本文選題：PRV　切入點：轉錄組　出處：《蘭州大學》2017年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：偽狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)是偽狂犬病的病原體,屬于皰疹病毒科,皰疹病毒屬。豬感染PRV后其臨床伴有發(fā)熱、流產(chǎn)和死胎等癥狀,給養(yǎng)豬業(yè)帶來嚴重的經(jīng)濟損失。轉錄組是指在一定的生長發(fā)育時期或生理條件下,細胞中所有轉錄物的總稱。目前偽狂犬病毒感染宿主細胞轉錄組學的相關研究較少。本研究對PRV感染12h(P-12)和PRV感染18h(P-18)的豬腎上皮細胞PK-15進行轉錄組測序,并對測序數(shù)據(jù)進行分析,包括測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計與評估、數(shù)據(jù)比對質量評估、基因表達水平及差異分析、InterProScan功能注釋、GO功能分析、KEGG通路分析。研究結果表明:(1)與對照組相比,感染PRV 12h后,發(fā)現(xiàn)18546個顯著差異表達轉錄本,包含17427個新轉錄本,注釋到基因組的參考基因1119個;其中17255個基因轉錄水平發(fā)生上調,1291個基因轉錄水平發(fā)生下調。同樣感染PRV18h后,發(fā)現(xiàn)47318個顯著差異表達轉錄本,包含44993個新轉錄本,注釋到基因組的參考基因2325個;其中44727個基因轉錄水平上調,2591個基因轉錄水平下調。(2)轉錄組測序后,對IRF3、STAT6和PKR進行RT-PCR驗證,結果表明IRF3基因出現(xiàn)上調,STAT6,PKR基因出現(xiàn)下調。這些研究結果為進一步了解偽狂犬病毒感染宿主細胞的作用機制提供了理論參考。自噬是調控哺乳動物蛋白質被細胞器降解的代謝途徑,大量研究表明自噬對于維持機體組織細胞和生物體內的平衡極其重要。研究表明多種病毒感染與自噬密切相關,PRV與自噬的關系目前還沒有相關的報道。本研究首先探索了PRV能否誘導自噬。我們選取了豬腎上皮細胞(PK-15)作為試驗材料,PK-15感染PRV后,對不同時間點的自噬相關蛋白LC3和p62進行檢測,發(fā)現(xiàn)p62沒有發(fā)生明顯變化;病毒感染8h后,LC3II減少;病毒感染20h后,LC3II增加。實驗結果表明,病毒感染8h時抑制自噬,病毒感染20h時促進自噬。通過對偽狂犬病毒和自噬的探究,為控制PRV感染提供了有益的參考。
[Abstract]:Pseudorabies virus (PRV) is the pathogen of pseudorabies virus (PRV), which belongs to the family Herpesviridae. After infection with PRV, pigs have clinical symptoms such as fever, abortion and stillbirth. Serious economic losses to the pig industry. Transcriptome refers to a certain period of growth or physiological conditions, At present, there are few studies on transcriptome of pseudorabies virus infected host cells. In this study, the transcriptome of porcine renal epithelial cells (PK-15) infected with PRV and PRV were sequenced and the sequencing data were analyzed. Including sequencing data statistics and evaluation, data comparison quality assessment, gene expression level and differential analysis InterProScan functional annotation go functional analysis KEGG pathway analysis. The results showed that compared with the control group, PRV infection was 12 h after infection. It was found that 18 546 differentially expressed transcripts, including 17 427 new transcripts, were annotated with 1119 reference genes in the genome, of which 17 255 genes were up-regulated and 1 221 genes were down-regulated. We found 47318 differentially expressed transcripts, including 44993 new transcripts, 2325 reference genes annotated in the genome, of which 44727 genes were up-regulated and 2591 genes were down-regulated. The transcriptome was sequenced, and IRF3mSTAT6 and PKR were verified by RT-PCR. The results showed that IRF3 gene up-regulated STAT6PKR gene down-regulation. These results provide a theoretical reference for further understanding the mechanism of pseudorabies virus infection on host cells. Autophagy is the regulation of mammalian protein stromal cells. Metabolic pathways for organ degradation, A large number of studies have shown that autophagy is extremely important in maintaining the balance between organism, tissue, cells and organisms. Studies have shown that multiple viral infections are closely related to autophagy. There is no report on the relationship between PRV and autophagy. We first explored whether PRV could induce autophagy. We selected porcine renal epithelial cells (PK-15) as experimental material to infect PRV. The detection of autophagy associated protein LC3 and p62 at different time points showed that p62 did not change significantly; the number of p62 decreased after 8h of virus infection, and the increase of LC3II increased after 20 h of virus infection. The results showed that the inhibition of autophagy was observed at 8h of viral infection. The study of pseudorabies virus and autophagy provided a useful reference for the control of PRV infection.
【學位授予單位】：蘭州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：S852.65

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 張志才;邵增務;;自噬分子機制的研究進展[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2008年01期

2 趙勇;師長宏;伍靜;張海;;自噬的形態(tài)特征及分子調控機制[J];中國比較醫(yī)學雜志;2010年10期

3 伍靜;趙勇;師長宏;張海;;自噬的形態(tài)特征及分子調控[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2010年20期

4 杜萬清;俞立;;自噬過程的晚期階段[J];中國細胞生物學學報;2011年01期

5 王光輝;;自噬與疾病[J];生物化學與生物物理進展;2012年03期

6 方夢蝶;劉波;劉偉;;自噬的分子細胞機制研究進展[J];中國細胞生物學學報;2012年04期

7 高雅;邢皓;于愛鳴;;自噬與腫瘤[J];中國科技信息;2012年14期

8 謝洪;李艷君;陳英玉;;線粒體自噬[J];中國生物化學與分子生物學報;2011年12期

9 丁渭;張玉林;陳德喜;;自噬——凋亡之后的新理念[J];中國生物化學與分子生物學報;2012年05期

10 孫鵬;宋錦寧;;高遷移率族蛋白1介導自噬發(fā)生機制的研究進展[J];中國細胞生物學學報;2013年07期

相關會議論文 前10條

1 韋雪;漆永梅;張迎梅;;鎘、活性氧自由基與自噬發(fā)生的分子機制[A];中國活性氧生物學效應學術會議論文集（第一冊）[C];2011年

2 秦正紅;粱中琴;陶陸陽;黃強;劉春風;蔣星紅;倪宏;邢春根;;自噬在細胞生存與死亡中的作用[A];中國藥理學會第九次全國會員代表大會暨全國藥理學術會議論文集[C];2007年

3 秦正紅;;自噬與腫瘤和神經(jīng)細胞生存——藥物作用的新靶位[A];全國生化與分子藥理學藥物靶點研討會論文摘要集[C];2008年

4 李芹;丁壯;;自噬功能研究進展[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜傳染病學分會第八屆全國會員代表大會暨第十五次學術研討會論文集[C];2013年

5 胡晨;張璇;滕衍斌;胡海汐;周叢照;;家蠶中自噬相關蛋白Atg8的結構研究[A];華東六省一市生物化學與分子生物學會2009年學術交流會論文摘要匯編[C];2009年

6 陳希;李民;Xiao-Ming Yin;李林潔;;通過不同途徑誘導自噬的化合物對Atg9的依賴性不同[A];細胞—生命的基礎——中國細胞生物學學會2013年全國學術大會·武漢論文摘要集[C];2013年

7 陳涓涓;敬靜;蔡元博;張俊龍;;針對活體細胞自噬行為的發(fā)光金屬配合物的設計[A];中國化學會第28屆學術年會第8分會場摘要集[C];2012年

8 寧曉潔;鐘自彪;王彥峰;付貞;葉啟發(fā);;缺血再灌注誘導小鼠肝細胞自噬[A];2013中國器官移植大會論文匯編[C];2013年

9 吳曉琦;李丹丹;鄧蓉;江山;楊芬;馮公侃;朱孝峰;;CaMKKβ磷酸化Beclin 1調控自噬及其在腫瘤治療中的作用[A];2011醫(yī)學科學前沿論壇第十二屆全國腫瘤藥理與化療學術會議論文集[C];2011年

10 周鴻雁;裴中;陳杰;申存周;錢浩;劉妍梅;冼文彪;鄭一帆;陳玲;;線粒體動力改變參與了LRRK2突變導致的自噬[A];中華醫(yī)學會第十三次全國神經(jīng)病學學術會議論文匯編[C];2010年

相關重要報紙文章 前3條

1 生命學院;俞立課題組在《科學》發(fā)文揭示自噬調控的重要機制[N];新清華;2012年

2 周飛 張粹蘭;花櫚木“自噬”可抗癌[N];廣東科技報;2011年

3 張明永;水稻自噬基因研究取得新進展[N];廣東科技報;2011年

相關博士學位論文 前10條

1 賈盛楠;轉錄因子p8調控自噬的功能研究[D];浙江大學;2015年

2 皮會豐;DNM1L蛋白介導的線粒體自噬在鎘致肝臟毒性中的作用研究[D];第三軍醫(yī)大學;2015年

3 李倩;miRNAs介導的自噬抑制在類鼻疽桿菌感染免疫逃逸中的作用機制研究[D];第三軍醫(yī)大學;2015年

4 黎炳護;激活TRPV1誘導自噬在血管平滑肌細胞泡沫化中作用及機制研究[D];第三軍醫(yī)大學;2015年

5 陳江偉;自噬在椎間盤退變中的作用及機制研究[D];上海交通大學;2014年

6 李榮榮;自噬在布比卡因肌毒性中的作用及機制研究[D];南京醫(yī)科大學;2015年

7 王維;NF-κB信號通路參與介導的自噬在高血壓大鼠心血管重構的作用研究[D];山東大學;2015年

8 劉春朋;日糧硒缺乏對雞肝臟蛋白質組學及自噬變化的影響[D];東北農業(yè)大學;2015年

9 梁蓓蓓;P53凋亡刺激蛋白ASPP2調控細胞自噬的研究[D];上海交通大學;2012年

10 袁揚;線粒體自噬的抗缺血性腦損傷作用及其調控機制研究[D];浙江大學;2016年

相關碩士學位論文 前10條

1 張帥君;PRV感染PK-15細胞轉錄組學研究及自噬相關分析[D];蘭州大學;2017年

2 匡紅;Jnk2通過smARF的降解來調控壓力誘導的線粒體自噬及組織損傷[D];浙江理工大學;2015年

3 洪永桃;自噬在類風濕關節(jié)炎滑膜成纖維細胞中的作用及甲氨蝶呤對自噬的影響[D];川北醫(yī)學院;2015年

4 李寧;自噬在嗎啡心肌保護中的作用及機制研究[D];河北聯(lián)合大學;2014年

5 劉冰;腦缺血預處理對大鼠局灶性腦缺血再灌注后自噬及凋亡的影響[D];河北聯(lián)合大學;2014年

6 王存凱;microRNA-30a-5p通過抑制自噬阻止肝星狀細胞激活[D];河北醫(yī)科大學;2015年

7 張宇程;泛素連接酶HOIL-1L在線粒體自噬中的功能與機制研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2015年

8 唐芙蓉;自噬對奶山羊雄性生殖干細胞生物學特性的影響[D];西北農林科技大學;2015年

9 陳軍童;腎損傷分子1對高糖誘導人腎小管上皮細胞自噬作用的影響[D];鄭州大學;2015年

10 包勇;Kap1在LBH589誘導的乳腺癌細胞MCF-7自噬形成中的作用[D];復旦大學;2013年

，

本文編號：1649403