柔嫩艾美耳球蟲江蘇株SAG10基因的克隆及分析
本文選題:柔嫩艾美耳球蟲 + SAG基因。 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年03期
【摘要】:根據(jù)Gen Bank中已發(fā)表的柔嫩艾美耳球蟲(Eimeria tenella)SAG10基因序列,利用計算機(jī)軟件設(shè)計1對引物,從E.tenella江蘇株的第2代裂殖子中成功克隆出SAG10基因。將該基因與Gen Bank中國內(nèi)外不同E.tenella分離株的SAG10基因進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)E.tenella江蘇株與北京株的SAG10基因同源性最高,高達(dá)99%,其后依次為楊凌株、豪頓株。4種不同分離株SAG10基因的ORF之間有11個堿基不同,其中3個為無義突變,8個為有義突變。分析4種分離株SAG10基因推導(dǎo)蛋白質(zhì)的親水性、抗原指數(shù)、表面可及性發(fā)現(xiàn),國內(nèi)外不同E.tenella分離株SAG10蛋白的抗原性總體比較接近且很強(qiáng),但國內(nèi)不同分離株之間的抗原性更加接近,并優(yōu)于國外的豪頓株,這可能是由于氨基酸突變引起蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和親水性等發(fā)生變化而引起。將上述SAG10基因序列與復(fù)頂門原蟲的其他相關(guān)SAGs基因序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)Eimeria屬球蟲SAGs基因之間相對比較保守,且與犬新孢子蟲(Neospora caninum)、N.hughesi、剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)的SAG基因之間同源性較低,與已有觀點一致;但神經(jīng)肉孢子蟲(Sarcocystis neurona)的2條SAG1基因序列卻與E.tenella的SAG1基因序列表現(xiàn)出更高的同源性,這與其他研究結(jié)論不符。
[Abstract]:According to the published sequence of Eimeria tenella)SAG10 gene of Eimeria tenella in Gen Bank, a pair of primers were designed by computer software to clone SAG10 gene from the second generation merozoite of E.tenella Jiangsu strain.Comparing this gene with SAG10 gene of different E.tenella isolates of Gen Bank in China, we found that the homology of SAG10 gene between E.tenella Jiangsu strain and Beijing strain was the highest, up to 99%, followed by Yang Ling strain.There were 11 different bases in ORF of SAG10 gene in 4 strains of Haoton strain, of which 3 were nonsense mutations and 8 were semantic mutations.By analyzing the hydrophilicity, antigen index and surface accessibility of four SAG10 gene derived proteins, it was found that the antigenicity of SAG10 proteins of different E.tenella isolates at home and abroad was similar and strong.However, the antigenicity of different isolates in China is closer and better than that of overseas Haoton strains, which may be due to the changes in the spatial conformation and hydrophilicity of proteins caused by amino acid mutations.The genetic evolution analysis of the SAG10 gene sequence and other related SAGs gene sequences of protozoa was carried out. It was found that the SAGs gene of Eimeria belongs to coccidia was relatively conserved.The SAG gene of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii) and Neospora caninatum (N. hughesii) had low homology, but the two SAG1 genes of Sarcocystis neuronashowed higher homology with E.tenella SAG1 gene.This is inconsistent with other studies.
【作者單位】: 南通出入境檢驗檢疫局;南通大學(xué)實驗動物中心;江蘇省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(編號:31301926) 江蘇省自然科學(xué)基金(編號:BK20130388)
【分類號】:S852.7
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,本文編號:1772848
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