本文關(guān)鍵詞：PLS-DA模型四種診斷統(tǒng)計量在代謝組學應用中的比較

  更多相關(guān)文章： PLS-DA 代謝組學 診斷統(tǒng)計量 雙重交叉驗證 置換檢驗

【摘要】：目的比較PLS-DA模型四種診斷統(tǒng)計量在代謝組學數(shù)據(jù)分析中的檢驗效能和穩(wěn)定性。方法采用雙重交叉驗證和置換檢驗的PLS-DA模型驗證策略,并分別使用四種診斷統(tǒng)計量對模擬數(shù)據(jù)和實際數(shù)據(jù)進行分析。結(jié)果AUC統(tǒng)計量較誤判數(shù)(率)、Q2和DQ2統(tǒng)計量具有更高的檢驗效能;同時,AUC統(tǒng)計量與其他三種診斷統(tǒng)計量相比較,具有更高的穩(wěn)定性。結(jié)論 AUC統(tǒng)計量是PLS-DA模型驗證過程中一種穩(wěn)定有效的診斷統(tǒng)計量,推薦作為代謝組學研究中進行PLS-DA分析時的首選診斷統(tǒng)計量。
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學衛(wèi)生統(tǒng)計學教研室;
【關(guān)鍵詞】： PLS-DA 代謝組學 診斷統(tǒng)計量 雙重交叉驗證 置換檢驗
【基金】：國家支撐項目資助(2011BAI09B02) 國家自然科學基金(81172767)
【分類號】：R311
【正文快照】： 近年來,偏最小二乘判別分析(PLS-DA)在高維組學數(shù)據(jù)分析中應用十分普遍,特別在代謝組學領(lǐng)域,已成為一種常用的數(shù)據(jù)分析方法[1-2]。PLS-DA是一種集合了主成分分析、典型相關(guān)分析和多元線性回歸特點的數(shù)據(jù)分析方法,與主成分分析相同的是都試圖提取出反映數(shù)據(jù)變異的最大信息,但主

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 李康,林一帆;評價判別模型診斷效果的ROC分析[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計;1996年03期

2 蔣紅衛(wèi);夏結(jié)來;李園;于莉莉;;偏最小二乘判別分析在基因微陣列分型中的應用[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計;2007年04期

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 高峰,彭悴,王仁安;受試者特征曲線評價心肌酶譜對急性心肌梗死的診斷價值[J];北京醫(yī)科大學學報;1998年04期

2 周健;成浩;王麗鴛;薛鳳仁;何孝延;徐錦斌;賀巍;;基于杠桿率校正的PLS-DA法對正半巖武夷巖茶的識別研究[J];茶葉科學;2009年01期

3 黃唯,龔飛躍;血清生化指標對乙型肝炎肝硬化的診斷價值[J];第一軍醫(yī)大學學報;2002年11期

4 高海龍;李小昱;徐森淼;陶海龍;李曉金;孫金風;;透射和反射高光譜成像的馬鈴薯損傷檢測比較研究[J];光譜學與光譜分析;2013年12期

5 潘寶駿,張錫彬,劉少娟,闕少聰;SPSS中的ROC分析用于檢驗/診斷方法的評價[J];海峽預防醫(yī)學雜志;2003年03期

6 李康;魏韋;王濱友;趙亞雙;;醫(yī)學診斷試驗評價的ROC分析——重復測量診斷數(shù)據(jù)的ROC曲線[J];中國醫(yī)院統(tǒng)計;2001年01期

7 鄒莉玲,余小金,閔捷,沈其君;ROC曲線在醫(yī)學診斷中的應用與進展[J];東南大學學報(醫(yī)學版);2003年01期

8 高海龍;李小昱;徐森淼;黃濤;陶海龍;李曉金;;馬鈴薯黑心病和單薯質(zhì)量的透射高光譜檢測方法[J];農(nóng)業(yè)工程學報;2013年15期

9 王成崗;韓冰冰;王媛;王世軍;;偏最小二乘判別分析在虛寒證、虛熱證動物模型評價中的應用[J];遼寧中醫(yī)雜志;2014年06期

10 齊方;容蓉;薛付忠;;貝葉斯網(wǎng)絡模型在中藥整體藥性特征分析中的應用[J];山東大學學報(醫(yī)學版);2011年05期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 郝艷紅;吳維超;吳擁軍;吳逸明;;基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡的熒光光譜和腫瘤標志聯(lián)合檢測在肺癌診斷中的應用[A];中國毒理學會生化與分子毒理專業(yè)委員會第六屆全國學術(shù)會議、中國毒理學會遺傳毒理專業(yè)委員會第五屆全國學術(shù)會議、廣東省預防醫(yī)學會衛(wèi)生毒理專業(yè)委員會學術(shù)會議、廣東省環(huán)境誘變劑學會學術(shù)會議論文匯編[C];2008年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 徐兆華;基因芯片數(shù)據(jù)統(tǒng)合分析方法的若干拓展[D];浙江大學;2010年

2 張明錦;基于特征選擇的多變量數(shù)據(jù)分析方法及其在譜學研究中的應用[D];華東理工大學;2011年

3 鄧偉;BP神經(jīng)網(wǎng)絡構(gòu)建與優(yōu)化的研究及其在醫(yī)學統(tǒng)計中的應用[D];復旦大學;2002年

4 高旭;基于美國樣本資料的Partin tables用于國人前列腺癌病理特征預測的準確性研究[D];第二軍醫(yī)大學;2006年

5 宇傳華;ROC分析方法及其在醫(yī)學研究中的應用[D];第四軍醫(yī)大學;2000年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 程楓;50歲及以上婦女骨質(zhì)疏松篩檢工具的評價及建立[D];四川大學;2007年

2 郭漢斌;糞便鈣衛(wèi)蛋白診斷大腸癌相關(guān)研究[D];山西醫(yī)科大學;2009年

3 單連峰;基因芯片數(shù)據(jù)分析方法的比較研究[D];中國醫(yī)科大學;2009年

4 吳維超;基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡的熒光光譜和腫瘤標志聯(lián)合檢測在肺癌診斷中的應用[D];鄭州大學;2008年

5 蔣映雪;應用ROC曲線評價妊娠肝內(nèi)膽汁淤積癥中幾項生化指標的價值[D];重慶醫(yī)科大學;2012年

6 張新新;基于多維多息指紋圖譜的中藥藥性特征標記模式識別研究[D];山東大學;2012年

7 陳永堅;基于拉曼光譜的茶氨酸研究及茶葉種類判別分析[D];福建師范大學;2012年

8 楊夫芳;基于SVM-RFE的濾噪算法及不平衡問題的研究[D];大連理工大學;2013年

【二級參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 蔣紅衛(wèi),夏結(jié)來;偏最小二乘回歸及其應用[J];第四軍醫(yī)大學學報;2003年03期

2 李康;郭祖超;胡琳;徐勇勇;;有序分類數(shù)據(jù)的累積比數(shù)模型分析方法[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計;1993年04期

3 蔣紅衛(wèi) ,夏結(jié)來 ,余莉莉;偏最小二乘回歸的離群點檢測方法[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計;2004年03期

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張慶全,邵昌美,孫敬忠;衛(wèi)生檢驗中統(tǒng)計量與臨界值近似相等的差異顯著性問題[J];臨沂醫(yī)專學報;1997年02期

2 王潔貞,韓兢,劉言訓,丁守鑾;Kappa統(tǒng)計量在一致性和重現(xiàn)性檢驗中的應用[J];山東醫(yī)科大學學報;1996年03期

3 項永兵,高玉堂,詹紹康,金凡;Wilcoxon型趨勢檢驗統(tǒng)計量及其應用[J];數(shù)理醫(yī)藥學雜志;1995年02期

4 ;衛(wèi)生統(tǒng)計[J];中國醫(yī)學文摘.衛(wèi)生學;2000年05期

5 彭榮;對連鎖分析中的一個檢驗統(tǒng)計量的改進[J];中南林學院學報;2004年04期

6 王駿,馬林茂;Logistic回歸診斷及SAS實現(xiàn)[J];數(shù)理醫(yī)藥學雜志;2005年01期

7 ;在審校中常見的易混淆的名詞[J];成都醫(yī)學院學報;2010年02期

8 ;在審校中常見的易混淆的名詞[J];成都醫(yī)學院學報;2010年03期

9 李宗學,高娃,賈海鷹,伊仁太;二維表對數(shù)線性模型分析和熵的分解[J];數(shù)理醫(yī)藥學雜志;2001年05期

10 顧榮炎;;推斷統(tǒng)計之四:兩校預防近視眼工作誰作得好?——其他參數(shù)的假設(shè)檢驗[J];上海教育;1995年06期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 余紅梅;王彤;劉桂芬;王琳娜;張巖波;仇麗霞;趙晉芳;;Cox回歸模型診斷及其醫(yī)學應用研究報告[A];2005—2006山西省統(tǒng)計科研成果匯編[C];2006年

2 荀鵬程;陳峰;董晨;錢國華;賴德建;孟繼宏;;HEV基因分型代表性片段篩選的記分法[A];中國現(xiàn)場統(tǒng)計研究會第十三屆學術(shù)年會論文集[C];2007年

3 馬寧;張正國;;小樣本基因芯片實驗中基因選擇算法評估[A];自主創(chuàng)新與持續(xù)增長第十一屆中國科協(xié)年會論文集（3）[C];2009年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 向陽;基于熵的關(guān)于人類數(shù)量性狀位點定位的統(tǒng)計方法研究[D];中南大學;2008年

2 丁克越;不同單倍型塊定義在單倍型塊結(jié)構(gòu)推斷與htSNPs選擇中的效應[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2004年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 張霄帥;疾病遺傳網(wǎng)絡構(gòu)建中兩整體基因之間共關(guān)聯(lián)作用的統(tǒng)計推斷方法研究[D];山東大學;2012年

2 柳剛;406例漢族人指紋、血型和指別的相關(guān)性分析[D];華中師范大學;2002年

，

本文編號：902871