小尾寒羊間情期和發(fā)情期microRNAs差異表達(dá)分析
本文關(guān)鍵詞: 小尾寒羊 間情期 發(fā)情期 卵巢 microRNA 出處:《畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2016年07期 論文類型:期刊論文
【摘要】:本研究通過構(gòu)建和分析小尾寒羊間情期和發(fā)情期卵巢組織microRNA(miRNA)表達(dá)譜,篩選兩個(gè)時(shí)期差異表達(dá)的microRNAs,為研究microRNA調(diào)控小尾寒羊繁殖過程提供相應(yīng)的理論基礎(chǔ)。利用活體手術(shù)法在發(fā)情期(第1天)和間情期(第13天)分別采集一側(cè)卵巢。從卵巢中提取總RNA,利用illumina Hiseq2000測(cè)序平臺(tái)獲取RNA數(shù)據(jù),對(duì)表達(dá)譜和差異表達(dá)microRNAs進(jìn)行生物信息學(xué)分析。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)驗(yàn)證差異表達(dá)的microRNAs在小尾寒羊卵巢中表達(dá)水平。結(jié)果,成功地構(gòu)建出小尾寒羊間情期和發(fā)情期microRNA的表達(dá)譜,oar-miR-99a和oar-miR-143分別是間情期和發(fā)情期表達(dá)量最高的microRNA,并篩選出在兩個(gè)時(shí)期間3個(gè)顯著差異表達(dá)的microRNAs,分別為oar-miR-200a、oar-miR-200b和oar-miR-200c。利用qRT-PCR對(duì)隨機(jī)選擇的2個(gè)顯著差異表達(dá)的microRNAs進(jìn)行驗(yàn)證,其表達(dá)水平和RNA-Seq分析結(jié)果一致。microRNA表達(dá)譜為后續(xù)的綿羊卵巢microRNA研究提供更詳盡的信息。結(jié)合靶基因預(yù)測(cè)及通路富集分析,推測(cè)差異表達(dá)的microRNAs是通過代謝和免疫途徑調(diào)控卵巢周期性活動(dòng)。
[Abstract]:In this study, we constructed and analyzed the microRNAs miRNAs expression profiles in ovary tissues of small tail Han sheep during estrus and estrus to screen the differentially expressed microRNAs in the two stages. To provide a theoretical basis for the study of the regulation of small tail Han sheep reproductive process by microRNA. In vitro operation during estrus (1st day) and interoestrus (13th day). The total RNA was extracted from the ovary. Using illumina Hiseq2000 sequencing platform to obtain RNA data. Bioinformatics analysis of expression profile and differentially expressed microRNAs. Real-time quantitative PCR qRT-PCR. To verify the expression level of differentially expressed microRNAs in ovary of small tail Han sheep. The expression profiles of microRNA in estrus and estrus of small tail Han sheep were successfully constructed. Oar-miR-99a and oar-miR-143 were the most expressed microRNA in the period of interestrus and estrus, respectively. Three significant differences of microRNas were identified between the two periods, respectively, which were oar-miR-200a. Oar-miR-200b and oar-miR-200c. qRT-PCR were used to verify the two differentially expressed microRNAs in random selection. The microRNAs expression level is consistent with the results of RNA-Seq analysis. MicroRNAs provide more detailed information for further study of sheep ovarian microRNA. Combination of target gene prediction and pathway enrichment. Analysis. It is speculated that the differentially expressed microRNAs regulates ovarian periodic activity through metabolic and immune pathways.
【作者單位】: 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:河北省高等學(xué)?茖W(xué)技術(shù)研究青年基金項(xiàng)目(QN2015162) 河北省首批青年拔尖人才支持計(jì)劃(2013-2015) 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)青年學(xué)術(shù)帶頭人支持項(xiàng)目(2015-2017)
【分類號(hào)】:S826
【正文快照】: microRNA是一類長約22個(gè)核苷酸的非編碼單鏈RNA分子,在哺乳動(dòng)物的卵巢、輸卵管、子宮、胎盤等繁殖組織器官中廣泛表達(dá)[1-3]。它通過與靶mRNA特異性堿基互補(bǔ)配對(duì),引起靶mRNA降解或者抑制其翻譯,發(fā)揮基因轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控作用,從而參與細(xì)胞分化、增殖、凋亡等一系列生物學(xué)過程,而
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,本文編號(hào):1480576
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