豬流行性腹瀉病毒實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
本文關(guān)鍵詞:豬流行性腹瀉病毒實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立 出處:《中國(guó)動(dòng)物檢疫》2016年01期 論文類(lèi)型:期刊論文
更多相關(guān)文章: 豬流行性腹瀉病毒 N基因 實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR 檢測(cè)
【摘要】:根據(jù)Gen Bank報(bào)道的N基因高度保守核苷酸序列,設(shè)計(jì)并合成一對(duì)引物。上下游引物與Gen Bank中登錄的153株豬流行性腹瀉病毒(PEDV)N基因全長(zhǎng)序列匹配度分別是100%和97%。以本實(shí)驗(yàn)室分離流行毒株為模板,利用SYBR Green I熒光染料法進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,獲得擴(kuò)增產(chǎn)物構(gòu)建重組質(zhì)粒作為陽(yáng)性對(duì)照,建立檢測(cè)豬流行性腹瀉病毒核酸的方法。同一樣品進(jìn)行3次重復(fù)試驗(yàn),變異系數(shù)0.9%。通過(guò)對(duì)臨床樣品進(jìn)行檢測(cè)和測(cè)序驗(yàn)證,核酸檢測(cè)結(jié)果中的陽(yáng)性樣品準(zhǔn)確率為100%。本研究所建立的熒光定量PCR檢測(cè)方法具有快速、靈敏、準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),可用于臨床PEDV的檢測(cè)及分子流行病學(xué)調(diào)查。
[Abstract]:According to the highly conserved N gene nucleotide sequence of Gen reported by Bank, a pair of primers were designed and synthesized. The primers of Gen and Bank on the 153 strains of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) sequence of N gene, respectively is 100% and 97%. is separated by our laboratory strains as template, amplified by RT-PCR using SYBR Green I fluorescence dye method, obtained PCR products to construct recombinant plasmid as a positive control, set up a method for the detection of porcine epidemic diarrhea virus nucleic acid. The same samples were repeated 3 times, the coefficient of variation was detected by 0.9%. and sequencing of clinical samples, the positive samples of nucleic acid detection results in the accurate rate of fluorescence quantitative PCR detection the establishment of the Institute of 100%. method is fast, sensitive, accurate and can be used for detection and molecular epidemiology of clinical PEDV.
【作者單位】: 浙江農(nóng)林大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;中國(guó)動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心;金華職業(yè)技術(shù)學(xué)院農(nóng)業(yè)與生物工程學(xué)院;
【基金】:浙江省科技廳項(xiàng)目(2014C32061,2014C02003) 金華市農(nóng)業(yè)類(lèi)重點(diǎn)研究項(xiàng)目(2014-2-003)
【分類(lèi)號(hào)】:S852.65
【正文快照】: 豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(PEDV)引起豬的一種高度接觸性腸道傳染病,其特征為嘔吐、腹瀉、脫水[1]。本病主要發(fā)生在當(dāng)年12月至P次年2月,夏季也可發(fā)生,可以感染各年齡P階段的豬,其中哺乳仔豬最易感,發(fā)病率可達(dá)100%,平均死亡率可達(dá)50%。
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