本文關(guān)鍵詞：牛乳頭狀瘤病毒貴州株L1基因克隆及生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 牛乳頭狀瘤病毒 L基因 生物信息學(xué)分析 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

【摘要】：為分析牛乳頭狀瘤病毒貴州株(BPV-GZ01株)L1基因的分子特征,預(yù)測(cè)其編碼蛋白的生物學(xué)功能,本試驗(yàn)對(duì)BPV-GZ01株L1基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆及序列測(cè)定。應(yīng)用生物信息學(xué)相關(guān)軟件及方法對(duì)BPV-GZ01株L1基因進(jìn)行序列分析,并對(duì)其編碼蛋白進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)、B細(xì)胞表位、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽預(yù)測(cè)。結(jié)果顯示,L1基因序列全長(zhǎng)為1 494bp,編碼497個(gè)氨基酸;與BPV2、BPV2-SW01、BPV2-AKS01、BPV13、BPV1株相應(yīng)序列核苷酸同源性分別為99.1%、99.8%、99.4%、87.6%和82.8%,氨基酸同源性分別為98.6%、99.4%、98.4%、94.4%和91.3%;系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,BPV-GZ01株與BPV2-SW01株親緣關(guān)系最近;L1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲、β-折疊和α-螺旋區(qū)域所占比例較大,預(yù)測(cè)此蛋白可能存在6個(gè)B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)抗原表位,無(wú)跨膜區(qū)域,無(wú)信號(hào)肽區(qū)域;三級(jí)結(jié)構(gòu)呈彎曲狀螺旋結(jié)構(gòu)。本研究結(jié)果將為貴州省BPV免疫診斷及核酸疫苗研究提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州省動(dòng)物疫病研究室;貴州省畜禽遺傳資源管理站;
【關(guān)鍵詞】： 牛乳頭狀瘤病毒 L基因 生物信息學(xué)分析 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
【基金】：貴州省農(nóng)業(yè)委員會(huì)科技專項(xiàng)《動(dòng)物疫病防控能力提升專項(xiàng)》(黔農(nóng)財(cái)[2015]149號(hào)) “貴州省動(dòng)物疫病防控與獸醫(yī)公共衛(wèi)生保障科技創(chuàng)新人才團(tuán)隊(duì)”(黔科合人才團(tuán)隊(duì)[2015]4016號(hào)) 貴州省黔南州社會(huì)發(fā)展科技重大計(jì)劃項(xiàng)目《喀斯特石漠化林草牧綜合治理技術(shù)研究與示范》[黔南社發(fā)科(20140325)] 貴州現(xiàn)代肉牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)(GZCYTX2015-0302-02)
【分類號(hào)】：S852.65
【正文快照】： contain 6potential antigen epitopes.And no transmembrane domains and no signal peptide werefound.The tertiary structure of L1protein was curved spiral structure.These results provided atheoretical basis for immunologic diagnosis and further research of n

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 賀志昊;劉賢俠;喬軍;孟慶玲;張?jiān)俪?楊海波;陳創(chuàng)夫;都曼·努爾坎杰;;奶牛乳頭狀瘤病理學(xué)診斷及病原分子檢測(cè)研究[J];石河子大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2013年06期

2 ;[J];;年期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 權(quán)鑫;苦參堿抗牛乳頭狀瘤病毒感染C127細(xì)胞研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 梁辰;牛乳頭狀瘤病毒的檢測(cè)及其細(xì)胞感染試驗(yàn)[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

，

本文編號(hào)：1082798