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深度測序解析年齡及UCMSC治療對獼猴lncRNA的影響

發(fā)布時(shí)間:2022-01-19 10:49
  目的分析年齡和臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞(UCMSC)治療對外周血單個(gè)核細(xì)胞長鏈非編碼RNA(lncRNA)的影響。方法分別采集、分離幼年、中年、老年和老年經(jīng)UCMSC治療后的4種不同生理狀態(tài)的獼猴外周血單個(gè)核細(xì)胞,提取全基因組RNA,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,通過生物信息學(xué)比較篩選出差異lncRNA并進(jìn)行分組比較。結(jié)果幼年與老年、中年相比,單個(gè)核細(xì)胞表達(dá)上調(diào)的lncRNA分別為54和52個(gè),表達(dá)下調(diào)的lncRNA分別為49和46個(gè);中年與老年相比,表達(dá)上調(diào)和下調(diào)的lncRNA分別為48和63個(gè);老年與經(jīng)UCMSC治療組相比,表達(dá)上調(diào)和下調(diào)的lncRNA分別為41和68個(gè)。聚類分析發(fā)現(xiàn),隨年齡增長,幼年高表達(dá)lncRNA減少,而低表達(dá)lncRNA增加;UCMSC治療可使低表達(dá)lncRNA升高,而高表達(dá)lncRNA降低。結(jié)論lncRNA表達(dá)譜隨年齡的增加而改變,UCMSC治療可使衰老狀態(tài)的lncRNA表達(dá)譜趨向年輕化方向。 

【文章來源】:西南國防醫(yī)藥. 2019,29(06)

【文章頁數(shù)】:4 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及分組
    1.2 UCMSC來源及治療
    1.3 外周血單個(gè)核細(xì)胞的采集及處理
    1.4 LncRNA轉(zhuǎn)錄組測序及數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
    2.1 測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
    2.2 LncRNA類型分布及主成分分析
    2.3 基因表達(dá)量分析
    2.4 聚類分析
3 討論



本文編號:3596716

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