本文選題：中國地方豬 + 線粒體DNA�。� 參考：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年08期

【摘要】：為從分子水平上探究中國地方豬種遺傳多樣性和分類地位,本試驗采用生物信息學方法比較了6個類型共22個中國地方豬種的線粒體基因組全序列,分析了其多態(tài)性,并構(gòu)建了6個類型豬種線粒體D-loop區(qū)單倍型的網(wǎng)絡(luò)中介圖以及基于線粒體D-loop序列、Cytb基因、完整編碼區(qū)序列的系統(tǒng)進化樹。結(jié)果表明,6個類型22個豬種中共檢測到了144個多態(tài)位點,22種單倍型,說明地方豬種具有豐富的遺傳多樣性;地方豬線粒體基因組序列中核苷酸變異以轉(zhuǎn)換為主,且Ti/Tv大于轉(zhuǎn)換/顛換比臨界值(2.0),變異位點均符合中性突變。6個類型豬種間遺傳距離均較小,且有共享單倍型。系統(tǒng)進化樹結(jié)果表明,6種類型地方豬種主要聚為兩個支系。表明線粒體D-loop序列及Cytb基因均可作為研究種內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育、起源進化的分子標記。
[Abstract]:In order to explore the genetic diversity and taxonomic status of Chinese local pig breeds at the molecular level, the total mitochondrial genome sequences of 6 types of 22 local Chinese pigs were compared and their polymorphisms were analyzed by bioinformatics. The network intermediary map of mitochondrial D-loop haplotype and phylogenetic tree based on mitochondrial D-loop gene and complete coding region were constructed in 6 pig breeds. The results showed that a total of 144 polymorphic loci and 22 haplotypes were detected in 22 pig breeds of 6 types, indicating that local pig breeds have abundant genetic diversity, and that the nucleotide variation in mitochondrial genome sequence of local pigs is dominated by transformation. The Ti/Tv was larger than the critical value of the conversion / transversion ratio, and the mutation sites were all in accordance with neutral mutation. The genetic distances among the six types of pigs were smaller and shared haplotypes. Phylogenetic tree results showed that six local pig breeds were mainly clustered into two branches. The results showed that mitochondrial D-loop sequence and Cytb gene could be used as molecular markers to study the phylogeny and evolution of intraspecific phylogeny.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學動物科技學院;國家北方山區(qū)農(nóng)業(yè)工程技術(shù)研究中心;河北省山區(qū)農(nóng)業(yè)工程技術(shù)研究中心;河北工程大學生命科學與食品工程學院;
【基金】：河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(HBCT2013070202)
【分類號】：S828

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本文編號：1784758