廣西地方雞微衛(wèi)星位點(diǎn)LEI0258多態(tài)性研究
本文選題:廣西地方雞 切入點(diǎn):微衛(wèi)星 出處:《河南農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年11期
【摘要】:通過(guò)微衛(wèi)星位點(diǎn)LEI0258基因分型和基因測(cè)序,分析6個(gè)廣西地方雞品種的遺傳變異并構(gòu)建中介網(wǎng)絡(luò)圖,研究廣西地方雞的遺傳多樣性與分子進(jìn)化。結(jié)果表明,120份樣品經(jīng)基因分型,檢測(cè)到38個(gè)等位基因,長(zhǎng)度為181~507 bp,等位基因205出現(xiàn)的頻率最高(0.125),其次是275(0.113)、310(0.100)和251(0.067)。廣西地方雞保持著較高的遺傳多樣性水平,觀察雜合度、期望雜合度和多態(tài)信息含量分別為0.800、0.943和0.936。經(jīng)測(cè)序鑒定出39個(gè)等位基因,其中9個(gè)為首次發(fā)現(xiàn)。11個(gè)等位基因與已知的21種血清型相對(duì)應(yīng);趥(cè)翼序列變異信息的中介網(wǎng)絡(luò)圖顯示,39個(gè)等位基因分為3個(gè)進(jìn)化枝,紅原雞的部分基因存在于這些進(jìn)化枝中,提示紅原雞可能是廣西地方雞的主要祖先。
[Abstract]:The genetic variation of 6 local chicken breeds in Guangxi was analyzed by LEI0258 genotyping and gene sequencing. The genetic diversity and molecular evolution of Guangxi local chickens were studied. The results showed that 120 samples were genotyped. 38 alleles were detected, the length of which was 181 ~ 507bp. the frequency of allele 205 was the highest 0.125, followed by 2750.113C310100.100) and 251P0.0670.The local chickens in Guangxi maintained a high level of genetic diversity and observed heterozygosity. The expected heterozygosity and polymorphic information content were 0.943 and 0.936, respectively. 39 alleles were identified by sequencing. Nine of the alleles were found for the first time, and 11 alleles corresponded to 21 known serotypes. The intermediary network based on the variation information of flanking sequence showed that 39 alleles were divided into 3 evolutionary branches. Some genes of Hongyuan chicken were found in these evolutionary branches, suggesting that Red Plain chicken may be the main ancestor of Guangxi local chicken.
【作者單位】: 嘉應(yīng)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:廣東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2014A030307018) 廣東省公益研究與能力建設(shè)項(xiàng)目(2015A020208020,2016A030303068) 嘉應(yīng)學(xué)院省市共建重點(diǎn)建設(shè)項(xiàng)目(嘉院[2017]27號(hào))
【分類號(hào)】:S831.2
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