本文選題：PRRSV　切入點(diǎn)：全基因組　出處：《西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：【目的】了解福建省NADC30-like PRRSV FJLY01株的分子生物學(xué)特征和遺傳演化規(guī)律,為PRRSV的防控提供參考�！痉椒ā繉�(duì)采自福建省規(guī)�；i場(chǎng)的疑似病料進(jìn)行PRRSV分離鑒定,以NADC30PRRSV毒株基因序列為參考設(shè)計(jì)并合成9對(duì)引物,分別對(duì)分離株序列進(jìn)行分段PCR擴(kuò)增,經(jīng)克隆測(cè)序后進(jìn)行序列拼接,采用MEGA 6.0軟件進(jìn)行核苷酸及氨基酸同源性比對(duì),并繪制其與其他35株毒株的系統(tǒng)遺傳進(jìn)化樹。【結(jié)果】FJLY01株基因組全長(zhǎng)為15 016bp(不包含polyA),包含10個(gè)開放閱讀框,5′-UTR長(zhǎng)190bp,3′-UTR長(zhǎng)148bp,Nsp2基因缺失393bp。Nsp2蛋白存在類似PRRSV MN184和NADC30株的131個(gè)氨基酸的缺失。核苷酸比對(duì)結(jié)果表明,FJLY01株與VR-2332、MLV RespPRRS/Repro、CH-1a和BJ-4株核苷酸的同源性為85.2%~86.3%,與JXA1、HuN4等HP-PRRSV株核苷酸的同源性為83.7%~84.1%,與MN184A、MN184B株核苷酸的同源性為87.9%~88.2%,與NADC30株核苷酸的同源性最高,為97.1%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,該毒株屬于NADC30-like毒株,與JXA1、VR2332和CH-1a的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)�！窘Y(jié)論】福建省存在NADC30-like毒株,應(yīng)該加強(qiáng)PRRSV的監(jiān)測(cè)。
[Abstract]:[Objective] to understand the molecular biology and genetic characteristics of Fujian province NADC30-like PRRSV FJLY01 strain evolution, to provide reference for PRRSV prevention and control. [Methods] collected from large-scale pig farms in Fujian province suspected disease material for isolation and identification of PRRSV gene sequence of NADC30PRRSV strain, with reference to the design and synthesis of 9 pairs of primers, respectively for isolates the sequence of segmented PCR amplification, sequencing of sequence of nucleotide and amino acid homology with MEGA 6 software, and draw it with the other 35 isolates of the phylogenetic tree. [results] the full-length genome of FJLY01 strain was 15 016bp (excluding polyA), contains 10 open reading frame 5 '-UTR -UTR 3' long 190bp, long 148bp, deletion of Nsp2 gene deletion of 393bp.Nsp2 protein has 131 amino acids like PRRSV MN184 and NADC30 strains. The nucleotide alignment results showed that FJLY01 strain and VR-23 32, MLV, RespPRRS/Repro, CH-1a and BJ-4 the nucleotide homology was 85.2%~86.3%, and JXA1, HuN4 and HP-PRRSV the nucleotide homology was 83.7%~84.1%, MN184A and MN184B, the nucleotide homology was 87.9%~88.2%, and NADC30 the nucleotide homology, phylogenetic tree analysis showed that 97.1%. strain belonged to NADC30-like strains, the and, JXA1, VR2332 and CH-1a of the relationship is far. [Conclusion] in Fujian province NADC30-like strains, should strengthen the monitoring of PRRSV.

【作者單位】： 龍巖學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院福建省家畜傳染病防治與生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室福建省生豬疫病防控工程技術(shù)研究中心;
【基金】：福建省科技廳重大專項(xiàng)專題項(xiàng)目(2014NZ0002) 福建省省屬高�？蒲姓n題(JK2015049) 福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2016J01168) 福建省科技平臺(tái)項(xiàng)目(2014N2011)
【分類號(hào)】：S852.65

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本文編號(hào)：1628945