八屆沈陽(yáng)科學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2011年

5 張永泰;;中國(guó)地方豬種的肉質(zhì)優(yōu)勢(shì)[A];2004東北養(yǎng)豬研究會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2004年

6 連林生;嚴(yán)達(dá)偉;;地方豬種可持續(xù)利用探討[A];第一屆中國(guó)養(yǎng)豬生產(chǎn)和疾病控制技術(shù)大會(huì)——2005中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年

7 羅明;;地方豬種保種時(shí)要重視生活環(huán)境的影響[A];全國(guó)畜禽遺傳資源保護(hù)與利用學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2005年

8 趙連生;;我國(guó)地方豬種在產(chǎn)業(yè)化發(fā)展中的作用[A];中國(guó)豬業(yè)發(fā)展大會(huì)暨中國(guó)畜牧業(yè)協(xié)會(huì)豬業(yè)分會(huì)第二屆會(huì)員代表大會(huì)論文集[C];2007年

9 N惪，

本文編號(hào)：1784758