本文選題：豬圓環(huán)病毒型　切入點：全基因組　出處：《中國獸醫(yī)學(xué)報》2017年08期

【摘要】：為了進一步研究山西豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)的遺傳變異多樣性情況,對山西2013—2016年間分離的9株豬圓環(huán)病毒流行株(SXQX、SXCZ、SXJC、SXJX、SXLL、SXPY、SXPG、SXXY、SXTY2株)的全基因組進行了擴增、克隆和測序,已收錄入GenBank中。并將其全基因序列、ORF2序列和推導(dǎo)出的Cap蛋白氨基酸序列與不同國家和地區(qū)的28株主要流行株進行了遺傳變異多樣性分析,結(jié)果顯示:9株P(guān)CV2山西流行株全基因組核酸序列全長SXJX、SXXY、SXJC株為1 768bp,其余均為1 767bp,分別約占33%和67%。9株P(guān)CV2流行株之間核苷酸同源性為94.7%~99.8%,與國內(nèi)外28株參考株同源性為93.9%~99.9%,與國產(chǎn)疫苗株同源性(LG、DBN-SXO7-2、SH株)為95.1%~99.8%;PCV2全基因組序列的進化分析表明:本試驗分離的SXJX、SXJC、SXXY株屬于PCV2a亞型的2D亞群,SXLL、SXPY、SXCZ株屬于PCV2b亞型的1C亞群,SXTY14、SXQX、SXPG株屬于PCV2b亞型的1A/1B亞群,可見近幾年,山西PCV2流行株以PCV-2b亞型為主。分離的9株P(guān)CV2的ORF2之間核苷酸和Cap蛋白氨基酸同源性分別為90.0%~100.0%和87.1%~100.0%,與28株參考株之間核苷酸和氨基酸同源性分別為87.6%~100.0%和84.1%~100.0%,與國產(chǎn)疫苗株核苷酸同源性和氨基酸同源性分別為91.0%~100.0%和89.3%~100.0%,同源性都較高。9株分離株中,有6株分離株(SXQX、SXTY14、SXPG、SXXY、SXJC、SXJX)Cap蛋白氨基酸為233個,其中SXQX、SXTY14、SXPG株的ORF2位于1 033~1 734bp,SXXY、SXJC、SXJX株的ORF2位于1 034~1 735bp,3株分離株(SXCZ、SXLL、SXPY)Cap蛋白氨基酸為234個,其ORF2位于1 030~1 734bp,而與其他基因組序列為1 767bp分離株的ORF2相比,1 030~1 734bp位置多了3個堿基TCA,導(dǎo)致其氨基酸序列在234位置增加1個K(Lys)。另外還發(fā)現(xiàn)9株P(guān)CV2Cap蛋白除了唯一糖基化位點(NYS)(第143~145位氨基酸)呈高度保守外,還存在較多的氨基酸變異,這為山西地區(qū)PCV2的免疫預(yù)防等的研究提供理論依據(jù),并為深入開展PCV2的分子致病機理提供基礎(chǔ)理論數(shù)據(jù)。
[Abstract]:涓轟簡榪涗竴姝ョ爺絀跺北瑗跨尓鍦嗙幆鐥呮瘨2鍨，

本文編號：1709211