牦牛體外成熟卵母細(xì)胞差異轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2018-04-04 01:13
本文選題:牦牛 切入點(diǎn):卵母細(xì)胞 出處:《中國科學(xué):生命科學(xué)》2017年10期
【摘要】:卵母細(xì)胞體外成熟環(huán)節(jié)是現(xiàn)代繁殖育種技術(shù)的基礎(chǔ)環(huán)節(jié),體外成熟的MⅡ期卵母細(xì)胞的質(zhì)量直接影響了卵母細(xì)胞的后續(xù)受精及受精卵卵裂.由于卵母細(xì)胞的發(fā)育成熟是一個(gè)涉及大量基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的復(fù)雜過程.因此,轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究是了解卵母細(xì)胞發(fā)生發(fā)育的關(guān)鍵.本研究以高海拔地區(qū)的特有牛屬動(dòng)物牦牛(Bos grunniens)卵母細(xì)胞作為研究對象,應(yīng)用RNA-seq技術(shù)對牦牛GV期卵母細(xì)胞及體外成熟MⅡ期卵母進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序及比對分析.經(jīng)深度測序后,各獲得一個(gè)包含51380686條過濾測序序列(cleanreads),4624261740堿基(bp)的GV期牦牛卵母細(xì)胞測序文庫和一個(gè)包含50303412條過濾測序序列(clean reads),4527307080堿基(bp)的MⅡ期牦牛卵母細(xì)胞測序文庫.基因覆蓋率統(tǒng)計(jì)表明,GV期和MⅡ期文庫中分別有16719條和16339條牦;虻玫睫D(zhuǎn)錄.通過比較分析MⅡ和GV期轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),共篩選出4767個(gè)差異表達(dá)基因,其中1418個(gè)基因表達(dá)量上調(diào)和3349個(gè)基因表達(dá)量下調(diào).GO功能分類注釋顯示,差異基因與"代謝過程"等生物學(xué)過程存在密切關(guān)聯(lián),同時(shí)結(jié)合分子功能相關(guān)類別等分子事件表現(xiàn)活躍.按表達(dá)量上調(diào)和下調(diào)分別對差異基因進(jìn)行KEGG通路互作分析,結(jié)果表明,凋亡通路、內(nèi)吞通路及代謝通路是上調(diào)的關(guān)鍵調(diào)控通路,而代謝通路、丙酮酸代謝、黏著斑及氧化磷酸化是下調(diào)的關(guān)鍵調(diào)控通路,其中代謝通路在上調(diào)及下調(diào)通路互作中均起關(guān)鍵調(diào)控作用.進(jìn)一步對代謝通路進(jìn)行分析,結(jié)果表明,組氨酸代謝、甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝、乙醛酸和二羧酸代謝及谷胱甘肽代謝是整個(gè)代謝通路的關(guān)鍵調(diào)控節(jié)點(diǎn)。此外,本研究發(fā)現(xiàn),在牦牛卵母細(xì)胞體外成熟過程中,與免疫相關(guān)的白細(xì)胞介素家族及干擾素家族基因發(fā)生了顯著差異表達(dá).該研究結(jié)果為進(jìn)一步解析牦牛卵母細(xì)胞發(fā)育的分子機(jī)制及全面了解牦牛繁殖的特異性提供了基礎(chǔ).
[Abstract]:The in vitro maturation of oocytes is the basic link of modern breeding techniques. The quality of matured M 鈪,
本文編號(hào):1707722
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