本文關鍵詞：1型鴨肝炎病毒VP1基因的序列分析及分段表達　出處：《內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學》2016年碩士論文　論文類型：學位論文

  更多相關文章： 1型鴨肝炎病毒 VP1基因 序列分析 分段表達

【摘要】：為了解我國1型鴨肝炎病毒的基因變異情況,本試驗對6株分離自山東地區(qū)的鴨肝炎病毒株SD4、SD10、SD15、SD37、SD38、SD40病毒液接種鴨胚尿囊腔,收集尿囊液,鑒定凍存?zhèn)溆�。對其VP1基因進行序列測定,用MEGA5軟件與GenBank中已公布的14株鴨肝炎病毒VP1序列進行比較分析,比較核苷酸的同源性并繪制進化樹。結(jié)果表明,SD4株VP1基因與10株1型鴨肝炎病毒VP1基因的同源在84.7%～91.0%之間,SD10株VP1基因與10株1型鴨肝炎病毒VP1基因的同源在86.5%～92.2%之間,SD15株VP1基因與10株1型鴨肝炎病毒VP1基因的同源在84.9%～94.0%之間,SD37株VP1基因與10株1型鴨肝炎病毒VP1基因的同源在84.8%～90.3%之間,SD38株VP1基因與10株DHAV-1的同源性在92.2%-98.0%之間,SD40與10株1型鴨肝炎病毒VP1基因的同源性在85.9%～91.8%之間。6株試驗毒株與2型和3型鴨肝炎病毒VP1基因的同源性在62.5%～71.6%之間,同源性較低。SD38 VP1基因與10株1型鴨肝炎病毒VP1基因的同源性較高。同時,本試驗對SD38病毒株VP1基因進行分段表達。成功獲得了高抗原性的可溶性蛋白pCold-TF-1Q、pCold-TF-1Z、pCold-TF-1H,并對獲得的分段表達蛋白進行了純化。本試驗為建立檢測Ⅰ型鴨病毒性肝炎抗體的ELISA檢測方法奠定了基礎。
[Abstract]:To understand the genetic variation of duck hepatitis virus type 1 in China, 6 strains of duck hepatitis virus SD4 isolated from Shandong, SD10, SD15, SD37, SD38 and SD40 were inoculated into the duck embryo allantoic cavity, and the allantoic fluid was collected for identification of frozen storage. The sequence of VP1 gene was sequenced. Compared with 14 published duck hepatitis virus VP1 sequences published in GenBank, MEGA5 was used to compare the nucleotide homology and draw the phylogenetic tree. The results showed that SD4 strain VP1 gene and 10 strains of duck hepatitis virus type 1 VP1 gene homology in 84.7% ~ 91% between SD10 strain VP1 gene and 10 strains of duck hepatitis virus type 1 VP1 gene homology in 86.5% ~ 92.2% between SD15 strain VP1 gene and 10 strains of duck hepatitis virus type 1 VP1 gene homology 84.9% ~ 94%, SD37 strain VP1 gene and 10 strains of duck hepatitis virus type 1 VP1 gene homology in 84.8% ~ 90.3% between SD38 strain VP1 gene and 10 strains of DHAV-1 homology between 92.2%-98.0%, SD40 and 10 strains of duck hepatitis virus type 1 VP1 gene homology in 85.9% ~ 91.8%. The homology of the 6 test strains with the VP1 gene of type 2 and type 3 duck hepatitis virus was from 62.5% to 71.6%, and the homology was low. The SD38 VP1 gene is highly homologous to the VP1 gene of 10 strains of duck hepatitis virus type 1. At the same time, the VP1 gene of SD38 virus strain was segmented in this experiment. The soluble protein pCold-TF-1Q, pCold-TF-1Z and pCold-TF-1H of high antigenicity were successfully obtained, and the obtained segmented protein was purified. This experiment laid the foundation for the establishment of ELISA detection method for detecting the antibody of type I duck viral hepatitis.
【學位授予單位】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S852.65

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本文編號：1345562