隨著人類基因組計劃的完成,蛋白質組學已成為后基因組時期的國際主攻領域,是生命科學的新的生長與發(fā)展點。質譜技術的飛速發(fā)展使得shotgun MS/MS成為蛋白質組學的核心技術,特別對于蛋白質復合物的鑒定,蛋白質互聯(lián)網的解析,信號轉導途徑的分析,代謝途徑的重構以及細胞行為的模擬等方面會有重大的應用。利用串聯(lián)質譜數(shù)據(jù)進行蛋白質鑒定是這些應用的基礎,因而也是極富挑戰(zhàn)性的課題。 用串聯(lián)質譜(tandem mass spectrometry, MS/MS)可以進行多肽的從頭測序(de novo sequencing),并搜索數(shù)據(jù)庫以鑒定蛋白質。我們用圖論以及實驗譜-理論譜聯(lián)配(alignment)的方法對串聯(lián)質譜得到的實驗譜進行從頭解析,得到了可靠的多肽序列,并應用到數(shù)據(jù)庫搜索中鑒定了相應的蛋白質。同時,還用統(tǒng)計的方法對SwissProt以及TrEMBL蛋白質數(shù)據(jù)庫進行了詳細的分析。結果表明,3個四肽或者2個五肽或者1個八肽一般可以唯一地確定一個蛋白質。 目前,已有多種對串聯(lián)質譜與數(shù)據(jù)庫中多肽的理論譜的一致性進行評估的高通量計量算法用于鳥槍法蛋白質組學(shotgun...

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【學位級別】：碩士

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圖2-6鑒定到的酵母蛋白質組和預測的酵母蛋白質組的CAI分布

第二章蛋白質復雜體系分級及鑒定方法的研究第一節(jié)采用液相等電聚焦與二維液相色譜串聯(lián)質譜聯(lián)用方法進行大規(guī)模的蛋白質分級及鑒定LIEF-2D-LC-MS/MS方法中所鑒定到的蛋白質的CAI值主要集中在0.1-0.2之間，CAI值小于0.2的蛋白質占61.45%（1....

圖2-11本部分實驗中鑒定到蛋白質與Charlesriverlaboratorieswebsite發(fā)表的血漿生物標志物進行比較分析

白質復雜體系分級及鑒定方法的研究及其在糖尿病相關的血清標志物發(fā)現(xiàn)中的應用蛋白質進行二維液相色譜串聯(lián)質譜分析之前應該采用大上樣量策略，使得更多的低豐度蛋白質被檢測到。漿中的低豐度蛋白質和生物標志物質組學平臺的發(fā)展使得從臨床樣本中鑒定新的生物標志物成將3036種鑒定到的血漿蛋白....

圖5不同產地、不同蜜源蜂王漿的2-DE圖譜

中國食品學報2017年第10期（d）油菜（重慶）（e）洋槐（寧夏）（f）向日葵（新疆）圖5不同產地、不同蜜源蜂王漿的2-DE圖譜Fig.5Imagesof2-DEofRJfromdifferentproducingareaandnectarsource3結論本研究應用雙向電泳和M....

圖2.6可以看到，在b離子可靠性分布圖中除了有效的b離子外，還有很

econstructionofpeptidesequenceVLPVPQKfromN-terminalreliability可以看到，在b離子可靠性分布圖中除了有效的b離子位點，這必然導致除了重建出真實序列外，還有很多序列排名前10位見表2.5（共得....

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