本文選題：豬流行性腹瀉　切入點(diǎn)：山西分離株　出處：《華北農(nóng)學(xué)報(bào)》2017年04期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了研究山西地區(qū)豬流行性腹瀉病毒ORF3基因的遺傳變異情況,2014-2015年從山西地區(qū)11個(gè)地市收集的PEDV陽性病料中擴(kuò)增到4株P(guān)EDV的ORF3基因,并進(jìn)行序列比對及遺傳分析。序列分析結(jié)果表明,4株P(guān)EDV山西分離毒株的ORF3基因與CV777毒株相比,無核苷酸插入和缺失,有部分核苷酸及氨基酸發(fā)生變異;4株P(guān)EDV山西分離毒株的ORF3基因之間核苷酸和氨基酸的同源性分別為99.6%~100.0%和98.7%~99.6%,與CV777、疫苗株CV777 truncated和attenuated DR13核苷酸同源性分別為96.6%~97.0%,90.6%,97.6%~98.1%,氨基酸同源性分別為95.1%~96.0%,88.0%,97.1%~98.1%。遺傳進(jìn)化分析結(jié)果顯示,4株P(guān)EDV山西分離毒株與12株2010-2015年我國各地方分離的毒株和2009年分離的CH/JL/09毒株親緣關(guān)系較近;與CV777、LZC、Brl/87和2個(gè)疫苗株(CV777truncated和attenuated DR13)親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
[Abstract]:In order to study the genetic variation of porcine epidemic diarrhea virus (ORF3) gene in Shanxi area, the ORF3 gene of 4 strains of PEDV was amplified from PEDV positive venereal materials collected from 11 cities in Shanxi province in 2014-2015. Sequence alignment and genetic analysis showed that there was no nucleotide insertion and deletion in the ORF3 gene of the four strains of PEDV isolated from Shanxi Province, compared with that of the CV777 strain. Nucleotide and amino acid homology among ORF3 genes of 4 strains of PEDV isolated from Shanxi province were 99.6% and 98.775%, respectively. The nucleotide homology of CV777 truncated and attenuated DR13 were 96.60.97. 0 and 97.698.698.1, respectively, and amino acids were similar to those of CV777 truncated and attenuated DR13. The genetic evolution analysis showed that four PEDV strains isolated from Shanxi Province were closely related to the 12 strains isolated from 2010 to 2015 in China and the CH/JL/09 strains isolated in 2009. The relationship is far from CV777LZC / 87 and two vaccine strains, CV777truncated and attenuated DR13.
【作者單位】： 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】：山西省科技攻關(guān)項(xiàng)目(20140311020-2-A;20150311018-3)
【分類號】：S852.651

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本文編號：1557947