本文關鍵詞：武功山人為干擾下不同退化程度山地草甸土壤微生物分布特征研究

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【摘要】：江西武功山位于羅霄山脈北段,具有典型的山地草甸植被類型,由于其大規(guī)模的山地草場放牧及旅游開發(fā),使得山地草甸群落組成和生產(chǎn)力出現(xiàn)退化,嚴重破壞了山地草甸生態(tài)系統(tǒng)。土壤微生物是土壤乃至生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,土壤微生物分布特征是評價自然或人為干擾引起的土壤變化重要指示因子,所以研究武功山退化草甸下土壤微生物分布特征具有重要意義。本研究采用ASI法和高通量測序法測定了武功山輕度、中度、重度退化和對照(無退化)樣地上下層土壤的養(yǎng)分狀況及微生物菌群的群落結構,旨在以土壤微生物分布特征研究結果作為評價自然或人為干擾引起的土壤變化的重要指示因子,揭示其在山地草甸退化土壤生態(tài)系統(tǒng)恢復中的作用機理以及土壤功能恢復的微生物學機制,為武功山退化草甸土壤生態(tài)系統(tǒng)功能恢復提供科學依據(jù)。結果如下:1、金頂區(qū)域土壤p H值呈強酸性,養(yǎng)分特征,速效氮磷鉀平均含量分別為38.96mg/L、5.01 mg/L和46.79 mg/L,土壤養(yǎng)分含量不均衡,磷和鉀含量偏低。2、本文經(jīng)OTUs分析,在域(Domain)的水平上是細菌種群和古菌種群兩種。3、武功山人為干擾下不同退化程度土壤細菌種群文庫在門(Phylum)的水平上,酸桿菌門(Acidobacteria)占比37%-45.4%,變形桿菌門(Proteobacteria)占比在29.8%-35.2%,泉古菌門占比為4.8%-9.3%,綠彎菌門(Chloroflexi)其占比在2.2%-3.9%,AD3門其占比范圍為2.0%-4.7%,疣微菌門(Verrucomicrobia)其占比范圍2.1%-3.6%,放線菌(Actinobacteria)占比范圍2.1%-2.3%,芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)占比范圍1%-1.5%,。其次為WPS-2門和廣古菌門(Euryarchaeota),占比均小于1%。其中酸桿菌門、變形桿菌門和泉古菌門是優(yōu)勢類群。聚類分析表明土壤上層和下層的菌類種類具有明顯差異。4、武功山人為干擾下不同退化程度土壤細菌種群在屬(Genus)水平上,細菌種群文庫最大豐度排在前10名的分別是Candidatus Solibacter(占比4.2%-7.1%)、Candidatus Koribacter(占比3.4%-5.0%)、DA101、紅游動菌屬(Rhodoplanes)(占比1.3%-2.2%)、大豆根瘤菌屬(Bradyrhizobium)(占比0.9%-1.4%)、紅球菌屬(Rhodanobacter)、尼龍菌屬(Flavobacterium)、Candidatus Xiphinematobacter、伯克氏菌屬(Burkholderia)、Edaphobacter。通過Chao1和Shannon指數(shù)評價武功山山地草甸人為干擾下不同退化程度樣地微生物群落豐度和群落多樣性是顯著的。5、從武功山山地草甸人為干擾下不同退化程度樣地的微生物群落種類和豐度來看,其優(yōu)勢菌群種類在門的水平上差別不大,但是豐度有差別,人為干擾下不同退化程度樣地上層和下層優(yōu)勢菌群豐度要小于對照(無退化)樣地。在屬的水平上優(yōu)勢菌群是Candidatus Solibacter和Candidatus Koribacter、DA101,且均是退化樣地豐度小于對照(無退化),而且隨著退化程度增加,其豐度逐漸減少。
【關鍵詞】：武功山 退化草甸 高通量測序 微生物群落結構
【學位授予單位】：江西農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S812.2
【目錄】：

• 摘要6-7
• Abstract7-9
• 1 緒論9-17
• 1.1 武功山概述9
• 1.2 DNA測序概述9-10
• 1.3 草甸退化研究現(xiàn)狀10-11
• 1.3.1 自然因子10
• 1.3.2 人為因子10
• 1.3.3 社會因子10-11
• 1.4 微生物多樣性研究方法11-14
• 1.4.1 土壤微生物多樣性的概念11-12
• 1.4.2 土壤微生物多樣性方法研究12-14
• 1.4.2.1 經(jīng)典土壤微生物研究方法12-13
• 1.4.2.2 磷脂脂肪酸(PLFA)分析法的應用13
• 1.4.2.3 群落水平單碳源利用模式(CLPP)13
• 1.4.2.4 變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)技術的應用13-14
• 1.5 DNA測序方法14-15
• 1.5.1 第一代高通量測序方法14
• 1.5.2 第二代高通量測序方法14-15
• 1.5.3 第三代高通量測序方法15
• 1.6 高通量測序在微生物研究的利用現(xiàn)狀15
• 1.7 研究的目的與意義15-17
• 2 試驗內(nèi)容與設計17-21
• 2.1 研究內(nèi)容17
• 2.2 研究區(qū)概況17-18
• 2.2.1 研究區(qū)概況17
• 2.2.2 試驗地選擇17-18
• 2.3 研究的技術路線圖18-19
• 2.4 材料與方法19
• 2.4.1 樣品采集與測試19
• 2.4.2 基因組DNA的提取19
• 2.4.3 測序19
• 2.4.3.1 PCR擴增19
• 2.4.3.2 PCR產(chǎn)物的混樣和純化19
• 2.4.3.3 文庫構建和上機測序19
• 2.5 信息分析流程19-21
• 2.5.1 測序數(shù)據(jù)處理19-20
• 2.5.2 OTU聚類和物種注釋20
• 2.5.3 樣品復雜度分析（Alpha Diversity）20
• 2.5.4 多樣品比較分析（Beta Diversity）20-21
• 3 結果與分析21-38
• 3.1 武功山金頂區(qū)域土壤養(yǎng)分總體特征21-22
• 3.2 RAW Data預處理統(tǒng)計及質(zhì)控統(tǒng)計22-23
• 3.3 OTU分析及物種注釋23-27
• 3.3.1 OTU分析23-25
• 3.3.2 物種注釋25-27
• 3.4 武功山退化草甸土壤微生物群落多樣性分析27-33
• 3.4.1 物種多樣性曲線27-31
• 3.4.2 物種多樣性指數(shù)分析31-32
• 3.4.3Alpha多樣性指數(shù)組間差異分析32-33
• 3.5 武功山退化草甸土壤微生物群落結構分析33-38
• 4 結論與展望38-40
• 4.1 結論38
• 4.2 討論與展望38-40
• 參考文獻40-44
• 致謝44

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1 劉麗強;;一鳴驚人武功山[J];大自然;2001年06期

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3 王海燕;毛端謙;文瑚霞;;武功山國內(nèi)客源市場分析與營銷策略[J];熱帶地理;2006年04期

4 王家磊;;武功山體育旅游資源特色及其開發(fā)[J];萍鄉(xiāng)高等�？茖W校學報;2013年05期

5 江春發(fā);武功草甸美如畫[J];植物雜志;2002年06期

6 廖鉛生;林燕春;張波;廖菲菲;;萍鄉(xiāng)武功山樟科植物資源及其利用[J];萍鄉(xiāng)高等專科學校學報;2009年06期

7 ;武功山國家地質(zhì)公園[J];國土資源情報;2012年06期

8 喻曉林,周德中,彭益萍,梁艷萍,劉江華;萍鄉(xiāng)武功山林區(qū)的藥用植物資源[J];江西林業(yè)科技;2002年03期

9 何華春,石軍南;基于GIS系統(tǒng)的旅游區(qū)研究——以武功山風景旅游區(qū)為例[J];經(jīng)濟地理;2003年06期

10 劉細元,衷存堤;關于贛西武功山地區(qū)構造問題的討論[J];華東地質(zhì)學院學報;2003年03期

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉麗強;一鳴驚人武功山[N];光明日報;2001年

2 江春發(fā)邋工作于江西萍鄉(xiāng)武功山管委會;武功山：旅游業(yè)蓄勢待飛[N];華東旅游報;2007年

3 崔夢瑤;生態(tài)勝境：江西武功山[N];中華新聞報;2007年

4 江春發(fā);萍鄉(xiāng)武功山旅游開發(fā)漸入佳境[N];中國旅游報;2005年

5 劉麗強 劉之沛;武功山晉級國家重點風景名勝區(qū)[N];江西日報;2006年

6 本報記者 龔波華;武功山景美路殤[N];江西日報;2010年

7 本報記者 鐘秋蘭;武功山頂“牛皮癬”何時休[N];江西日報;2010年

8 通訊員 王輝;安福高起點開發(fā)武功山旅游[N];江西日報;2010年

9 躍林　立華 李莉;武功山：致力打造“戶外運動天堂”[N];中國旅游報;2010年

10 本報記者 徐黎明　通訊員 郁文生;武功山,如何開發(fā)與保護是一個問題[N];江西日報;2010年

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1 柴震;精細化財務管理在武功山景區(qū)的應用研究[D];湘潭大學;2015年

2 靳川平;武功山退化草甸植被地形管理分析與施肥推薦系統(tǒng)[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2015年

3 朱文玲;安�？h武功山茶葉產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀分析與對策研究[D];江西師范大學;2016年

4 盛可銀;武功山人為干擾下不同退化程度山地草甸土壤微生物分布特征研究[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2016年

5 鄧邦良;增溫和氮沉降對武功山修復草甸土壤碳氮過程的影響研究[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2016年

6 趙自穩(wěn);武功山草甸土壤氮庫對退化和模擬增溫的響應[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2016年

7 張輝海;武功山旅游深度開發(fā)研究[D];江西師范大學;2009年

8 鄒麗華;武功山風景名勝區(qū)生態(tài)旅游開發(fā)及容量研究[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2012年

9 黃尚書;武功山退化草甸生態(tài)系統(tǒng)磷素研究[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2014年

10 唐劍波;武功山退化草甸土壤養(yǎng)分限制因子及其對植被生物量的影響[D];江西農(nóng)業(yè)大學;2014年

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本文編號：1109789