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鴨疫里默氏桿菌AS87-01740基因生物信息學(xué)分析及其原核表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2018-04-16 03:31

  本文選題:鴨疫里默氏桿菌 + AS-基因。 參考:《南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》2017年11期


【摘要】:【目的】了解鴨疫里默氏桿菌AS87-01740基因分子生物學(xué)特性,確定其編碼蛋白抗原性,為鴨疫里默氏桿菌亞單位疫苗研發(fā)提供新的靶標(biāo)抗原選擇!痉椒ā坎捎肞CR克隆鴨疫里默氏桿菌AS87-01740基因,以DNASTAR和NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)分別進(jìn)行基因生物信息學(xué)分析;利用p Cold-TF原核表達(dá)載體在大腸桿菌BL21感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),并分別以SDS-PAGE和Western blotting檢測(cè)融合蛋白的表達(dá)形式及其抗原特異性!窘Y(jié)果】從鴨疫里默氏桿菌基因組擴(kuò)增獲得的AS87-01740基因編碼框全長(zhǎng)618 bp,編碼205個(gè)氨基酸,理論分子量約21.87 kD,理論等電點(diǎn)(p I)8.2,正電荷氨基酸總數(shù)17個(gè),負(fù)電荷氨基酸總數(shù)16個(gè)。AS87-01740蛋白序列在同種屬分離株中,與2型血清型分離株(11845、YM、GD和CH-2)有很高的相似性(99%),與1型血清型分離株(CH-1和CH-3)的相似性為92%;在不同種屬中,與金黃桿菌(Chryseobacterium sp.)、動(dòng)物潰瘍伯格菌(Bergeyella zoohelcum)和腦膜炎敗血伊麗莎白菌(Elizabethkingia meningosepticum)的相似性分別為61%、60%和57%。經(jīng)異丙基硫代-β-D半乳糖苷(IPTG)誘導(dǎo)表達(dá)獲得的融合蛋白分子量約77 kD,以可溶性表達(dá)形式為主。Western blotting檢測(cè)結(jié)果表明,融合蛋白能與鴨疫里默氏桿菌陽性血清發(fā)生特異性免疫反應(yīng)。【結(jié)論】AS87-01740基因編碼蛋白在不同鴨疫里默氏桿菌分離株中具有很高的保守性,且能與其陽性血清發(fā)生特異性免疫反應(yīng),是研發(fā)鴨疫里默氏桿菌疫苗的潛在抗原。
[Abstract]:[objective] to understand the molecular biological characteristics of the AS87-01740 gene of Riemer Duck, and to determine the antigenicity of its encoded protein.[methods] PCR was used to clone the AS87-01740 gene of Riemer's disease, and the gene bioinformatics analysis was carried out by DNASTAR and NCBI database.The expression of p Cold-TF was induced in Escherichia coli BL21 receptive cells by using prokaryotic expression vector.The expression and antigen specificity of the fusion protein were detected by SDS-PAGE and Western blotting, respectively. [results] the full length of AS87-01740 gene encoding 205 amino acids was obtained by amplification from the genome of Riemer's disease.The theoretical molecular weight is about 21.87 KD, the theoretical isoelectric point is 8.2, the total number of positively charged amino acids is 17, and the total number of negatively charged amino acids is 16. AS87-01740 protein sequences are in the same species.There was a high similarity with serotype 2 isolates 11845YMN GD and CH-2, and the similarity with serotype 1 isolates CH-1 and CH-3 was 92.In different species,The similarity with Chryseobacterium sp., Bergeyella zoohelcumum and Elizabeth septicum were 61% and 57%, respectively.The molecular weight of the fusion protein induced by isopropylthiothio- 尾 -D galactoside (IPTG) was about 77kD.Western blotting analysis showed that the fusion protein was mainly expressed in soluble form.The fusion protein can react specifically with the positive serum of Riemer pestis. [conclusion] the AS87-01740 gene encoding protein is highly conserved in different isolates of Riemer's disease.It is a potential antigen for the development of Riemer's disease vaccine.
【作者單位】: 廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31272591) 上海市科技興農(nóng)計(jì)劃項(xiàng)目(2016HNG4-1) 中央級(jí)公益性科研院所科研基金項(xiàng)目(2017JB12)
【分類號(hào)】:S852.61

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本文編號(hào):1757126

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