本文關(guān)鍵詞：基于線粒體基因組變異的越南和中國豬種的遺傳多樣性分析

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【摘要】：越南是東南亞地區(qū)一個(gè)具有豐富遺傳多樣性的國家。近些年來,雖然在動(dòng)物遺傳學(xué)上已經(jīng)開展了很多研究,但是仍然需要深入地進(jìn)行地方豬品種遺傳多樣性的分析。到目前為止,基于完整的線粒體基因組對(duì)越南地方豬種的遺傳變異研究很少。因此,本研究的目的是分析越南MongCai豬、Ban豬和野豬的遺傳多樣性。在越南Son La省,共采集了三個(gè)品種/豬種的耳組織樣品,在樣本采集的同時(shí)也對(duì)MongCai豬和Ban豬的表型進(jìn)行了記錄。通過提取樣品中的總DNA得到這些豬種的整個(gè)線粒體基因組序列,然后與中國地方豬種進(jìn)行比較,采用Neighbor-Joining和UPGMA方法,構(gòu)建了7個(gè)越南和145個(gè)(從Genbank數(shù)據(jù)庫下載)來自中國、臺(tái)灣,韓國,日本和歐洲的豬完整線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育樹。本研究結(jié)果如下:1.對(duì)越南兩個(gè)地方品種豬進(jìn)行了系統(tǒng)調(diào)查,包括75頭MongCai豬和40頭Ban豬,收集了毛色,繁殖性狀數(shù)據(jù),采集了耳組織樣品,另外還采集了2頭野豬的組織樣品。2.Mong Cai豬的繁殖性能高于Ban豬。Mong Cai豬的總?cè)轭^數(shù)平均為13.47個(gè),而Ban豬只有11.35個(gè)。Mong Cai和Ban豬的窩產(chǎn)仔數(shù)分別為11.8頭和7.66頭,平均出生個(gè)體重分別為0.54kg和0.44kg,斷奶仔豬重分別為5.57kg和4.46kg。3.Mong Cai豬、Ban豬和野豬的整個(gè)線粒體基因組均含有37個(gè)編碼基因,其中包括2個(gè)核糖體RNA,13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因和1個(gè)控制區(qū)。每個(gè)個(gè)體的整個(gè)線粒體基因組的總長度具有差異,約16.5~16.7kb,含有34%的堿基A,25%的堿基T,26%的堿基C和13%的堿基G,A和T較為豐富(約占60%)。4.系統(tǒng)發(fā)育樹表明越南豬和中國豬的親緣關(guān)系比較近,特別是Mong Cai豬和巴馬香豬具有很近的遺傳關(guān)系,Ban豬和Banna微型豬以及滇南小耳豬較近。有趣的是,越南野豬和很多中國豬品種具有共同的祖先。中越兩國之間較近的地理位置和人及動(dòng)物的頻繁交流可能是這些豬品種間較近遺傳距離的原因。5.通過計(jì)算亞洲地區(qū)豬群之間的遺傳距離,結(jié)果表明,與歐洲相比,亞洲國家之間豬群有著更小的遺傳距離,其中,中國豬與日本豬種的遺傳距離最近(0.0010)。本研究結(jié)果為今后的研究提供了重要的基礎(chǔ)性遺傳數(shù)據(jù)。
【學(xué)位授予單位】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S828

【相似文獻(xiàn)】

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1 劉祚昌,趙世民,詹慶才,陳一吾;水稻線粒體基因組翻譯產(chǎn)物與細(xì)胞質(zhì)雄性不育性[J];遺傳學(xué)報(bào);1989年01期

2 劉銀梅;;線粒體基因組遺傳與進(jìn)化[J];中國畜禽種業(yè);2007年08期

3 周志軍;楊明茹;常巖林;石福明;;兩種紡織娘線粒體基因組的比較分析[J];昆蟲學(xué)報(bào);2013年04期

4 焦美俊,劉彥琴;甜菜線粒體基因組的研究進(jìn)展[J];中國甜菜;1991年03期

5 張尚宏;動(dòng)物與植物線粒體基因組結(jié)構(gòu)的差異──兩種進(jìn)化途徑[J];動(dòng)物學(xué)研究;1995年02期

6 李雙雙;薛龍飛;蘇愛國;雷彬彬;王玉美;華金平;;高等植物線粒體基因組測(cè)序和序列分析[J];中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2011年02期

7 趙春霞;盛勃;唐德江;李鵬;趙和生;楊煥民;劉勝軍;;魚組織線粒體基因組提取方法的改進(jìn)[J];黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào);2013年02期

8 魏丹丹;邵韌夫;陳世春;王進(jìn)軍;;嚙總目昆蟲的線粒體基因組多樣性及系統(tǒng)發(fā)育研究進(jìn)展[J];昆蟲學(xué)報(bào);2014年04期

9 高英凱;苗永旺;蘇小茜;池振奮;俞，

本文編號(hào)：1222882