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人博卡病毒2基因組擴增及序列分析

發(fā)布時間:2017-09-08 22:42

  本文關(guān)鍵詞:人博卡病毒2基因組擴增及序列分析


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【摘要】:為獲得人博卡病毒2(Human bocavirus 2,HBoV2)基因組序列,以2010年HBoV2單陽糞便標(biāo)本為材料,PCR方法擴增HBoV2基因組不同區(qū)域,經(jīng)序列拼接后得到5444bp的全基因組序列(HBoV2-NC)。系統(tǒng)進化分析顯示,HBoV2-NC與蘭州株HBoV2親緣關(guān)系最近;DINAMelt末端回文結(jié)構(gòu)預(yù)測證實,HBoV2-NC 5′末端存在反向互補序列,具有典型的細小病毒末端的莖環(huán)樣結(jié)構(gòu);接頭法PCR擴增得到HBoV2-NC部分末端側(cè)翼序列。
【作者單位】: 蘭州大學(xué)第一醫(yī)院;南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京兒童醫(yī)院;中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所衛(wèi)生部病毒病防治重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】人博卡病毒 基因組擴增 進化分析
【分類號】:R373.9
【正文快照】: 人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)隸屬細小病毒科博卡病毒屬,無包膜的、具有二十面體結(jié)構(gòu)的衣殼蛋白,基因組為單鏈、線型DNA[1-2]。HBoV目前劃分為HBoV1-4型[1,3-5],全基因組序列最長的HBoV為HBoV1,長5 543bp。HBoV2是在腹瀉標(biāo)本中檢出率較高的HBoV,檢出率為9%~26%[4,6],然而

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 李紅學(xué);李武平;;人類博卡病毒的研究進展[J];中國輸血雜志;2014年03期

2 Zenghui Xu;Chuanyin Shi;Qijun Qian;;Scalable manufacturing methodologies for improving adeno-associated virus-based pharmaprojects[J];Chinese Science Bulletin;2014年16期

3 趙百慧;王春;滕崢;沈佳仁;高燁;俞雪蓮;張泓;張曦;;兒童下呼吸道人類博卡病毒感染的病毒載量和疾病嚴重程度相關(guān)性研究[J];檢驗醫(yī)學(xué);2013年11期

4 陳惠芳;姚月嫻;鄭雪燕;黃燕惠;熊益權(quán);陳清;俞守義;;人類博卡病毒感染與急性胃腸炎發(fā)生風(fēng)險的Meta分析[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2013年11期

5 王媛;董衍明;易千慧;趙丹;李毅;;人細小病毒B19 VP1u多克隆抗體的制備及其保守區(qū)外N端氨基酸對sPLA2活性影響的初步研究[J];微生物學(xué)通報;2014年02期

6 周濤;楊晶艷;杜曉昕;陳凡;董澤豐;劉娛;許欣;裴曉方;;成都地區(qū)兒童腹瀉癥候群人博卡病毒監(jiān)測及基因變異分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2014年03期

7 鄧中華;曹友德;段招軍;廖楚舒;;人博卡病毒VP2病毒樣顆粒的表達、純化及鑒定[J];中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志;2014年14期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 趙慧;兒童腹瀉相關(guān)的人博卡病毒2型的初步研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 曹海燕;蘭州地區(qū)2010-2011年呼吸道感染住院患兒病原學(xué)研究[D];蘭州大學(xué);2013年

2 張宏彪;豬博卡病毒在我國部分地區(qū)的分子流行病學(xué)調(diào)查及其熒光定量PCR方法的建立與應(yīng)用[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

3 郝瑞;呼吸道感染住院兒童中HBoV1的流行情況及其基因突變與病毒載量關(guān)系研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2013年

4 孔雯驊;武漢地區(qū)人偏肺病毒的分子流行病學(xué)研究[D];華中科技大學(xué);2013年

【相似文獻】

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 何彪;楊凡力;涂長春;;中國蝙蝠病毒宏基因組學(xué)研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會第三次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2012年

2 李芳;孫玉寧;張茜;蘆曉紅;;博卡病毒MVC在不同種屬細胞系病毒基因組復(fù)制及感染特性分析[A];中國的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進步推動中國西部經(jīng)濟與社會發(fā)展——2011年中國遺傳學(xué)會大會論文摘要匯編[C];2011年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 程衛(wèi)霞;博卡病毒流行病學(xué)、致病性及基因進化研究[D];蘭州大學(xué);2011年

2 魏茂提;我國部分地區(qū)呼吸系統(tǒng)病毒性病原體監(jiān)測研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2011年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 焦洋;豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬博卡病毒多重PCR檢測方法的建立[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

2 楊凡力;中緬邊境地區(qū)蝙蝠新型病毒的檢測與鑒定[D];吉林大學(xué);2013年



本文編號:816757

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