發(fā)布時間：2017-11-04 20:15

  本文關(guān)鍵詞：短膜殼絳蟲線粒體全基因組序列測定和DNA多態(tài)性研究

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【摘要】：短膜殼絳蟲(Hymenolepis nana)是寄生在人或嚙齒動物小腸內(nèi)的一種常見的人獸共患寄生蟲,能夠引起膜殼絳蟲病。盡管短膜殼絳蟲是一種人獸共患寄生蟲,并能夠在各國引起嚴(yán)重的社會經(jīng)濟(jì)問題,但短膜殼絳蟲的遺傳學(xué)、系統(tǒng)學(xué)、流行病學(xué)和生物學(xué)卻鮮為人知。短膜殼絳蟲病作為一種易于忽視的人獸共患病需引起關(guān)注。本研究運(yùn)用PCR方法擴(kuò)增了來自中國7個不同地區(qū)的短膜殼絳蟲樣品的線粒體3段基因pnad5,rrnS和atp6,并根據(jù)這3段基因進(jìn)行了核苷酸序列差異和多態(tài)性分析。結(jié)果顯示3段線粒體基因的長度分別是710 bp,704~711 bp和516 bp。pnad5片段的A+T%含量是70.1%~73.5%,rrnS片段的A+T%含量為70.1%~71.7%,而atp6的A+T%含量為76.6%~77.9%。種內(nèi)差異最小的片段是pnad5,為0~0.7%,atp6種內(nèi)差異為0~1.4%;rrnS種內(nèi)差異最大,為0~1.7%。將短膜殼絳蟲3段線粒體基因與縮小膜殼絳蟲(Hymenolepis diminuta)相應(yīng)片段進(jìn)行序列分析,結(jié)果顯示兩者種間差異較大,rrnS片段種間差異為16.1%~17.6%;atp6種間差異為26.5%~27.1%;pnad5片段種間差異最大,為31.6%~31.7%。應(yīng)用最大簡約法對3段基因的拼接序列進(jìn)行進(jìn)化分析,結(jié)果顯示分離自不同地區(qū)的短膜殼絳蟲聚在一起,僅有張家口樣品單獨位于一個進(jìn)化枝上,可見短膜殼絳蟲三段線粒體基因進(jìn)化樹中,進(jìn)化分支與地理分布沒有直接的關(guān)系,也沒有一定的規(guī)律可循,來自同一地區(qū)的樣品不總在同一分支上,此進(jìn)化分析結(jié)果支持了前人對短膜殼絳蟲可能是復(fù)合種或隱藏種的結(jié)論。應(yīng)用長PCR方法對短膜殼絳蟲線粒體全基因進(jìn)行測序和基因定位。結(jié)果顯示短膜殼絳蟲線粒體全長為13764 bp,一共有36個基因和2個非編碼區(qū)。其中12為編碼線粒體蛋白質(zhì)基因、2個核糖體基因和22個tRNA基因。所有基因分布在重鏈上并沿同一個方向進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和復(fù)制。所有基因排列順序與其姊妹種縮小膜殼絳蟲(H.diminuta)一致。以12個蛋白質(zhì)編碼基因拼接序列應(yīng)用貝葉斯法、最大似然法和最大簡約法進(jìn)行進(jìn)化分析,結(jié)果顯示所用絳蟲線粒體基因組序列分為兩個明顯進(jìn)化枝,有較高的節(jié)點支持。一個是假葉目的雙葉槽科(Diphyllobothriidae);另一個是圓葉目。其中圓葉目的帶科(Taeniidae)、膜殼科(Hymenolepididae)和復(fù)孔科(Dipylidiidae)內(nèi)分化較為明顯,獨立分支。本研究測定了短膜殼絳蟲線粒體全基因組序列并進(jìn)行進(jìn)化分析,為短膜殼絳蟲的分子分類學(xué)、種群遺傳學(xué)研究提供了遺傳標(biāo)記,豐富了基因組學(xué)的研究內(nèi)容,對人類短膜殼絳蟲疾病的診斷防控都具有重要的意義。
【學(xué)位授予單位】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S852.7

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1140942