本文關(guān)鍵詞： 羊巴貝斯蟲 trap基因 基因結(jié)構(gòu) 系統(tǒng)發(fā)生樹　出處：《畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年07期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：本研究擬解析我國羊巴貝斯蟲trap基因的結(jié)構(gòu)特征,并以其為分子標(biāo)志開展遺傳進(jìn)化分析,為理清我國羊巴貝斯蟲的分類關(guān)系提供數(shù)據(jù)。用公布的巴貝斯蟲trap基因序列BLAST兩個(gè)羊巴貝斯蟲全基因組本地?cái)?shù)據(jù)庫,以獲得的保守序列片段為模板,設(shè)計(jì)PCR引物;克隆我國分離的6株羊巴貝斯蟲trap基因全長序列,分析其序列結(jié)構(gòu)特征;比對序列相似性,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,分析其遺傳進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果克隆獲得6株羊巴貝斯蟲trap基因,分析結(jié)果顯示,其具有3、4、5個(gè)內(nèi)含子的三種內(nèi)含子數(shù)目,預(yù)測的開放閱讀框(ORF)大小分別為1 944、2 100/2 142和2 286bp;氨基酸序列分析顯示,其都具有TRAP蛋白家族特征性的vWFA、TSR、跨膜域和CTD結(jié)構(gòu)域;進(jìn)化關(guān)系分析顯示,感染我國羊的巴貝斯蟲被分成3組,組內(nèi)序列相似性為99.8%~100%,而組間為43.6%~74.6%。系統(tǒng)發(fā)生樹上6株羊巴貝斯蟲被分到兩大枝,羊巴貝斯蟲未定種和莫氏巴貝斯蟲,而且莫氏巴貝斯蟲又被分成兩小枝。6株羊巴貝斯蟲trap基因結(jié)構(gòu)存在差異,但其蛋白特征性的結(jié)構(gòu)域較為保守;我國分離的羊巴貝斯蟲為兩個(gè)種,但莫氏巴貝斯蟲中可能存在兩個(gè)亞種。
[Abstract]:The aim of this study was to analyze the structural characteristics of the trap gene of Babes's worm in China and to use it as a molecular marker to carry out genetic and evolutionary analysis. To provide data for sorting out the taxonomic relationship of Babes's sheep in China, PCR primers were designed using the published BLAST gene sequence of Babes's trap gene and the local database of the whole genome of Babes's sheep, using the conserved sequence fragments as template. The full-length sequence of trap gene of six sheep Babes worm isolated from China was cloned, and its structural characteristics were analyzed. The sequence similarity was compared, the phylogenetic tree was constructed, and the genetic evolution relationship was analyzed. Results six trap genes of Babes were cloned. The results showed that there were 3 introns with 3 introns and 5 introns, and the predicted ORFs of open reading frames were 1 944C 2 100/2 142 and 2 286 BP, respectively, and the amino acid sequence analysis showed that, The vWFA-TSRs, transmembrane domain and CTD domain were all characteristic of TRAP protein family, and the evolutionary relationship analysis showed that the Babes parasites infected with Chinese sheep were divided into three groups. The similarity of the sequence in the group was 99.8% and 43.6% and 74.6%, respectively. Six sheep Babes insects were divided into two branches, Babes and Babes Mori. Moreover, the trap gene structure of Babes Mori was divided into two branchlets, but the characteristic domain of its protein was conserved, and there were two species of Babes isolated in China. But there may be two subspecies in Babes Mori.
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所/家畜疫病病原生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/甘肅省動(dòng)物寄生蟲病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973)項(xiàng)目(2015CB150300) 國家自然科學(xué)基金(31072130) 農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程(ASTIP)
【分類號(hào)】：S852.723

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1525609