發(fā)布時(shí)間：2018-01-23 21:48

  本文關(guān)鍵詞： 雞 攻擊行為 GWAS SORCS2　出處：《華南農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：雞的攻擊行為是指動(dòng)物個(gè)體間為爭(zhēng)奪生存空間、食物或配偶而形成的爭(zhēng)斗行為。過(guò)度的攻擊行為會(huì)導(dǎo)致個(gè)體的外表缺陷、死亡率的增加以及企業(yè)生產(chǎn)利潤(rùn)的下降。另一方面,攻擊行為是人類社會(huì)的一種不良行為,往往會(huì)導(dǎo)致犯罪的出現(xiàn)。因此,研究動(dòng)物的攻擊行為可以幫助人類更好地認(rèn)識(shí)攻擊行為的分子遺傳機(jī)制。本實(shí)驗(yàn)使用全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWAS)的方法。的方法,試圖找到與雞攻擊行為密切相關(guān)的SNP,進(jìn)而找到與其相關(guān)的基因,為降低生產(chǎn)過(guò)程中雞的攻擊頻率,奠定一定的分子基礎(chǔ)。主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:(1)為了研究雞的日打斗頻率與日采食量、日體重、日增重的關(guān)系,我們對(duì)67-82日齡雄性矮腳黃雞的這四種表型性狀進(jìn)行記錄。通過(guò)相關(guān)分析發(fā)現(xiàn),雞的日打斗頻率與日采食量呈顯著正相關(guān)(P=8.66E-05),但日打斗頻率與日體重(P=0.5787)及日打斗頻率與日增重(P=0.7104)皆無(wú)顯著關(guān)聯(lián)。此實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明攻擊行為會(huì)降低個(gè)體的飼料轉(zhuǎn)化率。(2)為定位到與雞攻擊行為相關(guān)的SNPs,我們使用Affymetrix公司的600 K Axiom?Chicken Genotyping Array對(duì)矮腳黃雞進(jìn)行分型。GWAS結(jié)果顯示,共有105個(gè)SNP效應(yīng)(包括62個(gè)不同的SNP位點(diǎn))達(dá)到潛在關(guān)聯(lián)水平(P4.6E-6),其中17個(gè)SNP效應(yīng)(包括8個(gè)不同的SNP位點(diǎn))達(dá)到顯著關(guān)聯(lián)水平(P2.3E-7)。4號(hào)染色體SORCS2基因附近富集了多個(gè)效應(yīng)SNP,其中關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的位點(diǎn)是rs312463697(P=7.78E-09)。(3)通過(guò)qPCR發(fā)現(xiàn),在垂體組織中,高頻率打斗雞的SORCS2基因表達(dá)量顯著高于低頻率打斗雞(P=0.029)。(4)通過(guò)IPA軟件對(duì)潛在關(guān)聯(lián)的SNP相對(duì)應(yīng)的基因,進(jìn)行生物功能分析,得到兩個(gè)基因互作網(wǎng)絡(luò)。其中相關(guān)性最高的網(wǎng)絡(luò)(網(wǎng)絡(luò)-1)含有35個(gè)基因。網(wǎng)絡(luò)的主要功能是細(xì)胞的妥協(xié)、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、機(jī)體的損傷和行為的調(diào)節(jié)。SORCS2基因也富集在網(wǎng)絡(luò)(網(wǎng)絡(luò)-1)上,通過(guò)直接影響NGF基因,間接影響網(wǎng)絡(luò)中其他基因的表達(dá)。(5)多巴胺系統(tǒng)是重要的攻擊行為調(diào)節(jié)系統(tǒng),對(duì)SORCS2進(jìn)行siRNA干擾后,NGF和多巴胺受體(DRD1-DRD4)基因的表達(dá)量都顯著下降(P=0.003,0.012,1.64981E-05,0.045,6.67515E-05)。綜上所述,本實(shí)驗(yàn)初步證明SORCS2是調(diào)節(jié)攻擊行為的重要候選基因。
[Abstract]:Chicken aggression refers to the fight between animals for living space, food or spouse. Excessive aggression will lead to the appearance of the individual defects. On the other hand, aggressive behavior is a bad behavior of human society, which often leads to the emergence of crime. The study of animal aggressive behavior may help human beings to better understand the molecular genetic mechanism of aggressive behavior. Genome-wide association study. The method of GWAS. tries to find the SNPs which are closely related to the attack behavior of chickens, and then to find the genes associated with them, in order to reduce the attack frequency of chickens during production. The main results are as follows: 1) in order to study the relationship between daily fight frequency and daily feed intake, daily weight and daily gain of chickens. We recorded the four phenotypic traits of 67-82 day-old male Dwarf yellow chickens. The results of correlation analysis showed that there was a significant positive correlation between the daily fighting frequency and the daily intake. But the daily fight frequency and daily weight are 0.5787) and the daily fighting frequency and daily weight gain are 0.7104). No significant correlation was found between the two groups. The results showed that the attack behavior decreased the feed conversion rate of the individual. It was found that the SNPs was related to the attack behavior of chicken. We use Affymetrix's 600K Axiom? The results of Chicken Genotyping Array genotyping. A total of 105 SNP effects (including 62 different SNP loci) reached the potential association level (P4.6E-6). Among them, 17 SNP effects (including 8 different SNP loci) reached a significant correlation level, and multiple effect SNP were enriched near the SORCS2 gene of chromosome P2.3E-7. 4. The most relevant locus was rs312463697, which was found in pituitary tissue by qPCR. The expression of SORCS2 gene in high-frequency fighting chicken was significantly higher than that in low-frequency fighting chicken. The biological function analysis shows that two genes interact with each other. The network with the highest correlation (network-1) contains 35 genes. The main function of the network is cell compromise, nervous system diseases. SORCS2 gene is also concentrated in the network (network-1) by directly affecting the NGF gene. The dopamine system, which indirectly affects the expression of other genes in the network, is an important aggressive behavior regulation system, after siRNA interference to SORCS2. The expression of NGF and dopamine receptor DRD1-DRD4 gene decreased significantly. In conclusion, SORCS2 is an important candidate gene for the regulation of aggressive behavior.
【學(xué)位授予單位】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S831

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本文編號(hào)：1458309