本文關(guān)鍵詞：豬繁殖與呼吸綜合征病毒四川株的分離鑒定及Nsp2生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 豬繁殖與呼吸綜合征病毒 分離鑒定 Nsp 生物信息學(xué)

【摘要】：為了解四川省豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的流行情況及分子特征,本研究選用2012—2014年四川省不同地區(qū)采集并診斷為PRRSV陽性的病料,以Marc 145細(xì)胞進(jìn)行病毒分離,經(jīng)蝕斑純化,病毒基因擴(kuò)增、測(cè)序后與NCBI現(xiàn)有序列進(jìn)行比對(duì)分析并通過構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹等方法研究分離株的分子特征。共成功分離到10株P(guān)RRSV,分析證明所有分離毒株均是高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒(HP-PRRSV)株,序列比對(duì)顯示,其中SC2012、SC2012-2株Nsp2部分基因與眾多HP-PRRSV株核苷酸同源性在91%~97%之間,與經(jīng)典毒株CH-1a株同源性為72.9%,與所有BLAST毒株相比存在新缺失位點(diǎn),與CH-1a、BJ-4株相比,在Nsp2蛋白485 aa~498 aa處存在14個(gè)連續(xù)氨基酸缺失,其他8株均含30個(gè)不連續(xù)氨基酸缺失。氨基酸同源性比對(duì)顯示,SC2012、SC2012-2株高變區(qū)與國內(nèi)分離株同源性介于61.5%~97.2%之間。通過TCID50法測(cè)得SC2012、SCSN2012-1、SCSN2012-2、SCCD2012、SCLS2012、SCMY2012、SCBZ2012、SCXC2012、SCXJ2012和SC2012-2病毒毒價(jià)分別為10~(-5.41)/m L、10~(-6.5)/m L、10~(-7.29)/m L、10~(-6.41)/m L、10~(-5.5)/m L、10~(-7.67)/m L、10~(-6.29)/m L、10~(-6.8)/m L、10~(-7.41)/m L和10~(-6)/m L。以上結(jié)果表明,本研究所分離的SC2012、SC2012-2株是新變異毒株,為四川省PRRSV分子流行病學(xué)和遺傳變異研究奠定了一定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院動(dòng)物生物技術(shù)中心;四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物疫病與人類健康四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 豬繁殖與呼吸綜合征病毒 分離鑒定 Nsp 生物信息學(xué)
【基金】：四川省科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2014NZ0043) 科技部國際科技合作項(xiàng)目(2014DFA31260)
【分類號(hào)】：S852.651
【正文快照】： 表1 Nsp2基因檢測(cè)引物序列及大小Table 1 Detection primer used in this studyNsp2 genes of SC2012 and SC2012-2 strains share high sequence homology of 91%-97%with many HP-PRRSVstrains in database,comparison of 72.9%homology with the classical strain CH-1a st

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 吳錦艷;田宏;尚佑軍;鄭海學(xué);靳野;尹雙輝;趙娜;滿自萍;劉湘濤;謝慶閣;;豬生殖與呼吸綜合征病毒HN/XT/07株的分離鑒定及其Nsp2基因的特性分析[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2008年12期

2 ;[J];;年期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 張美玲;豬繁殖與呼吸綜合征病毒新疆株XJ-Q的分離鑒定及其Nsp2和ORF5基因遺傳變異分析[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

2 孫春亮;長春地區(qū)PRRSV分離鑒定及其鑒別診斷方法的建立[D];延邊大學(xué);2014年

，

本文編號(hào)：1021010