中華按蚊CYP6P5基因的生物信息學鑒定及特征分析
本文關鍵詞:中華按蚊CYP6P5基因的生物信息學鑒定及特征分析
更多相關文章: 細胞色素P 中華按蚊 CYPP 鑒定 生物信息學分析
【摘要】:目的鑒定中華按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征,為研究中華按蚊CYP6P5基因殺蟲劑抗性機制提供理論依據(jù)。方法以催命按蚊基因CYP6P5為詢問基因,基于中華按蚊轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),采用雙向Blast方法搜尋中華按蚊CYP6P5 cDNA序列。利用生物信息學相關軟件對該基因編碼蛋白序列的一級結(jié)構(gòu)、疏水區(qū)、跨膜區(qū)、結(jié)構(gòu)域、3D結(jié)構(gòu)等進行預測分析,并采用最大似然法(maximum likelihood,ML)建立代表性蚊種的系統(tǒng)發(fā)育關系。結(jié)果搜索獲得1條中華按蚊CYP6P5全長cDNA序列。該cDNA序列具備P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列,命名為CYP6P5(GenBank登錄號:KF358704)。該cDNA全長為1583 bp,開放閱讀框為1527 bp,編碼508個氨基酸,推測其相對分子質(zhì)量為58.32×103,等電點為7.17。分析表明該基因編碼的蛋白序列第5~21位氨基酸是疏水區(qū),第5~22位氨基酸是跨膜區(qū),第36~505位氨基酸是P450保守結(jié)構(gòu)域,并具有多個酶活性位點。系統(tǒng)發(fā)育關系和相似性分析表明,中華按蚊CYP6P5與催命按蚊CYP6P5和岡比亞按蚊CYP6P5親緣關系最近,形成一個單系,相似率分別為89.4%和89.0%。結(jié)論為進一步研究中華按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子機制奠定了基礎。
【作者單位】: 重慶師范大學生命科學學院 昆蟲與分子生物學研究所;
【關鍵詞】: 細胞色素P 中華按蚊 CYPP 鑒定 生物信息學分析
【基金】:美國國立衛(wèi)生研究院NIH項目(R01AI095184) 國家自然科學基金(31071968,31372265) 重慶市科技攻關重點項目(CSTC2012GG.YYJSB80002) “兩江學者”計劃專項經(jīng)費~~
【分類號】:R384.1
【正文快照】: 中華按蚊(Anopheles sinensis)是我國和東南亞地區(qū)瘧疾的主要傳播媒介[1],廣泛分布于阿富汗到中國東北,以及韓國、日本、中國臺灣,南至印度尼西亞西部的廣大地區(qū)[2]。21世紀初,瘧疾曾在我國中部大面積暴發(fā)流行;2006年瘧疾發(fā)病達64 178例[3];瘜W殺蟲劑滅蚊是防治瘧疾的重要措
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前9條
1 艾均文;董元凌;孔衛(wèi)青;楊金宏;劉勁;張永亮;張學松;柳照應;朱勇;;家蠶細胞色素P450基因CYP6AE2的分子克隆與序列分析[J];蠶業(yè)科學;2007年03期
2 艾均文;王根洪;李艷紅;余泉友;張學松;朱勇;向仲懷;;家蠶P450基因CYP18A1的克隆、序列分析及轉(zhuǎn)錄活性[J];昆蟲學報;2008年03期
3 曾媛琴;徐康隆;鄒勇;張金葉;張春冬;杜文華;隆耀航;米智;朱勇;;家蠶細胞色素P450基因Bmcyp6u1的克隆、序列分析與表達譜[J];昆蟲學報;2010年11期
4 艾均文;董元凌;孔衛(wèi)青;楊金宏;張學松;柳照應;張永亮;朱勇;;細胞色素P450新家族的第一個基因CYP337A1的分子克隆與序列分析[J];西南大學學報(自然科學版);2008年02期
5 公茂慶;顧燕;胡小邦;孫艷;李秀蘭;馬磊;孫立新;孫靜;錢瑾;朱昌亮;;淡色庫蚊細胞色素P450基因的克隆、序列分析及表達差異的鑒定[J];中國病原生物學雜志;2007年01期
6 朱昌亮,吳觀陵,張兆松;昆蟲細胞色素P450分子生物學研究進展[J];中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志;1999年01期
7 王金福,,陸紹紅,陳健行,沈慧英;中華按蚊對擬除蟲菊酯抗擊倒因子分布頻率的研究[J];中國媒介生物學及控制雜志;1996年03期
8 李秀蘭,滕達,孫艷,馬磊,朱昌亮;淡色庫蚊細胞色素P450 CYP4E2r6基因的克隆、表達及鑒定[J];中國人獸共患病雜志;2005年07期
9 徐鐵龍;鄭彬;;按蚊擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性相關分子機理的研究進展[J];中國病原生物學雜志;2012年07期
【共引文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 符穩(wěn)群;吳克強;張美;段俊;;水稻組蛋白脫乙酰化酶SIR2的功能注釋分析[J];安徽農(nóng)業(yè)大學學報;2008年01期
2 張紅英,赤國彤,張金林;昆蟲解毒酶系與抗藥性研究進展[J];河北農(nóng)業(yè)大學學報;2002年S1期
3 徐生才;趙華強;李兵;沈衛(wèi)德;;野桑蠶細胞色素P450基因CYP9A20V1的克隆與序列分析[J];蠶業(yè)科學;2009年02期
4 曾媛琴;米智;隆耀航;杜文華;朱勇;;家蠶細胞色素P450基因Bmcyp6A8的克隆及序列與表達分析[J];蠶業(yè)科學;2010年03期
5 阮成龍;米智;朱勇;;昆蟲抗藥性機制研究進展[J];蠶業(yè)科學;2012年02期
6 宋麗麗;賀熱情;黃星群;謝敏敏;趙小英;劉選明;;甘藍型油菜BnCYP78A8的克隆及序列分析[J];西北植物學報;2012年04期
7 劉月鋒;金道超;李尚偉;;稻縱卷葉螟P450基因CYP6K1的克隆與序列分析[J];貴州農(nóng)業(yè)科學;2011年05期
8 張秀娟;楊冠宇;石蕊;韓曉敏;王瑞剛;李國婧;;擬南芥類受體蛋白激酶基因CRK45對外源鈣離子的響應[J];西北植物學報;2012年09期
9 阮成龍;米智;杜文華;李冠楠;隆耀航;朱勇;;氟化物對不同抗性家蠶品種的GST和AChE酶活性影響及雌雄個體間的酶活性差異[J];蠶業(yè)科學;2012年05期
10 蒲紅雙;高祥剛;侯紅漫;赫崇波;張振宇;史井運;;甲殼動物蛻皮相關基因的研究進展[J];水產(chǎn)科學;2015年06期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 吳穎;遼東id木三萜皂苷合成相關基因克隆及功能研究[D];吉林大學;2011年
2 李飛;棉蚜的殺蟲劑神經(jīng)靶標分子生物學研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2003年
3 馬洪麗;水稻穗頸伸長基因EUI1的精細定位與候選基因的克隆[D];福建農(nóng)林大學;2004年
4 劉澤文;褐飛虱對吡蟲啉的抗性及其機理研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2004年
5 劉惠君;酰胺類除草劑的生物化學行為以及手性選擇性行為研究[D];浙江大學;2005年
6 黃劍;小菜蛾抗阿維菌素品系細胞色素P450的研究[D];西北農(nóng)林科技大學;2005年
7 趙利輝;交鏈孢菌激活蛋白激發(fā)水稻的應答基因與抗病性分析[D];中國農(nóng)業(yè)科學院;2006年
8 宋春滿;云南煙蚜抗藥性的監(jiān)測及抗性機制研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2005年
9 鄒華文;玉米鹽誘導蛋白激酶基因ZmPti1、ZmSPK1和ZmASK1的克隆及功能分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2006年
10 王雅英;植物交替氧化酶(AOX)大腸桿菌超量表達及從斑葉阿若母(Arum maculatum)分離純化天然AOX[D];廈門大學;2006年
【二級參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 曾媛琴;米智;隆耀航;杜文華;朱勇;;家蠶細胞色素P450基因Bmcyp6A8的克隆及序列與表達分析[J];蠶業(yè)科學;2010年03期
2 劉小麗;植物蛋白質(zhì)激酶和MAPK信號傳遞系統(tǒng)[J];河北師范大學學報;2001年03期
3 李斌,夏慶友,魯成,周澤揚,向仲懷;家蠶細胞色素P450的基因組學分析[J];中國科學C輯:生命科學;2004年06期
4 黃俊勇,冷欣夫;溴氰菊酯對家蠅細胞色素P-450含量的影響[J];昆蟲學報;1992年03期
5 邱星輝,冷欣夫;棉鈴蟲幼蟲中腸微粒體P450差光譜與O-脫甲基酶的酶學特征及其可誘導性[J];昆蟲學報;1999年04期
6 邱星輝;;殺蟲劑抗性:遺傳學、基因組學及應用啟示[J];昆蟲學報;2005年06期
7 岳麗娜;楊亦樺;武淑文;吳益東;;棉鈴蟲P450基因CYP6AE12和CYP9A18的克隆與mRNA表達水平[J];昆蟲學報;2007年03期
8 陳言群,楊帆,孫耘芹;艾氏劑環(huán)氧化酶及細胞色素P-450對小菜蛾抗藥性發(fā)展的影響[J];昆蟲學報;1994年03期
9 翟啟慧;昆蟲分子生物學的一些進展:殺蟲劑抗性的分子基礎[J];昆蟲學報;1995年04期
10 康巧華,陳年春,周順伍,齊順章;用低G/C%含量引物通過PCR擴增家蠅細胞色素P-450 cDNA[J];昆蟲學報;1998年03期
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 王興相,張軍;中華按蚊(A.hyrcanus var.sinensis)室外叮刺活動及光線溫濕度降雨等因素對它的影響[J];昆蟲學報;1957年04期
2 慈玉盛,朱興邦;湘西中華按蚊產(chǎn)卵、變態(tài)與氣溫關系初步觀察[J];昆蟲學報;1958年04期
3 劉恩溥,陳健行;浙江嘉興中華按蚊越冬的觀察[J];昆蟲學報;1959年01期
4 張本華,甄樂齊,沈繼楨,王淑蓀,顧奰楠;南京地區(qū)中華按蚊種型的初步調(diào)查[J];動物學報;1960年01期
5 陳健行;低溫對兩種類型中華按蚊卵的影響的初步觀察[J];昆蟲學報;1960年01期
6 何桂銘,柯小麟,容t
本文編號:992308
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/binglixuelunwen/992308.html