目的克隆不可分型流感嗜血桿菌ATCC49247外膜蛋白P6基因,并對其編碼蛋白進(jìn)行分析。方法以標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC49247NTHI DNA為模板,PCR擴(kuò)增P6目的基因,構(gòu)建重組質(zhì)粒pGEX-6P2/P6并測序,利用生物信息軟件和GenBank數(shù)據(jù)庫對編碼外膜蛋白P6進(jìn)行同源性分析,預(yù)測其主要理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)功能、B細(xì)胞抗原表位和T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果 ATCC49247 P6基因核苷酸序列長度為462 bp,與不可分型流感嗜血桿菌外膜蛋白P6基因核苷酸同源性為99.17%～100%,編碼蛋白氨基酸同源性為96.18%～100%。編碼蛋白含有153個(gè)氨基酸,相對分子質(zhì)量為16.137 94×10³,等電點(diǎn)6.09,為親水性蛋白;該蛋白含有信號(hào)肽和3個(gè)結(jié)構(gòu)域,無跨膜結(jié)構(gòu)域;綜合蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)、親疏水性、柔性、表面可及性和抗原指數(shù)預(yù)測該蛋白含有6個(gè)優(yōu)勢B細(xì)胞抗原表位,有7個(gè)CTL細(xì)胞抗原表位及16個(gè)Th細(xì)胞抗原表位。結(jié)論成功克隆外膜蛋白P6基因,生物信息學(xué)方法預(yù)測分析ATCC49247外膜蛋白P6高度保守,免疫原性強(qiáng),可作為流感嗜血桿菌候選疫苗和疫苗載體。 

【文章來源】：中國病原生物學(xué)雜志. 2019,14(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1 材料
        1.1 菌株和質(zhì)粒
        1.2 試劑
    2 方法
        2.1 外膜蛋白P6重組質(zhì)粒的構(gòu)建和鑒定
        2.2 外膜蛋白P6的生物信息學(xué)分析
            2.2.1 氨基酸序列預(yù)測
            2.2.2 同源性分析
            2.2.3 基本性質(zhì)及結(jié)構(gòu)預(yù)測
            2.2.4 抗原表位預(yù)測
結(jié) 果
    1 外膜蛋白P6基因PCR擴(kuò)增及重組質(zhì)粒構(gòu)建
    2 基因測序
    3 外膜蛋白P6基因編碼蛋白生物學(xué)特征
        3.1 氨基酸序列推導(dǎo)
        3.2 同源性分析
        3.3 理化性質(zhì)
        3.4 親疏水性分析
        3.5 結(jié)構(gòu)域與信號(hào)肽預(yù)測
        3.6 跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測
        3.7 翻譯后修飾位點(diǎn)
        3.8 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
        3.9 三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
        3.10 親疏水性、表面可及性、抗原指數(shù)和柔性預(yù)測
        3.11 B抗原表位預(yù)測
        3.12 T細(xì)胞抗原表位預(yù)測
討 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3615475