牦牛SPAG11基因克隆與生物信息學(xué)分析
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更多相關(guān)文章: 牦牛 精子相關(guān)抗原 β-防御素 生物信息學(xué)
【摘要】:【目的】克隆牦牛(Bos grunniens)精子相關(guān)抗原11(Sperm-Associated Antigen 11,SPAG11)基因,并了解其分子結(jié)構(gòu)特征,為進(jìn)一步研究牦牛SPAG11生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。【方法】從牦牛睪丸中提取總RNA,RTPCR擴(kuò)增并克隆SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E基因,測序后進(jìn)行生物信息學(xué)分析。【結(jié)果】克隆出牦牛SPAG11基因3個(gè)亞型:SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E,序列大小分別是351,408和261bp,分別編碼117,129和80個(gè)氨基酸,其中SPAG11 D和SPAG11E序列包含1個(gè)完整開放閱讀框(ORF),SPAG11C序列包含部分ORF。牦牛SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E核苷酸序列與黃牛(Bos taurus)相應(yīng)序列相似性最高,而與黃牛β-防御素1相似性較低(50%)。3個(gè)蛋白亞型均具有β-防御素家族基本特性,生物信息學(xué)分析顯示其均含有磷酸化位點(diǎn)!窘Y(jié)論】成功克隆牦牛SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E基因,明確了其編碼蛋白的分子結(jié)構(gòu)特征。
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院奶牛疾病研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 牦牛 精子相關(guān)抗原 β-防御素 生物信息學(xué)
【基金】:教育部“長江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃”創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(IRT0848) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31172379) 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)科建設(shè)雙支計(jì)劃項(xiàng)目(3570806)
【分類號(hào)】:S823.85;Q78
【正文快照】: 精子相關(guān)抗原11(Sperm-Associated Antigen11,SPAG11),也稱為附睪蛋白2(Epididymal pro-tein 2,EP2),是一種β-防御素。研究表明,SPAG11蛋白優(yōu)先表達(dá)于雄性生殖器官,不僅具有廣譜的抗微生物活性[1],還在提高精子活力以及促進(jìn)精子成熟、獲能和穿過透明帶中發(fā)揮著重要作用[2-3]
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,本文編號(hào):1122284
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