2013年廣西分離株H9N2亞型禽流感病毒全基因組特性分析
本文選題:HN禽流感病毒 切入點(diǎn):HN禽流感病毒 出處:《中國(guó)病原生物學(xué)雜志》2017年01期
【摘要】:目的對(duì)2013年從廣西分離的H9N2亞型禽流感病毒進(jìn)行全基因測(cè)序,并分析其基因組和遺傳進(jìn)化特性,為進(jìn)一步研究H9N2禽流感病毒的致病機(jī)制提供科學(xué)依據(jù)。方法運(yùn)用RT-PCR方法克隆廣西分離株H9N2亞型禽流感病毒8個(gè)基因片段,進(jìn)行全基因測(cè)序,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行序列比對(duì)和遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果序列比對(duì)分析表明,H9N2亞型分離株的HA序列裂解位點(diǎn)為RSSR↓GLF,受體結(jié)合位點(diǎn)為YWTNKLY且發(fā)生Q226G和G228R雙重位點(diǎn)突變,NA耐藥相關(guān)位點(diǎn)發(fā)生3處突變(E119V,R292W和R294G),M2蛋白跨膜區(qū)存在S31N變異;編碼內(nèi)部蛋白的6個(gè)基因與同年H7N9亞型分離株相似度為90.9%~97.6%。其分子遺傳進(jìn)化關(guān)系屬于歐亞種系,其中HA基因?qū)儆赮280亞系,M基因?qū)儆贕1亞系,PB2基因?qū)儆贙orea亞系,PB1、PA、NA、NP和NS屬于SH/F/98亞系。結(jié)論2013年廣西分離株是由4種不同H9N2亞型禽流感病毒亞系發(fā)生自然重排的產(chǎn)物,屬于低致病性禽流感病毒,但對(duì)抗流感藥物存在一定耐藥性,故應(yīng)加強(qiáng)對(duì)禽農(nóng)場(chǎng)中H9N2病毒流行株變異趨勢(shì)和傳播風(fēng)險(xiǎn)的監(jiān)測(cè)。
[Abstract]:Objective to sequence the whole gene of H9N2 subtype avian influenza virus isolated from Guangxi in 2013 and analyze its genome and genetic evolution characteristics. Methods eight gene fragments of H9N2 subtype avian influenza virus isolated from Guangxi were cloned by RT-PCR method and sequenced. Sequence alignment and genetic evolution analysis showed that the HA cleavage site of H9N2 subtype isolate was RSSR. 鈫揋LF, the receptor binding site was YWTNKLY and the Q226G and G228R double loci mutation and na resistance-related sites were found. There were S31N mutations in the transmembrane region of E119V, R292W and R294GUM 2 protein. The similarity between the six genes encoding the internal protein and the H7N9 subtype isolates of the same year is 90.90.97. 6. The molecular genetic evolution of these genes belongs to Eurasian lineage. Among them, HA gene belongs to Y280 subline, M gene belongs to G 1 subline, PB2 gene belongs to Korea subline PNA NP and NS belongs to SH/F/98 subline. Conclusion the isolated strain of Guangxi in 2013 is the product of natural rearrangement by four different H9N2 subtypes of avian influenza virus sublines. It is a low pathogenic avian influenza virus, but there is a certain drug resistance against influenza drugs, so it is necessary to strengthen the surveillance of the variation trend and transmission risk of H9N2 virus in poultry farms.
【作者單位】: 長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué);軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所;廣西動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31402175) 吉林省科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(No.20130522090JH)
【分類(lèi)號(hào)】:S852.65
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 周鴻飛;禽流感病毒真面目[J];光明中醫(yī);2004年01期
2 ;禽流感病毒分布有明顯的地域性相關(guān)[J];山東家禽;2004年03期
3 洪水根;各國(guó)通力合作 圍剿禽流感[J];廈門(mén)科技;2004年01期
4 徐瑛;珍愛(ài)生命、關(guān)注社會(huì)、抗擊禽流感——7年級(jí)生物學(xué)課堂實(shí)錄[J];生物學(xué)通報(bào);2004年04期
5 ;低溫下的禽流感病毒能存活更長(zhǎng)時(shí)間[J];飼料與畜牧;2004年06期
6 魏秀儉,李曉鵬;禽流感病毒概述[J];聊城大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年03期
7 ;科學(xué)與禽流感之間的戰(zhàn)爭(zhēng)[J];科技資訊;2004年05期
8 ;我國(guó)禽流感病毒研究新發(fā)現(xiàn)[J];中國(guó)牧業(yè)通訊;2005年19期
9 范宗理;鴨子可擴(kuò)大禽流感病毒傳播的危險(xiǎn)性[J];自然雜志;2005年03期
10 然悠;直面禽流感[J];蘇南科技開(kāi)發(fā);2005年11期
相關(guān)會(huì)議論文 前10條
1 孫曉林;;禽流感和公共衛(wèi)生[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)病理學(xué)分第12次暨中國(guó)動(dòng)物病理生理學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì)第11次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2003年
2 何義林;葉冬青;;禽流感病毒對(duì)人類(lèi)感染機(jī)制的研究進(jìn)展[A];第二屆全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年
3 春陽(yáng);李東;;再論“以科學(xué)發(fā)展觀應(yīng)對(duì)禽流感事件”——評(píng)禽流感病毒變種兩次恐慌論[A];首屆中國(guó)黃羽肉雞行業(yè)發(fā)展大會(huì)會(huì)刊[C];2008年
4 鄧潔麗;段明星;俞初一;江龍;;聚聯(lián)乙炔有序組裝體在識(shí)別禽流感病毒方面的應(yīng)用研究[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第十二屆膠體與界面化學(xué)會(huì)議論文摘要集[C];2009年
5 孫恩澤;謝敏;趙海粟;黃碧海;劉書(shū)琳;張萬(wàn)坡;張志凌;王漢中;龐代文;;量子點(diǎn)標(biāo)記禽流感病毒[A];第六屆全國(guó)化學(xué)生物學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2009年
6 黃志堅(jiān);陳強(qiáng);李清祿;王壽昆;江和基;;不同消毒劑對(duì)禽流感病毒的殺滅試驗(yàn)[A];福建省科協(xié)第八屆學(xué)術(shù)年會(huì)分會(huì)場(chǎng)“轉(zhuǎn)變飼養(yǎng)方式,促進(jìn)海西畜牧業(yè)和諧發(fā)展”學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2008年
7 周祖華;張敏;程禮明;徐彬;沈彩信;;禽流感流行趨勢(shì)分析[A];全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年
8 王志宇;張議文;劉桂林;;禽流感病毒的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第十一次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2010年
9 劉迎芳;饒子和;;禽流感病毒(H5N1)RNA聚合酶PA亞基相關(guān)三維晶體結(jié)構(gòu)與功能分析[A];第十一次中國(guó)生物物理學(xué)術(shù)大會(huì)暨第九屆全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)摘要集[C];2009年
10 韋婷;胡杰;蘭彬;陸文俊;蘇凱;覃芳蕓;;廣西暴發(fā)中低毒力禽流感情況報(bào)告[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)禽病學(xué)會(huì)分會(huì)第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2000年
相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條
1 農(nóng)業(yè)部動(dòng)物疫病診斷與流行病學(xué)中心主任 崔尚金 博士;候鳥(niǎo)發(fā)生禽流感給我們的警示[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2005年
2 莫書(shū)瑩;世衛(wèi)警告:禽流感或大流行全球經(jīng)濟(jì)應(yīng)警惕[N];第一財(cái)經(jīng)日?qǐng)?bào);2005年
3 本報(bào)記者 魏紅欣;禽流感“啄”痛全球經(jīng)濟(jì)[N];國(guó)際金融報(bào);2005年
4 本報(bào)記者 許凱;狙擊禽流感:一場(chǎng)鳥(niǎo)與人的戰(zhàn)爭(zhēng)[N];國(guó)際金融報(bào);2005年
5 新華社記者 楊?lèi)?ài)國(guó);防控禽流感需要加強(qiáng)國(guó)際合作[N];光明日?qǐng)?bào);2005年
6 李楊;禽流感疫情不會(huì)長(zhǎng)期影響農(nóng)產(chǎn)品期價(jià)[N];金融時(shí)報(bào);2005年
7 羅政、夏文輝;香港強(qiáng)化防止禽流感措施[N];人民日?qǐng)?bào)海外版;2004年
8 本報(bào)記者 張向永 趙秀芹;禽流感讓全世界手牽手[N];市場(chǎng)報(bào);2005年
9 ;禽流感病毒能否絕跡?[N];中國(guó)石油報(bào);2004年
10 何源;嚴(yán)防禽流感從境外傳入我國(guó)[N];中國(guó)食品質(zhì)量報(bào);2005年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條
1 鄒鎮(zhèn);H5N1型禽流感病毒和甲型H1N1流感病毒致急性呼吸損傷的機(jī)理研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年
2 趙蔚;基于磁分離和熒光量子點(diǎn)標(biāo)記的高靈敏禽流感病毒檢測(cè)[D];武漢大學(xué);2012年
3 區(qū)嘉賢;H7N9禽流感患者的臨床特征及預(yù)后分析[D];復(fù)旦大學(xué);2014年
4 劉三紅;禽流感的數(shù)學(xué)建模及數(shù)值模擬[D];華中師范大學(xué);2015年
5 樊兆斌;野鳥(niǎo)源禽流感病毒(AIV)分離株的遺傳進(jìn)化及其致病性研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2014年
6 桑曉宇;H9N2亞型禽流感病毒在豚鼠模型中水平傳播的分子機(jī)制研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年
7 楊文濤;靶向樹(shù)突狀細(xì)胞通用型禽流感病毒重組乳酸菌的研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
8 石霖;北方某省主要亞型禽流感現(xiàn)地調(diào)查分析及RT-LAMP檢測(cè)方法研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
9 張曉劍;HA蛋白糖基化修飾對(duì)H5N1亞型禽流感病毒復(fù)制、致病性和抗原性的影響[D];揚(yáng)州大學(xué);2014年
10 朱聞斐;H7N9禽流感病毒致病與傳播機(jī)制研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2015年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 高曉龍;2014年度中國(guó)東部候鳥(niǎo)禽流感病毒分離與鑒定[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年
2 徐曉龍;H5和H7亞型禽流感病毒熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年
3 韓苗苗;一類(lèi)人畜共患的禽流感傳染病傳播模型[D];大連理工大學(xué);2015年
4 王秋珍;H9N2禽流感病毒NS1蛋白誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激促進(jìn)DF-1細(xì)胞凋亡[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
5 梁威;5株H9N2亞型AIV血凝素結(jié)構(gòu)分析及感染A549細(xì)胞的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
6 劉媛媛;MDCK細(xì)胞表達(dá)雞ST3GAL I基因?qū)9亞型禽流感病毒增殖情況的影響[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
7 孟芳;H9N2亞型禽流感HA基因演化及其內(nèi)部基因在H5N2亞型流感病毒演化中的作用[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
8 韓雯;山東地區(qū)H9N2禽流感流行病學(xué)調(diào)查及流行毒株分子生物學(xué)檢測(cè)[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
9 查國(guó)飛;昆蟲(chóng)細(xì)胞表達(dá)重組H5亞型禽流感HA蛋白及其免疫原性研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
10 侯群;新疆青格達(dá)湖濕地鳥(niǎo)類(lèi)中H5、H7亞型AIV和NDV流行病學(xué)監(jiān)測(cè)[D];石河子大學(xué);2015年
,本文編號(hào):1677588
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/1677588.html