本文關(guān)鍵詞：CODEHOP RT-PCR技術(shù)在黃病毒屬病毒篩查中應用

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【摘要】：為了探討CODEHOP RT-PCR技術(shù)在黃病毒屬病毒篩查中的應用效果,根據(jù)GenBank發(fā)表的不同黃病毒多聚蛋白氨基酸序列,利用CODEHOP方法設計合成一對簡并引物,用一步RT-PCR對乙型腦炎病毒株JEV1201、登革熱病毒株JKD001和黃熱疫苗YV6161進行檢測,擴增產(chǎn)物測序后進行BLAST同源性比對和系統(tǒng)分生分析。結(jié)果顯示該方法可以特異的對黃病毒進行擴增,目的片段的大小和序列與預期結(jié)果相符,JEV1201與乙腦病毒株YL2009-4/YC2009-3同源性最為接近,位于乙腦病毒株進化樹分支。JKD001與登革熱病毒株DENV-2/ID/1022DN/1975同源性最為接近,位于登革熱病毒株進化樹分支。YV6161與黃熱病病毒株17D同源性最為接近,位于黃熱病病毒株進化樹分支。由此可知CODEHOP RT-PCR技術(shù)可以被有效的用于對黃病毒屬病毒的篩查、種類鑒定和分子溯源。
【作者單位】： 大榭出入境檢驗檢疫局;中國檢驗檢疫科學研究院;
【關(guān)鍵詞】： 黃病毒 檢測 CODEHOP RT-PCR
【分類號】：R373.9
【正文快照】： 黃熱病病毒屬病毒(Flavivirus)簡稱黃病毒,是黃病毒科的最大家族,已知由70多種病毒構(gòu)成,其中40多種病毒與人類疾病相關(guān),包括登革病毒(Dengue virus,DENV)、乙型腦炎病毒(Japaneseencephalitis virus,JEV)、蜱傳腦炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV)、西尼羅病毒(West

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