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中華按蚊CYP6P5基因的生物信息學鑒定及特征分析

發(fā)布時間:2017-10-08 05:35

  本文關鍵詞:中華按蚊CYP6P5基因的生物信息學鑒定及特征分析


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【摘要】:目的鑒定中華按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征,為研究中華按蚊CYP6P5基因殺蟲劑抗性機制提供理論依據(jù)。方法以催命按蚊基因CYP6P5為詢問基因,基于中華按蚊轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),采用雙向Blast方法搜尋中華按蚊CYP6P5 cDNA序列。利用生物信息學相關軟件對該基因編碼蛋白序列的一級結(jié)構(gòu)、疏水區(qū)、跨膜區(qū)、結(jié)構(gòu)域、3D結(jié)構(gòu)等進行預測分析,并采用最大似然法(maximum likelihood,ML)建立代表性蚊種的系統(tǒng)發(fā)育關系。結(jié)果搜索獲得1條中華按蚊CYP6P5全長cDNA序列。該cDNA序列具備P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列,命名為CYP6P5(GenBank登錄號:KF358704)。該cDNA全長為1583 bp,開放閱讀框為1527 bp,編碼508個氨基酸,推測其相對分子質(zhì)量為58.32×103,等電點為7.17。分析表明該基因編碼的蛋白序列第5~21位氨基酸是疏水區(qū),第5~22位氨基酸是跨膜區(qū),第36~505位氨基酸是P450保守結(jié)構(gòu)域,并具有多個酶活性位點。系統(tǒng)發(fā)育關系和相似性分析表明,中華按蚊CYP6P5與催命按蚊CYP6P5和岡比亞按蚊CYP6P5親緣關系最近,形成一個單系,相似率分別為89.4%和89.0%。結(jié)論為進一步研究中華按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子機制奠定了基礎。
【作者單位】: 重慶師范大學生命科學學院 昆蟲與分子生物學研究所;
【關鍵詞】細胞色素P 中華按蚊 CYPP 鑒定 生物信息學分析
【基金】:美國國立衛(wèi)生研究院NIH項目(R01AI095184) 國家自然科學基金(31071968,31372265) 重慶市科技攻關重點項目(CSTC2012GG.YYJSB80002) “兩江學者”計劃專項經(jīng)費~~
【分類號】:R384.1
【正文快照】: 中華按蚊(Anopheles sinensis)是我國和東南亞地區(qū)瘧疾的主要傳播媒介[1],廣泛分布于阿富汗到中國東北,以及韓國、日本、中國臺灣,南至印度尼西亞西部的廣大地區(qū)[2]。21世紀初,瘧疾曾在我國中部大面積暴發(fā)流行;2006年瘧疾發(fā)病達64 178例[3];瘜W殺蟲劑滅蚊是防治瘧疾的重要措

【參考文獻】

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6 何桂銘,柯小麟,容t

本文編號:992308


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