本文關(guān)鍵詞： 乾華肉用美利奴羊 小尾寒羊 肌肉生長發(fā)育 mRNA mi RNA　出處：《吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：乾華肉用美利奴羊(暫定名)是吉林省正在培育的肉毛兼用型綿羊新品種,其不僅具有突出的產(chǎn)肉性能,而且還具有生產(chǎn)同質(zhì)細(xì)羊毛的特性,而小尾寒羊是吉林省乃至我國北方地區(qū)廣泛使用的肉羊生產(chǎn)母本品種。因此,揭示培育中的肉用綿羊品種與廣泛使用的地方綿羊品種在產(chǎn)肉性能方面的差異,尤其是產(chǎn)肉機(jī)制上的差異,具有極其重要的理論和實踐意義。因此,本文旨在研究綿羊培育新品種乾華肉用美利奴羊(暫定名)和地方品種小尾寒羊肉用性能差異,在此基礎(chǔ)上,鑒定綿羊肌肉組織mRNA和microRNA(miRNA)的表達(dá)譜,研究肉用性能具有顯著差異的乾華肉用美利奴羊和小尾寒羊背最長肌組織mRNA和miRNA的表達(dá)譜差異,并對二者進(jìn)行整合分析,探討mRNA和miRNA調(diào)控綿羊肌肉生長發(fā)育的調(diào)控機(jī)制。首先,對乾華肉用美利奴羊和小尾寒羊進(jìn)行屠宰性能,肉質(zhì)性狀,肌肉營養(yǎng)成分和肌肉組織學(xué)特性研究。然后,構(gòu)建兩個綿羊品種背最長肌組織mRNA文庫和miRNA文庫,利用高通量測序和生物信息學(xué)分析相結(jié)合技術(shù),對mRNA和miRNA在肌肉組織中表達(dá)模式進(jìn)行鑒定,分析兩品種綿羊肌肉組織mRNA和mi RNA的表達(dá)譜差異。在此之后,對mRNA和miRNA進(jìn)行整合分析,構(gòu)建miRNA-mRNA作用網(wǎng)絡(luò)。最后,利用qRT-PCR方法對高通量測序結(jié)果進(jìn)行了驗證,利用雙熒光酶報告基因檢測系統(tǒng)對篩選出的與肌肉生長發(fā)育相關(guān)的miRNA對其靶基因的靶向調(diào)控作用進(jìn)行了驗證。通過上述系統(tǒng)研究獲得主要研究結(jié)果如下:1.對乾華肉用美利奴羊產(chǎn)肉性能與肉質(zhì)性狀進(jìn)行了研究。結(jié)果表明,乾華肉用美利奴羊在屠宰性能方面能包括活體重、胴體重、屠宰率、凈肉率眼肌面積,肉質(zhì)性狀方面包括嫩度、失水率、煮熟率、pH值,肌肉營養(yǎng)成分方面包括蛋白質(zhì)、脂肪、水分、氨基酸和脂肪酸含量,肌肉組織學(xué)特性方面包括肌纖維直徑,均優(yōu)于小尾寒羊,兩個綿羊品種產(chǎn)肉性能具有顯著差異。2.成功構(gòu)建兩個綿羊品種肌肉組織mRNA文庫,利用高通量測序和生物信息學(xué)結(jié)合方法鑒定綿羊肌肉組織mRNA表達(dá)譜,共鑒定出960個差異表達(dá)基因,包括405個上調(diào)基因和555個下調(diào)基因。GO功能注釋和KEGG通路分析表明,差異表達(dá)基因顯著富集于252個生物過程和53條代謝通路,成功構(gòu)建GO-Tree和Pathway-network,從中篩選出與綿羊肌肉生長發(fā)育相關(guān)的差異基因,如MRFs,GXP1和STAC基因等,相關(guān)通路如代謝通路,三羧酸循環(huán),糖酵解/糖異生通路等。3.構(gòu)建了與綿羊肌肉生長發(fā)育密切相關(guān)的Gene-act-network和co-expression-network。4.利用qRT-PCR方法,驗證了9個差異表達(dá)基因在乾華肉用美利奴羊和小尾寒羊肌肉組織中的表達(dá)量,將定量結(jié)果與測序結(jié)果進(jìn)行比對,二者表達(dá)趨勢具有高度一致性結(jié)果證實了mRNA測序結(jié)果的準(zhǔn)確性。5.成功構(gòu)建兩個綿羊品種肌肉組織miRNA文庫,利用高通量測序和生物信息學(xué)結(jié)合方法鑒定綿羊肌肉組織miRNA表達(dá)譜,共鑒定出153個綿羊已知miRNA,其中152個miRNA在兩個綿羊品種肌肉組織中共表達(dá),1個miRNA僅在小尾寒羊中表達(dá);共鑒定出8067個novel miRNA。兩文庫表達(dá)譜差異表達(dá)分析結(jié)果,共鑒定出4個綿羊已知miRNA,146個novel miRNA。6.結(jié)合mRNA文庫數(shù)據(jù),分析預(yù)測篩選鑒定出4個綿羊已知miRNA的候選靶基因26個,146個novel miRNA候選靶基因8067個。GO功能注釋和KEGG通路分析表明,4個綿羊已知差異miRNA的26個候選靶基因顯著富集于86個生物過程,其中包括肌肉器官形態(tài)發(fā)生,成肌細(xì)胞遷移,細(xì)胞增殖和脂肪組織發(fā)育;顯著富集于9條代謝通路,包括碳水化合物代謝類通路,核苷酸代謝類通路和氨基酸代謝類通路。7.利用莖環(huán)qRT-PCR方法,驗證了8個差異表達(dá)miRNA在乾華肉用美利奴羊和小尾寒羊肌肉組織中的表達(dá)量,將定量結(jié)果與測序結(jié)果進(jìn)行比對,二者表達(dá)趨勢具有高度一致性,結(jié)果證實了miRNA測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。8.成功構(gòu)建綿羊肌肉組織miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),基于GO和KEGG分析,從中篩選出oar-miR-655-3p與靶基因ACSM3,oar-miR-381-5p與靶基因ABAT作為后續(xù)研究對象。利用雙熒光素酶報告基因檢測技術(shù),篩選獲得的oar-mi R-655-3p和oar-miR-381-5p進(jìn)行靶基因鑒定的研究,結(jié)果提示oar-miR-655-3p可以特異靶向結(jié)合ACSM3基因,oar-miR-381-5p可以特異靶向結(jié)合ABAT基因,說明ACSM3基因是oar-mi R-655-3p的靶基因,ABAT基因是oar-miR-381-5p的靶基因。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S826

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 夏海龍,杜振明;“無角美利奴細(xì)毛羊選育與提高”項目通過驗收[J];四川畜牧獸醫(yī);2000年11期

2 秦有;無角美利奴羊[J];新農(nóng)業(yè);2001年05期

3 薛立秋,攝并文;中國工程院劉守仁院士肉用美利奴羊選用基地在新疆揭牌[J];當(dāng)代畜牧;2002年08期

4 ;美利奴羊有養(yǎng)頭兒[J];農(nóng)民致富之友;2003年05期

5 姬愛國,劉文忠;南非肉用美利奴羊[J];畜牧獸醫(yī)科技信息;2004年08期

6 倪建宏;張賓;楊永林;劉長彬;何明祝;蒲新竹;;南非肉用美利奴羊冷凍胚胎移植[J];新疆農(nóng)墾科技;2011年02期

7 初木;無角美利奴羊[J];新農(nóng)業(yè);1990年10期

8 張德福,鄭亦輝;湖羊和美利奴羊?qū)ν庠葱源傩韵偌に蒯尫偶に孛舾行缘牟町怺J];畜牧與獸醫(yī);1990年03期

9 張德福;鄭亦輝;;湖羊多產(chǎn)的生殖內(nèi)分泌機(jī)理研究Ⅰ．湖羊和美利奴羊?qū)ν庠葱源傩韵偌に蒯尫偶に氐牟町怺J];中國養(yǎng)羊;1994年01期

10 秦有;敖秉義;單雨福;王尚寬;朱玉鐸;李恒榮;;無角美利奴羊改良細(xì)毛羊的效果[J];中國養(yǎng)羊;1995年04期

相關(guān)會議論文 前10條

1 馬惠海;趙玉民;鮑志鴻;楊豐福;楊德新;;南非肉用美利奴羊品種介紹及其前景預(yù)測[A];中國羊業(yè)進(jìn)展——首屆中國羊業(yè)發(fā)展大會會刊[C];2004年

2 馬惠海;趙玉民;鮑志鴻;楊豐福;楊德新;;南非肉用美利奴羊品種介紹及其前景預(yù)測[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)羊?qū)W分會全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會議論文集[C];2005年

3 林鵬超;秦有;馬艷菲;;無角美利奴細(xì)毛羊選育效果[A];《2008中國羊業(yè)進(jìn)展》論文集[C];2008年

4 王貴江;常建軍;;美利奴超細(xì)毛羊胚胎移植的研究[A];全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會議論文集（2007-2008）[C];2008年

5 岳耀敬;王天翔;劉建斌;郭健;李桂英;孫曉萍;李文輝;馮瑞林;牛春娥;郭婷婷;李范文;楊博輝;;高山美利奴羊新品種種質(zhì)特性初步研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)羊?qū)W分會2014年全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會議論文集[C];2014年

6 于國慶;馬艷菲;林鵬超;;無角細(xì)毛羊選育配套技術(shù)研究效果[A];2010中國羊業(yè)進(jìn)展[C];2010年

7 鄧凱東;刁其玉;姜成鋼;屠焰;張乃鋒;劉潔;馬濤;趙一廣;許貴善;;德國美利奴雜交育肥綿羊的凈能和代謝能需要量研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)羊?qū)W分會2012年全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會議論文集[C];2012年

8 曲緒仙;;小尾寒羊引種與開發(fā)利用[A];2006中國羊業(yè)進(jìn)展——第三屆中國羊業(yè)發(fā)展大會論文集[C];2006年

9 柳楠;王金文;魏敬才;田春玲;王新顏;楊永林;李晶;樊慶燦;;小尾寒羊高繁品系多胎基因檢測研究[A];《2009中國羊業(yè)進(jìn)展》論文集[C];2009年

10 曹榮峰;王繼芳;;小尾寒羊復(fù)舊期子宮平滑肌降解代謝的試驗[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜內(nèi)科學(xué)分會2009年學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2009年

相關(guān)重要報紙文章 前10條

1 ;美利奴羊的王國[N];人民日報;2003年

2 通訊員 張曉林;七十二團(tuán)母羊移植布魯拉美利奴羊胚胎[N];兵團(tuán)日報(漢);2010年

3 記者 馬杰;伊犁打造“中國第一羊”生產(chǎn)基地[N];中國紡織報;2005年

4 張麗輝;45天的羔羊做準(zhǔn)媽媽[N];河北日報;2006年

5 祝匡依 陸維斌;新疆大力發(fā)展肉用細(xì)毛羊[N];中國畜牧報;2002年

6 本報記者 崔小紅;小尾寒羊讓農(nóng)民笑得最開心[N];呼和浩特日報(漢);2005年

7 靳茂榮 杜懷國;武川縣以寒羊養(yǎng)殖帶動農(nóng)牧業(yè)產(chǎn)業(yè)化快速發(fā)展[N];呼和浩特日報(漢);2005年

8 張明偉 李根銀;引進(jìn)小尾寒羊要慎重[N];山西科技報;2003年

9 張燦東;東平整治小尾寒羊外調(diào)秩序[N];中國畜牧報;2002年

10 姜風(fēng)濤 張燦東;東平小尾寒羊走向西部[N];中國畜牧報;2003年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前9條

1 孫麗敏;乾華肉用美利奴羊與小尾寒羊肉用性能及肌肉組織mRNA-miRNA表達(dá)譜整合分析研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年

2 馬惠海;梅花鹿與美利奴羊肉用性能比較及肉質(zhì)風(fēng)味物質(zhì)同源性生成機(jī)理[D];東北林業(yè)大學(xué);2015年

3 孫福亮;新吉細(xì)毛羊和小尾寒羊的毛品質(zhì)性狀及皮膚轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D];延邊大學(xué);2016年

4 柳淑芳;小尾寒羊多胎性狀相關(guān)基因的鑒定和遺傳研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

5 曹榮峰;小尾寒羊子宮復(fù)舊的研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年

6 宋雪梅;小尾寒羊5個與繁殖和疾病抗性相關(guān)基因的克隆及比較基因組學(xué)分析[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2007年

7 張蕾;小尾寒羊骨骼肌細(xì)胞Myostatin基因打靶的研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

8 張桂山;遼寧絨山羊與乾華肉用美利奴羊皮膚毛囊miRNA篩選及靶基因驗證[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

9 葛利江;小尾寒羊妊娠中后期胎盤和子宮頸成熟的監(jiān)測[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 阮洪玲;乾華肉用美利奴羊體重體尺及相關(guān)評價指標(biāo)的研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

2 Megersa Ashenafi Getachew;PXFP2基因在青藏高原地區(qū)不同綿羊品種中的多態(tài)性研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2016年

3 劉冠卿;小尾寒羊CSRP2、CSRP3和FSTL1基因克隆、結(jié)構(gòu)特征及組織表達(dá)分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

4 倪志鶴;EM發(fā)酵小麥秸稈對小尾寒羊生產(chǎn)性能的影響及其作用機(jī)理研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

5 劉佳;飼喂方式對小尾寒羊行為及生產(chǎn)性能的影響[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

6 王曉龍;小尾寒羊ANKRD2基因的克隆、結(jié)構(gòu)特征與表達(dá)分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

7 孫艷;小尾寒羊三個慢型骨骼肌肌鈣蛋白的基因克隆、結(jié)構(gòu)特征及組織表達(dá)分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

8 邵明旭;小尾寒羊腸道正常菌群高通量測序分析及羊源微生態(tài)制劑的研制[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

9 張勝軍;綿羊發(fā)情周期內(nèi)日常行為與糞樣生殖激素變化的研究[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

10 王杰;小尾寒羊、灘羊生長性能及其主要消化生理參數(shù)的比較[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

，

本文編號：1550553