豬流行性腹瀉病毒、傳染性胃腸炎病毒和輪狀病毒多重實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測方法的建立
本文選題:傳染性胃腸炎病毒(TGEV) 切入點(diǎn):豬流行性腹瀉病毒(PEDV) 出處:《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年15期
【摘要】:為了建立一種能夠同時(shí)檢測豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、傳染性胃腸炎病毒(TGEV)和輪狀病毒(RV)的多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法,試驗(yàn)根據(jù)PEDV CV777株、TGEV Purdue P115株全基因序列和RV OSU毒株的VP6基因序列,設(shè)計(jì)出3對特異性引物及探針,優(yōu)化反應(yīng)條件,開展特異性、敏感性、重復(fù)性和驗(yàn)證試驗(yàn)。結(jié)果表明:該方法的檢測最低限為1×10~2拷貝/μL的RNA標(biāo)準(zhǔn)品或1×10~(-2)TCID_(50)/mL的疫苗毒,具有較高的敏感性;變異系數(shù)均小于10%,符合統(tǒng)計(jì)學(xué)要求;利用本試驗(yàn)所建立的方法以及商品化試劑盒對20份臨床樣品進(jìn)行檢測,符合率為100%。說明本試驗(yàn)建立的方法特異性好,敏感性高,重復(fù)性穩(wěn)定,可用于PEDV、TGEV和RV的鑒別診斷和防控。
[Abstract]:In order to establish a multiplex real-time quantitative PCR method for simultaneous detection of porcine epidemic diarrhea virus (PEDVV), transmissible gastroenteritis virus (TGEV) and rotavirus (RV), the whole gene sequence of PEDV CV777 strain TGEV Purdue P115 and the VP6 gene sequence of RV OSU strain were studied. Three pairs of specific primers and probes were designed to optimize the reaction conditions, to carry out specificity, sensitivity, repeatability and verification tests. The results showed that the detection limit of this method was 1 脳 10 ~ 2 copy / 渭 L RNA standard or 1 脳 10~(-2)TCID_(50)/mL vaccine. It has high sensitivity, the coefficient of variation is less than 10, which conforms to the statistical requirements. 20 clinical samples were detected by using the method established in this experiment and commercial kit, the coincidence rate was 100. The result shows that the method established in this experiment has good specificity. The sensitivity is high and the repeatability is stable. It can be used in the differential diagnosis and prevention and control of PEDVV TGEV and RV.
【作者單位】: 北京三元集團(tuán)畜牧獸醫(yī)總站;
【分類號(hào)】:S852.651
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本文編號(hào):1665838
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