本文關(guān)鍵詞：PLS-DA模型四種診斷統(tǒng)計(jì)量在代謝組學(xué)應(yīng)用中的比較

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【摘要】：目的比較PLS-DA模型四種診斷統(tǒng)計(jì)量在代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析中的檢驗(yàn)效能和穩(wěn)定性。方法采用雙重交叉驗(yàn)證和置換檢驗(yàn)的PLS-DA模型驗(yàn)證策略,并分別使用四種診斷統(tǒng)計(jì)量對(duì)模擬數(shù)據(jù)和實(shí)際數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。結(jié)果AUC統(tǒng)計(jì)量較誤判數(shù)(率)、Q2和DQ2統(tǒng)計(jì)量具有更高的檢驗(yàn)效能;同時(shí),AUC統(tǒng)計(jì)量與其他三種診斷統(tǒng)計(jì)量相比較,具有更高的穩(wěn)定性。結(jié)論 AUC統(tǒng)計(jì)量是PLS-DA模型驗(yàn)證過程中一種穩(wěn)定有效的診斷統(tǒng)計(jì)量,推薦作為代謝組學(xué)研究中進(jìn)行PLS-DA分析時(shí)的首選診斷統(tǒng)計(jì)量。
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： PLS-DA 代謝組學(xué) 診斷統(tǒng)計(jì)量 雙重交叉驗(yàn)證 置換檢驗(yàn)
【基金】：國(guó)家支撐項(xiàng)目資助(2011BAI09B02) 國(guó)家自然科學(xué)基金(81172767)
【分類號(hào)】：R311
【正文快照】： 近年來,偏最小二乘判別分析(PLS-DA)在高維組學(xué)數(shù)據(jù)分析中應(yīng)用十分普遍,特別在代謝組學(xué)領(lǐng)域,已成為一種常用的數(shù)據(jù)分析方法[1-2]。PLS-DA是一種集合了主成分分析、典型相關(guān)分析和多元線性回歸特點(diǎn)的數(shù)據(jù)分析方法,與主成分分析相同的是都試圖提取出反映數(shù)據(jù)變異的最大信息,但主

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【相似文獻(xiàn)】

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