本文選題：山羊　切入點：線粒體　出處：《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報》2017年02期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：家養(yǎng)山羊(Capra hircus)由野生山羊進化而來,我國家養(yǎng)山羊適應(yīng)性強,分布范圍廣,品種資源豐富。長期的自然選擇和人工選擇,可能會導(dǎo)致南北地區(qū)家養(yǎng)山羊遺傳多樣性及分化有一定差別。為了了解中國南部地區(qū)和西北地區(qū)家養(yǎng)山羊遺傳多樣性及其起源分化,本研究對南部地區(qū)5個家養(yǎng)山羊品種69個個體線粒體DNA D-loop區(qū)進行了測序,結(jié)合所下載的西北地區(qū)3個品種33條山羊序列進行數(shù)據(jù)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),南部地區(qū)家養(yǎng)山羊平均單倍型多樣性(haplotype diversity,Hd)和平均核苷酸多樣性(nucleotide diversity,π)分別為0.954±0.005和0.019 57±0.002 10,西北地區(qū)山羊分別為0.919±0.106和0.019 08±0.001 15;不同群體的中性檢驗Fu′s Fs值為較大負(fù)值(P0.05),離差平方和(sum of squares of deviations,SSD)與Raggedness值統(tǒng)計檢驗均差異不顯著,表明核苷酸不配對分布未偏離群體擴張模型,通過核苷酸錯配分布分析發(fā)現(xiàn),對于整個單倍型群體來說在13、37、61堿基處各有一個峰值;NJ(neighbor-joining)聚類分析指出,所有山羊序列共分為兩大支系(A支系和B支系),南部和西北地區(qū)山羊在兩支系中均有分布。結(jié)果表明,中國南部地區(qū)山羊遺傳多樣性略高于西北地區(qū)山羊群體,但較幾年前有所下降;對于整個單倍型群體以及A、B支系來說,均經(jīng)歷過群體擴張,對整個群體來說至少發(fā)生過3次擴張事件;捻角野山羊(C.aegagrus)是本研究所涉及的中國南部和西北地區(qū)家養(yǎng)山羊的野生祖先。本研究為進一步了解中國南部與西北地區(qū)山羊起源分化以及遺傳多樣性提供理論支持,并為地方山羊品種保護提供理論依據(jù)。
[Abstract]:Capra hircus, a domestic goat, evolved from wild goats. The domestic goats in China have strong adaptability, wide distribution, rich variety resources, and long-term natural and artificial selection. In order to understand the genetic diversity and origin of domestic goats in southern China and northwest China, the genetic diversity and differentiation of domestic goats may be different. In this study, 69 individual mitochondrial DNA D-loop regions of 5 domestic goat breeds in southern China were sequenced, and 33 goat sequences of 3 breeds in Northwest China were analyzed. The average haplotype diversity (Hd) and the average nucleotide diversity (蟺) were 0.954 鹵0.005 and 0.019 57 鹵0.002 10, respectively, and 0.919 鹵0.106 and 0.019 08 鹵15 in the northwest region, respectively. The sum of difference square and sum of squares of deviations SSDs had no significant difference with Raggedness. The results showed that the distribution of nucleotide mismatch pairs did not deviate from the population expansion model. Through the analysis of nucleotide mismatch distribution, it was found that there was a peak value of NJJ neighbor-joining for the whole haplotype population at the nucleotide 1337nighbor-joining. All the goat sequences were divided into two branches, branch A and branch B. The results showed that the genetic diversity of goats in the south and northwest of China was slightly higher than that of the goat population in the northwest of China, and the results showed that the genetic diversity of the goats in the southern part of China was slightly higher than that of the goat population in the northwestern region. For the whole haplotype population and AHB branch, the population has experienced population expansion, and at least three expansion events have taken place for the whole population. C. aegagrus is a wild ancestor of domestic goats in the south and northwest of China. This study provides theoretical support for further understanding of the origin, differentiation and genetic diversity of goats in the south and northwest of China. It also provides theoretical basis for the protection of local goat breeds.
【作者單位】： 河北北方學(xué)院動物科技學(xué)院;衡水學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：河北省教育廳高等學(xué)校科學(xué)技術(shù)研究青年基金項目(No.QN2014077)
【分類號】：S827

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1606117