發(fā)布時(shí)間：2018-02-13 04:06

  本文關(guān)鍵詞： SLA-DRA基因 煙臺(tái)黑豬 編碼區(qū) 多態(tài)性 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu) 分子進(jìn)化樹　出處：《華北農(nóng)學(xué)報(bào)》2017年01期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了探究煙臺(tái)黑豬SLA-DRA基因多態(tài)性,預(yù)測(cè)其蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)并分析功能特征,采用PCR-SSCP、克隆測(cè)序和生物信息學(xué)等方法對(duì)SLA-DRA基因4個(gè)外顯子的多態(tài)性、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)域、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行了預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果顯示:SLA-DRA基因exon 1、exon 2和exon 4共檢測(cè)到11個(gè)SNPs,導(dǎo)致7個(gè)氨基酸發(fā)生變異,exon 3沒有突變產(chǎn)生,exon 4的多態(tài)性最豐富。SLA-DRA基因編碼區(qū)759 bp核苷酸共編碼252個(gè)氨基酸和1個(gè)終止子。SLA-DRA基因蛋白質(zhì)是一種偏酸性、不穩(wěn)定、親水性蛋白質(zhì),其二級(jí)結(jié)構(gòu)是混合型,其中無(wú)規(guī)則卷曲最多。該蛋白質(zhì)含有2個(gè)免疫球蛋白結(jié)合域、2個(gè)N-糖基化位點(diǎn)和10個(gè)磷酸化位點(diǎn)。功能分析顯示:SLA-DRA基因蛋白質(zhì)在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、受體、脅迫應(yīng)答、免疫應(yīng)答、生長(zhǎng)因子等方面的幾率均較高。研究結(jié)果可為豬的抗病分子育種候選基因篩選提供理論依據(jù)。
[Abstract]:In order to investigate the polymorphism of SLA-DRA gene in Yantai Black Pig, predict its protein structure and analyze its functional characteristics, PCR-SSCP, clone sequencing and bioinformatics were used to analyze the polymorphism, physicochemical properties and domain of four exons of SLA-DRA gene. The spatial structure and function of protein were predicted and analyzed. The results showed that 11 SNPs were detected in exon 1 exon2 and exon 4 of the SLA-DRA gene, which resulted in 7 amino acids mutated without mutation to produce the polymorphism of SLA-DRA 4. The 759 BP nucleotide encoding 252 amino acids and one Terminator SLA-DRA gene protein is a partial acid. Unstable, hydrophilic proteins with mixed secondary structures, The protein contains two immunoglobulin binding domains, two N-glycosylation sites and 10 phosphorylation sites. The results can provide theoretical basis for screening candidate genes for molecular breeding of disease resistance in pigs.
【作者單位】： 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;河南省漯河市畜牧局;甘肅省現(xiàn)代養(yǎng)豬工程技術(shù)研究中心;
【基金】：甘肅省農(nóng)牧廳生物技術(shù)專項(xiàng)(GNSW-2008-04) 甘肅省科技重大專項(xiàng)(092NKDA036) 甘肅省科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(0804NKCA065) 國(guó)家自然基金項(xiàng)目(31660646)
【分類號(hào)】：S828

【參考文獻(xiàn)】

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1 姜平;高鳳山;額爾敦木圖;;荷包豬SLA-DRa基因的克隆及序列分析[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2015年02期

2 許剛璞;許瑜偉;;煙臺(tái)黑豬的調(diào)查報(bào)告[J];中國(guó)畜禽種業(yè);2011年06期

3 賈浩;張小白;宋曉峰;;人類胞內(nèi)蛋白半衰期與其亞細(xì)胞定位的相關(guān)性研究[J];計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué);2011年04期

4 莫斯科;房永祥;馮海燕;景志忠;;甘肅合作豬白細(xì)胞抗原經(jīng)典Ⅱ類分子DR基因克隆及生物信息學(xué)分析[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2009年11期

5 王燕;邢曉為;薛立群;黃生強(qiáng);吳曉麗;王維;;湖南大圍子豬SLA-DR基因克隆及其生物信息學(xué)分析[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2009年09期

6 唐醫(yī)亞;邢曉為;薛立群;黃生強(qiáng);王維;;湖南沙子嶺豬SLA-DR基因克隆及生物信息學(xué)分析[J];遺傳;2007年12期

7 劉榜,楊金娥,樊斌,，

本文編號(hào)：1507283