基于罕見(jiàn)變異體的全基因組關(guān)聯(lián)分析方法研究
本文關(guān)鍵詞:基于罕見(jiàn)變異體的全基因組關(guān)聯(lián)分析方法研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:個(gè)體的發(fā)病率是由常見(jiàn)變異體與罕見(jiàn)變異體共同復(fù)合決定的.下一代基因測(cè)序技術(shù)生成高維數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)允許一個(gè)近乎完整的遺傳變異估計(jì).下一代基因測(cè)序技術(shù)也有顯著的局限性:高錯(cuò)誤率、罕見(jiàn)變異體的豐富和大比例的缺失值.迄今,全基因組關(guān)聯(lián)檢驗(yàn)已經(jīng)成功的識(shí)別常見(jiàn)變異體與復(fù)雜性狀的關(guān)聯(lián).然而,所識(shí)別的變異體只能解釋一小部分的遺傳.缺失的遺傳信息的一個(gè)潛在來(lái)源是罕見(jiàn)變異體的貢獻(xiàn).目前,大多數(shù)現(xiàn)有的罕見(jiàn)變異體關(guān)聯(lián)分析的方法都是檢驗(yàn)帶有不同加權(quán)方案的變異體的加權(quán)組合的效果.本文中,基于最優(yōu)權(quán)重,我們提出結(jié)合最優(yōu)權(quán)重與折疊的方法.它適用于定量和定性性狀,允許協(xié)變量,并對(duì)因果變異的影響方向是穩(wěn)健的.大量的模擬研究表明本文方法的合理性和有效性.
【關(guān)鍵詞】:罕見(jiàn)變異體 關(guān)聯(lián)分析 最優(yōu)權(quán)重 折疊方法
【學(xué)位授予單位】:黑龍江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R394
【目錄】:
- 中文摘要3-4
- Abstract4-7
- 第1章 緒論7-11
- 1.1 課題背景及意義7-8
- 1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀及分析8-9
- 1.3 本文的主要研究?jī)?nèi)容9-11
- 第2章 預(yù)備知識(shí)11-18
- 2.1 遺傳學(xué)的基本概念與原理11-12
- 2.2 哈代-溫伯格平衡定律12-13
- 2.3 遺傳模型13-15
- 2.4 連鎖不平衡與關(guān)聯(lián)分析15-18
- 第3章 罕見(jiàn)變異體關(guān)聯(lián)分析方法18-32
- 3.1 單標(biāo)記檢驗(yàn)方法18-20
- 3.2 CMC檢驗(yàn)方法20-25
- 3.2.1 多標(biāo)記檢驗(yàn)方法20-23
- 3.2.2 折疊方法23-24
- 3.2.3 結(jié)合多元與折疊方法24-25
- 3.3 本文的結(jié)合最優(yōu)權(quán)重與折疊方法25-32
- 3.3.1 不基于協(xié)變量的最優(yōu)權(quán)重方法25-29
- 3.3.2 基于協(xié)變量的最優(yōu)權(quán)重方法29-31
- 3.3.3 結(jié)合最優(yōu)權(quán)重與折疊方法31-32
- 第4章 模擬研究32-37
- 4.1 模擬試驗(yàn)32-33
- 4.2 模擬結(jié)果33-37
- 結(jié)論37-39
- 參考文獻(xiàn)39-45
- 致謝45
【相似文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:基于罕見(jiàn)變異體的全基因組關(guān)聯(lián)分析方法研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號(hào):392592
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