隨著人類基因組計劃的完成,蛋白質(zhì)組學(xué)已成為后基因組時期的國際主攻領(lǐng)域,是生命科學(xué)的新的生長與發(fā)展點。質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展使得shotgun MS/MS成為蛋白質(zhì)組學(xué)的核心技術(shù),特別對于蛋白質(zhì)復(fù)合物的鑒定,蛋白質(zhì)互聯(lián)網(wǎng)的解析,信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的分析,代謝途徑的重構(gòu)以及細(xì)胞行為的模擬等方面會有重大的應(yīng)用。利用串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行蛋白質(zhì)鑒定是這些應(yīng)用的基礎(chǔ),因而也是極富挑戰(zhàn)性的課題。 用串聯(lián)質(zhì)譜(tandem mass spectrometry, MS/MS)可以進(jìn)行多肽的從頭測序(de novo sequencing),并搜索數(shù)據(jù)庫以鑒定蛋白質(zhì)。我們用圖論以及實驗譜-理論譜聯(lián)配(alignment)的方法對串聯(lián)質(zhì)譜得到的實驗譜進(jìn)行從頭解析,得到了可靠的多肽序列,并應(yīng)用到數(shù)據(jù)庫搜索中鑒定了相應(yīng)的蛋白質(zhì)。同時,還用統(tǒng)計的方法對SwissProt以及TrEMBL蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了詳細(xì)的分析。結(jié)果表明,3個四肽或者2個五肽或者1個八肽一般可以唯一地確定一個蛋白質(zhì)。 目前,已有多種對串聯(lián)質(zhì)譜與數(shù)據(jù)庫中多肽的理論譜的一致性進(jìn)行評估的高通量計量算法用于鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)(shotgun...

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-6鑒定到的酵母蛋白質(zhì)組和預(yù)測的酵母蛋白質(zhì)組的CAI分布

第二章蛋白質(zhì)復(fù)雜體系分級及鑒定方法的研究第一節(jié)采用液相等電聚焦與二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用方法進(jìn)行大規(guī)模的蛋白質(zhì)分級及鑒定LIEF-2D-LC-MS/MS方法中所鑒定到的蛋白質(zhì)的CAI值主要集中在0.1-0.2之間，CAI值小于0.2的蛋白質(zhì)占61.45%（1....

圖2-11本部分實驗中鑒定到蛋白質(zhì)與Charlesriverlaboratorieswebsite發(fā)表的血漿生物標(biāo)志物進(jìn)行比較分析

白質(zhì)復(fù)雜體系分級及鑒定方法的研究及其在糖尿病相關(guān)的血清標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用蛋白質(zhì)進(jìn)行二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜分析之前應(yīng)該采用大上樣量策略，使得更多的低豐度蛋白質(zhì)被檢測到。漿中的低豐度蛋白質(zhì)和生物標(biāo)志物質(zhì)組學(xué)平臺的發(fā)展使得從臨床樣本中鑒定新的生物標(biāo)志物成將3036種鑒定到的血漿蛋白....

圖5不同產(chǎn)地、不同蜜源蜂王漿的2-DE圖譜

中國食品學(xué)報2017年第10期（d）油菜（重慶）（e）洋槐（寧夏）（f）向日葵（新疆）圖5不同產(chǎn)地、不同蜜源蜂王漿的2-DE圖譜Fig.5Imagesof2-DEofRJfromdifferentproducingareaandnectarsource3結(jié)論本研究應(yīng)用雙向電泳和M....

圖2.6可以看到，在b離子可靠性分布圖中除了有效的b離子外，還有很

econstructionofpeptidesequenceVLPVPQKfromN-terminalreliability可以看到，在b離子可靠性分布圖中除了有效的b離子位點，這必然導(dǎo)致除了重建出真實序列外，還有很多序列排名前10位見表2.5（共得....

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