一株引起嚴(yán)重急性呼吸道感染病例的A亞型人呼吸道合胞病毒全基因組基因特征分析
發(fā)布時間:2022-02-19 19:02
人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是導(dǎo)致兒童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根據(jù)對單克隆抗體的反應(yīng),HRSV分為A、B兩個亞型。為探討嚴(yán)重急性呼吸道感染(Severe acute respi-ratory infection,SARI)病例中HRSV全基因組基因特征,本研究對2017年河南省漯河市住院SARI病例中檢測到的1株HRSV A亞型病毒通過Sanger測序方法對其全基因組序列進(jìn)行了測定和分析。通過Sequencher 5.4.5、MEGA 5.05、BioEdit 7.0.5等生物信息學(xué)軟件進(jìn)行序列拼接和比對,進(jìn)行了基因親緣性關(guān)系分析、氨基酸變異和糖基化位點分析;贖RSV全基因組序列和11個單個蛋白基因序列構(gòu)建的親緣性關(guān)系分析結(jié)果提示本研究中檢測到的這株HRSVA病毒(RSVAs/Luohe.Henan/CHN/42.17)屬于ON1基因型,該型是我國近年流行的優(yōu)勢基因型。該病毒全基因組序列與35條全球代表株的核苷酸和氨基酸同源性分別為92.69%~99.82%和93.63%~99.67%;G蛋白編碼區(qū)...
【文章來源】:病毒學(xué)報. 2019,35(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1標(biāo)本來源
2病毒RNA提取
3 HRSV G蛋白HVR2靶基因測定
4 HRSV全基因組序列擴(kuò)增和測定
5序列分析
6全球代表株。
結(jié)果
1 RSVAs/Luohe.Henan與HRSV各個基因型代表株在HVR2區(qū)的基因親緣性關(guān)系分析
2 RSVAs/Luohe.Henan和10個基因型代表株HRSV全基因組核苷酸和氨基酸同源性分析
3 RSVAs/Luohe.Henan和35株全球代表株的核苷酸和氨基酸變異分析
4 RSVAs/Luohe.Henan病毒的G蛋白和F蛋白糖基化位點分析
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2008~2014年中國8省市流行的人呼吸道合胞病毒A亞型G蛋白編碼基因全長序列分析[J]. 宋金華,王慧玲,石晶,崔愛利,楊子峰,孫利偉,于德山,張蕾,張紅,張燕,許文波. 病毒學(xué)報. 2017(06)
[2]郴州地區(qū)5歲以下住院兒童嚴(yán)重急性呼吸道感染病毒病原學(xué)研究[J]. 吳瓊,陳禮娟,黃新泉,歐書騰,劉子菁,范楚平. 醫(yī)學(xué)理論與實踐. 2017(07)
[3]全國住院嚴(yán)重急性呼吸道感染病例哨點監(jiān)測階段性分析[J]. 彭質(zhì)斌,鄭建東,姜慧,秦穎,楊娟,余宏杰,馮錄召. 疾病監(jiān)測. 2017(01)
[4]廣州地區(qū)2011-2013年兒童呼吸道合胞病毒流行特征分析[J]. 謝嘉慧,華亮,鐘家禹,張瑩瑩,陳翊,劉曉敏,連廣琬,周珍文,朱冰. 中華生物醫(yī)學(xué)工程雜志. 2015 (03)
[5]蘇州地區(qū)5歲以下嚴(yán)重急性呼吸道感染(SARI)住院患兒的病毒病原學(xué)和臨床特征分析[J]. 江艷微,華軍,吳婧,王丹,李鶯,丁云芳,張濤,趙根明. 復(fù)旦學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(04)
本文編號:3633450
【文章來源】:病毒學(xué)報. 2019,35(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1標(biāo)本來源
2病毒RNA提取
3 HRSV G蛋白HVR2靶基因測定
4 HRSV全基因組序列擴(kuò)增和測定
5序列分析
6全球代表株。
結(jié)果
1 RSVAs/Luohe.Henan與HRSV各個基因型代表株在HVR2區(qū)的基因親緣性關(guān)系分析
2 RSVAs/Luohe.Henan和10個基因型代表株HRSV全基因組核苷酸和氨基酸同源性分析
3 RSVAs/Luohe.Henan和35株全球代表株的核苷酸和氨基酸變異分析
4 RSVAs/Luohe.Henan病毒的G蛋白和F蛋白糖基化位點分析
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2008~2014年中國8省市流行的人呼吸道合胞病毒A亞型G蛋白編碼基因全長序列分析[J]. 宋金華,王慧玲,石晶,崔愛利,楊子峰,孫利偉,于德山,張蕾,張紅,張燕,許文波. 病毒學(xué)報. 2017(06)
[2]郴州地區(qū)5歲以下住院兒童嚴(yán)重急性呼吸道感染病毒病原學(xué)研究[J]. 吳瓊,陳禮娟,黃新泉,歐書騰,劉子菁,范楚平. 醫(yī)學(xué)理論與實踐. 2017(07)
[3]全國住院嚴(yán)重急性呼吸道感染病例哨點監(jiān)測階段性分析[J]. 彭質(zhì)斌,鄭建東,姜慧,秦穎,楊娟,余宏杰,馮錄召. 疾病監(jiān)測. 2017(01)
[4]廣州地區(qū)2011-2013年兒童呼吸道合胞病毒流行特征分析[J]. 謝嘉慧,華亮,鐘家禹,張瑩瑩,陳翊,劉曉敏,連廣琬,周珍文,朱冰. 中華生物醫(yī)學(xué)工程雜志. 2015 (03)
[5]蘇州地區(qū)5歲以下嚴(yán)重急性呼吸道感染(SARI)住院患兒的病毒病原學(xué)和臨床特征分析[J]. 江艷微,華軍,吳婧,王丹,李鶯,丁云芳,張濤,趙根明. 復(fù)旦學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(04)
本文編號:3633450
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