金川牦牛HIF-3A克隆及生物信息學分析
發(fā)布時間:2018-01-22 03:17
本文關(guān)鍵詞: 金川牦牛 低氧誘導因子-a 克隆 生物信息學分析 出處:《生物技術(shù)》2017年05期 論文類型:期刊論文
【摘要】:[目的]克隆金川牦牛低氧誘導因子-3A(HIF-3A)并進行生物信息學的分析。[方法]采用PCR方法從金川牦牛血液中克隆出HIF-3A,通過生物學軟件Protparam、SOPMA、ProtScale、NetPhos、SignaIP、TMHMM、PSORTⅡ、Protfun2.2對核酸序列以及蛋白進行分析。[結(jié)果]金川牦牛HIF-3A長度為513 bp、ORF為441 bp、一共編碼氨基酸146個,相對分子質(zhì)量為15 729.19 Da,和普通牛的CDS區(qū)有8個堿基不同,突變了5個氨基酸,預測無跨膜區(qū)域,不存在信號肽序列,主要位于細胞質(zhì)與線粒體中,有β-轉(zhuǎn)角和α-螺旋。在同源性比較中與牛的同源性達到了97.5%,與其他物種同源性較低。[結(jié)論]成功克隆出金川牦牛的HIF-3A基因,且不同屬的物種間不具有較高的保守性,為非分泌蛋白。
[Abstract]:[Objective: to clone the hypoxia inducible factor-3 AHIF- 3 A of Jinchuan Yak and analyze it by bioinformatics. [Methods: HIF-3A was cloned from the blood of Jinchuan yak by PCR method. The HIF-3A was cloned from the blood of Jinchuan yak. The HIF-3A was cloned from the blood of Jinchuan yak. The nucleic acid sequence and protein were analyzed by signal IPN TMHMMN PSORT 鈪,
本文編號:1453474
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