本文關鍵詞：山羊DLK1基因分子克隆、生物信息學分析及表達研究

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【摘要】：本研究旨在克隆山羊DLK1基因,預測編碼蛋白的結構與功能,同時研究該基因在山羊組織器官中的表達規(guī)律及其與肌內脂肪含量的相關性。以簡州大耳羊為試驗動物,采用RT-PCR克隆DLK1基因序列,結合生物信息學方法分析其生物學特性,熒光定量檢測DLK1mRNA表達情況,并將表達量與肌內脂肪含量進行相關性分析。結果顯示,克隆得到山羊DLK1長度為1 137bp,開放閱讀框(ORF)長度為927bp(GenBank登錄號:KP686197),編碼308個氨基酸,山羊核苷酸序列和氨基酸序列與牛的相似性最高(97%),系統進化樹分析表明山羊與牛親緣關系最近;生物信息學預測顯示,該蛋白屬于不穩(wěn)定酸性疏水蛋白;有8個磷酸化位點和1個N-糖基化位點;亞細胞定位于內質網(44.4%)、高爾基體(33.3%)和質膜(22.2%),屬于分泌跨膜蛋白;具有5個表皮生長因子結構域和2個表皮生長因子家族特有的保守結構域EGF-CA;預測二級結構由12.99%β-折疊和87.01%無規(guī)則卷曲組成的非常規(guī)蛋白。熒光定量PCR結果顯示,DLK1基因在山羊不同組織中都存在表達,其在腎中表達水平最高,在脂肪組織中表達水平最低;DLK1基因在羔羊背最長肌組織中表達水平最高,高于育成羊和成年羊,但差異不顯著(P0.05);相關分析顯示,山羊背最長肌、腿肌、臂三頭肌中DLK1mRNA表達與肌內脂肪含量分別呈顯著負相關(R=-0.6,P0.05)、無顯著正相關(R=0.2,P0.05)和無顯著負相關(R=-0.2,P0.05)。研究結果顯示,DLK1可能對山羊肌內脂肪沉積起著重要作用。本結果為進一步研究DLK1在肌內脂肪沉積過程中的作用提供了參考。
【作者單位】： 西南民族大學生命科學與技術學院;青藏高原動物遺傳資源保護與利用四川省重點實驗室;
【關鍵詞】： 山羊 DLK 克隆 組織表達 時序表達 肌內脂肪
【基金】：四川省“十二五”畜禽育種攻關項目(2011NZ0099-36) 四川省科技創(chuàng)新產業(yè)鏈示范工程重大項目(2014NZ0003) 西南民族大學研究生“創(chuàng)新型科研項目”(CX2015SZ069)
【分類號】：S827
【正文快照】： 羊肉具有高營養(yǎng)、低脂肪、低膽固醇,口感好,獨特風味等優(yōu)點,并且羊以草食為主,很少飼喂添加劑,羊肉中藥物殘留量極低,符合當今綠色安全食品的消費觀念,受到人們的親睞。肌內脂肪(Intra-muscular fat,IMF)是骨骼肌內沉積的脂肪[1],對肉的風味、嫩度和多汁性有著重要的影響[2],

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1 馬曉瑭;張悅;楊琳;徐澤鋒;肖志堅;;DLK1基因在骨髓增生異常綜合征發(fā)生中的作用機理研究[A];第13屆全國實驗血液學會議論文摘要[C];2011年

2 陳付英;牛暉;滑留帥;張春雷;雷初朝;藍賢勇;黃永震;王居強;陳宏;;DLK1第五外顯子的多態(tài)性及其系統發(fā)育分析[A];中國牛業(yè)健康發(fā)展與科技創(chuàng)新——中國畜牧獸醫(yī)學會第七屆養(yǎng)牛學分會2009年學術研討會論文集[C];2009年

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1 陳悅丹;第一部分 DLK1基因在骨髓衰竭性疾病中造血調節(jié)的研究第二部分 骨髓增生異常綜合征患者血小板減少預后意義的初步研究[D];北京協和醫(yī)學院;2013年

2 馬曉瑭;第一部分 DLK1基因在骨髓增生異常綜合征發(fā)生中的作用機理研究 第二部分 MLF1IP基因在真性紅細胞增多癥發(fā)生中作用機制的初步研究[D];北京協和醫(yī)學院;2011年

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本文編號：1092318