本文關(guān)鍵詞：全基因測序法分析肺炎克雷伯菌JM45株對喹諾酮類藥物耐藥基因

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【摘要】：目的分析泛耐藥肺炎克雷伯菌JM45株攜帶的喹諾酮類藥物耐藥基因,研究其對喹諾酮類藥物的耐藥機(jī)制。方法采用Roche454高通量測序技術(shù)對肺炎克雷伯菌JM45株做全基因組測序(完成圖),分析喹諾酮類耐藥基因攜帶狀況,再將gyrA與parC全長基因與其他6株肺炎克雷伯菌做分子進(jìn)化分析。結(jié)果最終得到JM45株一條完整的基因組(染色體)序列及兩條質(zhì)粒序列;基因組(染色體)序列大小為5 273 812bp(GC含量65.8%),質(zhì)粒1序列大小為317 156bp(GC含量53.0%),質(zhì)粒2序列大小為12 209bp(GC含量55.3%);在基因組(染色體)序列中攜帶了gyrA基因(全基因組Feature ID:KPN_1614),parC基因(Feature ID:KPN_0743);與肺炎克雷伯菌喹諾酮類藥物敏感株相比較,gyrA基因第83位密碼子由TCC→ATC,翻譯成氨基酸序列后絲氨酸(Ser)→異亮氨酸(Ile),parC基因第80位密碼子由AGC→ATC,翻譯成氨基酸序列后絲氨酸(Ser)→異亮氨酸(Ile)。結(jié)論肺炎克雷伯菌JM45株喹諾酮類藥物耐藥是gyrA基因和parC基因喹諾酮耐藥決定區(qū)(QRDR)突變所致;gyrA與parC全長基因的分子進(jìn)化分析提示JM45株與肺炎克雷伯菌HS11286關(guān)系最為接近(序列相同),與肺炎克雷伯菌342關(guān)系最遠(yuǎn)。
【作者單位】： 杭州市余杭區(qū)中醫(yī)院檢驗(yàn)科;寧波市第一醫(yī)院檢驗(yàn)科;浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院傳染病診治國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 肺炎克雷伯菌 泛耐藥 全基因組測序 完成圖 喹諾酮類
【基金】：國家“十一五”科技重大專項(xiàng)基金項(xiàng)目(2008ZX100-03-004) 杭州市科技計(jì)劃引導(dǎo)基金資助項(xiàng)目(2012028)
【分類號】：R346
【正文快照】： 據(jù)衛(wèi)生部全國細(xì)菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)(MOHNARIN)的雙年度監(jiān)測報(bào)告(2009-2010年),肺炎克雷伯菌(KPN)的臨床分離率僅次于大腸埃希菌而居第2位。產(chǎn)ESBLs已占48.9%,產(chǎn)ESBLs KPN對環(huán)丙沙星的耐藥率已達(dá)30.8%。國內(nèi)雖然已有多個(gè)喹諾酮類藥物作用靶位細(xì)菌DNA回旋酶A亞單位編碼基因(gyrA)和拓

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4 陳楠;歐z延

本文編號：928300