本文關鍵詞：云南黑山羊全基因組重測序

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【摘要】：采用Illumina Hiseq2000測序技術對由云南黑山羊具有代表性的個體構建的DNA池進行20X全基因組重測序,以期對云南黑山羊分子特征做出評價,并為云南黑山羊功能基因定位提供分子基礎數(shù)據(jù)。結果表明:云南黑山羊可以檢測到7 615 774個SNP、877 232個INDEL和40 005個SV。通過比對山羊參考基因組,并進行生物信息學分析,結果顯示云南黑山羊位于外顯子區(qū)域的SNP有35 902個,其中異義突變17 160個,同義突變18 920個;外顯子區(qū)域的小INDEL有1 330個;位于內(nèi)含子區(qū)域的SNP 1 695 420個,小INDEL 208 999,位于UTR3區(qū)域的SNP 16 106個,小INDEL 580個。研究結果基本闡明了云南黑山羊的分子特征,為后續(xù)功能基因的研究提供了強大的數(shù)據(jù)支撐,并為功能基因的定位提供新的思路和線索。
【作者單位】： 云南省畜牧獸醫(yī)科學院;
【基金】：云南省科技計劃項目(2014BB014) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系建設(CARS-39)
【分類號】：S827
【正文快照】： 近年來,隨著基因測序技術的發(fā)展和進步,測序時間的縮短和成本的降低,科學家們使用全基因組測序技術獲得大量物種的基因組序列。以此為基礎,通過全基因組重測序技術(whole-genomeresequencing,WGR)對已知基因組序列的不同個體進行基因組重測序和序列對比分析,可得到物種個體差

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