本文選題：鴿圓環(huán)病毒(PiCV)　切入點：賽鴿　出處：《病毒學報》2017年05期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：鴿圓環(huán)病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是圓環(huán)病毒科的一個成員,是一種免疫抑制性病原。為了研究PiCV中國流行毒株的基因特征和遺傳進化關(guān)系,本研究應用PCR方法對江蘇省某賽鴿公棚的22份樣品進行了PiCV檢測,結(jié)果有6份樣品為陽性。采用重疊PCR技術(shù)得到一株鴿圓環(huán)病毒全基因序列,命名為JS15-1(GenBank登錄號:KX431143)�；蛐蛄蟹治霰砻�,JS15-1全長為2 034bp,包含3個主要開放閱讀框。核苷酸同源性比較結(jié)果顯示JS15-1與GenBank上登錄的其他鴿圓環(huán)病毒分離株的全基因核苷酸同源性為85.3%~97.1%,與比利時分離的Bel20株同源性最高。不同鴿圓環(huán)病毒Rep基因同源性為92.1%~96.6%,Cap基因同源性為72.2%~99.4%。全基因遺傳進化樹顯示JS15-1與之前的中國分離株處于不同的分支,而與Bel20的親緣關(guān)系最近,Rep基因進化樹顯示JS15-1與Bel20、PiCV/Japan/2010、Ita4B位于同一分支,Cap基因進化樹顯示JS15-1與Bel20處于同一分支,親緣關(guān)系最近。氨基酸序列比較發(fā)現(xiàn),JS15-1與Bel20在Rep蛋白存在6個氨基酸殘基的差異,而Cap蛋白存在1個氨基酸殘基的差異和1個氨基酸殘基的插入。研究結(jié)果表明,JS15-1極可能來源于比利時,而且發(fā)生了變異。
[Abstract]:Pigeon circovirus, a member of the family circoviridae, is an immunosuppressive pathogen. In order to study the genetic characteristics and genetic evolution of PiCV strains in China, In this study, PCR method was used to detect 22 samples from a racing pigeon shed in Jiangsu Province, and 6 samples were positive. A complete gene sequence of pigeon circovirus was obtained by overlapping PCR technique. It was named JS15-1(GenBank accession number KX4311433.The gene sequence analysis showed that the full length of JS15-1 was 2 034bp. it contained three main open reading frames. The nucleotide homology analysis showed that JS15-1 had the whole gene nucleotides with other pigeon circovirus isolates registered on GenBank. The homology of Rep gene of different pigeon circovirus was 92.1% and 92.2% 99.4% respectively. The phylogenetic tree showed that JS15-1 was in a different branch from the previous Chinese isolate. The closest phylogenetic relationship with Bel20 was that JS15-1 and Bel20 PiCVR / Japan / 2010 Ita4B were located in the same branch, and that JS15-1 and Bel20 were in the same branch. The amino acid sequence analysis showed that there were 6 amino acid residues in Rep protein between JS 15-1 and Bel20. However, the difference of one amino acid residue and the insertion of one amino acid residue in Cap protein showed that JJS15-1 probably originated from Belgium and had a variation.
【作者單位】： 南京農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學院;南京千里光生物技術(shù)有限公司;
【基金】：高校產(chǎn)學研合作創(chuàng)新項目(項目號:NAU201504-01),題目:賽鴿疾病診斷的研究與防治~~
【分類號】：S852.65

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本文編號：1565360