本文選題：豬繁殖與呼吸綜合征病毒 + 基因型��； 參考：《中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年07期

【摘要】：2016年,本實(shí)驗(yàn)室共檢測(cè)到3株基因1型(歐洲型)豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV),分別命名為ZD1株、WK14株和WG9株,本研究對(duì)3株P(guān)RRSV進(jìn)行了全基因組序列分析。遺傳演化分析顯示,3株P(guān)RRSV均屬于基因1型I亞型,與基因1型代表株LV的核苷酸同源性為88.7%~88.9%,與基因2型代表株VR2332的核苷酸同源性為60.7%~60.8%。ORF3與ORF4推導(dǎo)氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,ZD1株的ORF3提前26個(gè)氨基酸(aa)終止,這是首次報(bào)道基因1型PRRSV編碼的結(jié)構(gòu)蛋白存在提前終止現(xiàn)象,WK14株與WG9株在ORF3的245位存在1個(gè)氨基酸的缺失;3株P(guān)RRSV在ORF4的66位皆存在1個(gè)氨基酸的缺失。Simplot生物學(xué)重組軟件分析表明,WK14株為重組病毒,供體病毒株為BJEU06-1,提供重組片段的病毒株為NVDC-FJ,重組位置位于第931~3 379位堿基處。ZD1株和WG9株未發(fā)現(xiàn)重組現(xiàn)象。本研究發(fā)現(xiàn)我國(guó)歐洲型PRRSV基因組在缺失、重組等方面正發(fā)生一些新的變化,有必要對(duì)該類病毒進(jìn)行持續(xù)監(jiān)測(cè)和深入研究。
[Abstract]:In 2016, three strains of porcine reproductive and respiratory syndrome virus type 1 (European type), named ZD1 strain WK14 and WG9 strain, were detected in our laboratory. Three PRRSV strains were sequenced.Genetic evolution analysis showed that all three PRRSV strains belonged to subtype I of gene 1.The nucleotide homology with LV, the representative strain of gene 1, was 88.788. 9, and the nucleotide homology with VR2332 of genotype 2 was the deduced amino acid sequence of 60.7%~60.8%.ORF3 and ORF4. The results showed that the ORF3 of ZD1 strain terminated ahead of 26 amino acids (aaa).This is the first time to report the early termination of structural proteins encoded by type 1 PRRSV and the presence of 1 amino acid deletion in ORF3 of WK14 strain and WG9 strain. 3 strains of PRRSV have 1 amino acid deletion in ORF4. The biological weight of Simplot is 1 amino acid deletion in ORF4.Group software analysis showed that WK14 strain was a recombinant virus.The donor strain was BJEU06-1, and the recombinant fragment was NVDC-FJ. The recombinant site was located at the 931t3379bp. ZD1 strain and WG9 strain had no recombination phenomenon.In this study, we found that some new changes are taking place in the deletion and recombination of the European PRRSV genome in China. It is necessary to continuously monitor and further study this kind of virus.
【作者單位】： 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所;山東信得生物科技有限公司;南陽(yáng)師范學(xué)院;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31270045、31502097)
【分類號(hào)】：S852.651

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本文編號(hào)：1733715