本文關(guān)鍵詞：高脂血癥長爪沙鼠模型的轉(zhuǎn)錄組檢測和代謝性炎癥通路的初步研究

  更多相關(guān)文章： 長爪沙鼠 高脂血癥 二代測序技術(shù) 轉(zhuǎn)錄組 代謝性炎癥通路

【摘要】：目的研究飲食誘發(fā)的高脂血癥長爪沙鼠模型的關(guān)鍵基因及代謝性炎癥通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法利用RNA-Seq測序技術(shù)及生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)正常組與模型組兩個(gè)RNA池進(jìn)行測序和分析。結(jié)果 De novo拼接后獲得有效長爪沙鼠基因47 522個(gè)(即≥100 bp的unigene),大小26.9 Mb,與GenBank中現(xiàn)有的基因比對(duì)結(jié)果表明,約82.53%的序列與基因組上的外顯子序列同源;誘發(fā)高脂血癥動(dòng)物與正常動(dòng)物之間共獲得21 125個(gè)差異基因,其中16 087個(gè)下調(diào),5 038個(gè)上調(diào),模型組相對(duì)于正常組存在顯著的下調(diào)關(guān)系(P0.01)。其中與長爪沙鼠高脂血癥代謝性炎癥密切相關(guān)的通路有8個(gè)(P0.01),這8個(gè)通路所表達(dá)的基因中有15個(gè)與免疫和炎癥相關(guān)的基因顯著下調(diào)(P0.01)。結(jié)論 RNA-Seq測序和生物信息技術(shù)可作為研究高脂血癥動(dòng)物模型的整體基因轉(zhuǎn)錄的工具,篩選出的關(guān)鍵基因和通路可作為研究的候選基因或操作靶點(diǎn)。
【作者單位】： 浙江省醫(yī)學(xué)科學(xué)院;浙江大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 長爪沙鼠 高脂血癥 二代測序技術(shù) 轉(zhuǎn)錄組 代謝性炎癥通路
【基金】：浙江省自然科學(xué)基金(Y3080126) 浙江省級(jí)公益性技術(shù)應(yīng)用研究計(jì)劃(2011C37096) 省醫(yī)藥衛(wèi)生平臺(tái)重點(diǎn)研究計(jì)劃(2011ZDA002) 浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生優(yōu)秀青年人才基金(2007QN001) 浙江省公共科技服務(wù)計(jì)劃項(xiàng)目(2012F30026)
【分類號(hào)】：R-332
【正文快照】： 高脂血癥是由脂肪代謝或運(yùn)轉(zhuǎn)異常使血漿中一種或幾種脂質(zhì)高于正常的癥狀。流行病學(xué)調(diào)查表明,高脂血癥是誘發(fā)動(dòng)脈粥樣硬化、冠心病、高血壓、糖尿病、胰腺炎、癌癥等多種疾病的主要危險(xiǎn)因素之一[1]。2002年全國第四次營養(yǎng)調(diào)查研究覆蓋了全國31個(gè)省市,根據(jù)調(diào)查的數(shù)據(jù)估計(jì),全國血

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本文編號(hào)：630414