犬前松弛素原基因的克隆與生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-10-09 17:01
本文關(guān)鍵詞:犬前松弛素原基因的克隆與生物信息學(xué)分析
更多相關(guān)文章: 犬 前松弛素原基因 松弛素 生物信息學(xué)分析
【摘要】:[目的]本試驗(yàn)通過對犬前松弛素原基因的分析推導(dǎo)獲得犬松弛素基因序列,為犬松弛素多克隆抗體的制備及臨床應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。[方法]以北京犬和吉娃娃新生胎盤、貴賓犬卵巢為材料,分別提取總RNA,經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增,獲得犬前松弛素原基因,應(yīng)用生物信息學(xué)方法初步分析犬前松弛素原基因的結(jié)構(gòu)及功能。[結(jié)果]完整克隆了從所獲樣品中擴(kuò)增到的預(yù)期大小目的片段,包含一個(gè)534 bp的開放閱讀框,編碼177個(gè)氨基酸。擴(kuò)增片段序列分析結(jié)果顯示,與NCBI核酸數(shù)據(jù)庫檢索的犬前松弛素原的c DNA序列同源性為99.6%,均有3個(gè)核苷酸位點(diǎn)發(fā)生改變,從而引起相應(yīng)氨基酸改變,但并未引起蛋白結(jié)構(gòu)的變化。進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,所獲3條目的片段同為一支,與貓前松弛素原基因的進(jìn)化距離最近。生物信息分析顯示,3條序列等電點(diǎn)、帶電荷數(shù)、最高(最低)氨基酸、消光系數(shù)、半衰期、不穩(wěn)定系數(shù)均一致,相對分子質(zhì)量、不穩(wěn)定系數(shù)、脂肪系數(shù)、總平均疏水指數(shù)有細(xì)微差異;跨膜區(qū)、信號(hào)肽、糖基化位點(diǎn)分析結(jié)果一致;二級(jí)結(jié)構(gòu)組成一致,包含α-螺旋、延伸鏈、無規(guī)則卷曲,比例存在細(xì)微差異。[結(jié)論]成功克隆了犬前松弛素原基因,可以生物信息學(xué)分析為基礎(chǔ)進(jìn)行犬松弛素多克隆抗體的制備。
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 犬 前松弛素原基因 松弛素 生物信息學(xué)分析
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31172379) 四川省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人培養(yǎng)基金項(xiàng)目
【分類號(hào)】:S829.2
【正文快照】: (College of Veterinary Medicine,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China)松弛素(relaxin,RLX)是主要由動(dòng)物卵巢和妊娠時(shí)胎盤合成分泌,具有抑制子宮收縮,松弛骨盆韌帶和恥骨聯(lián)合,軟化宮頸及產(chǎn)道,刺激乳腺發(fā)育功能的重要生殖激素[1-4],同時(shí)還具有降解膠原纖維,
本文編號(hào):1001340
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/1001340.html
最近更新
教材專著