疾病基因密碼子使用特征分析及致病基因預(yù)測(cè)
發(fā)布時(shí)間：2021-08-17 09:16
定位候選策略是目前發(fā)現(xiàn)疾病基因的主要方法,其關(guān)鍵問(wèn)題之一是如何對(duì)采用連鎖分析等方法定位的疾病區(qū)間中數(shù)以百計(jì)的候選基因進(jìn)行致病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。有效解決這一問(wèn)題對(duì)于縮短疾病基因發(fā)現(xiàn)周期、減少花費(fèi)等都具有重要意義。越來(lái)越多的疾病基因被發(fā)現(xiàn),使得采用計(jì)算機(jī)方法從已知疾病基因中獲取知識(shí)以幫助發(fā)現(xiàn)未知疾病基因成為可能。但是,目前基于表達(dá)信息、基因功能以及疾病基因統(tǒng)計(jì)特征的三種方法都不能很好地解決這一問(wèn)題。因?yàn)榛诒磉_(dá)信息和基因功能的方法的效果嚴(yán)重依賴(lài)于表達(dá)與功能信息的完整性與準(zhǔn)確性,而目前基于疾病基因序列特征的方法僅僅考慮所有疾病基因和正�；虻男蛄刑卣髟诮y(tǒng)計(jì)水平的差異,沒(méi)有對(duì)不同的疾病區(qū)別對(duì)待。為了更好地解決這一問(wèn)題,發(fā)現(xiàn)不同疾病的致病基因所特有的序列特征是一種新的途徑。密碼子使用特征因?yàn)槠涮N(yùn)涵的豐富的生物學(xué)意義而被選作本研究重點(diǎn)挖掘的特征。一種新的方法被用來(lái)提取疾病基因中密碼子的使用特征,結(jié)果發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致同一種疾病的致病基因的密碼子使用常常表現(xiàn)出疾病特異性,即同種疾病的致病基因之間密碼子使用非常相似,而與其他基因則存在顯著差別。基于這種疾病特異的密碼子使用特征,設(shè)計(jì)了一種新的預(yù)測(cè)疾病基因的方法。對(duì)46種...
【文章來(lái)源】：華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
家族性肥厚型心肌�。▓Da）和白內(nèi)障疾�。▓Db）的疾病基因中P值小于0.01的密碼子使用頻率與CUTG中相應(yīng)密碼子平均使用頻率的比較
3．在已定位的 52 個(gè)心血管疾病區(qū)間中（涵蓋了 19 種心血管疾病），共有 25 個(gè)候選新基因落在心血管疾病定位區(qū)間并且可能與該疾病相關(guān)，被認(rèn)為是一個(gè)潛在的候選疾病基因。這些分析結(jié)果已經(jīng)提供了 web 服務(wù)（http://infosci.hust.edu.cn/），圖 4.2是 web 服務(wù)界面。
心血管疾病相關(guān)新基因數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果顯示界面
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Predicting disease genes for familial dilated cardiomyopathy based on the codon usage bias[J]. ZHOU Yanhong1,2, ZHOU Quanxiong1,2, LIU Huailan1,2 & WAN Honghui3 1. Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China; 2. Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory, Wuhan 430074, China; 3. Laboratory of Bioinformatics, Maryland Institute of Dynamic Ge-nomics, Silver Spring, MD 20906, USA. Chinese Science Bulletin. 2005(18)
[2]Identification of true EST alignments and exon regions of gene sequences[J]. ZHOU Yanhong, JING Hui, LI Yanen & LIU Huailan Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Tech- nology, Wuhan 430074, China Correspondence should be addressed to Zhou Yanhong. Chinese Science Bulletin. 2004(23)
[3]多基因遺傳病基因研究的策略和方法[J]. 張奎星,朱鼎良,黃薇. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2001(03)
[4]致病基因的定位候選克隆[J]. 沈巖. 生命科學(xué). 1999(05)
本文編號(hào)：3347499
【文章來(lái)源】：華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
家族性肥厚型心肌�。▓Da）和白內(nèi)障疾�。▓Db）的疾病基因中P值小于0.01的密碼子使用頻率與CUTG中相應(yīng)密碼子平均使用頻率的比較
3．在已定位的 52 個(gè)心血管疾病區(qū)間中（涵蓋了 19 種心血管疾病），共有 25 個(gè)候選新基因落在心血管疾病定位區(qū)間并且可能與該疾病相關(guān)，被認(rèn)為是一個(gè)潛在的候選疾病基因。這些分析結(jié)果已經(jīng)提供了 web 服務(wù)（http://infosci.hust.edu.cn/），圖 4.2是 web 服務(wù)界面。
心血管疾病相關(guān)新基因數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果顯示界面
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Predicting disease genes for familial dilated cardiomyopathy based on the codon usage bias[J]. ZHOU Yanhong1,2, ZHOU Quanxiong1,2, LIU Huailan1,2 & WAN Honghui3 1. Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China; 2. Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory, Wuhan 430074, China; 3. Laboratory of Bioinformatics, Maryland Institute of Dynamic Ge-nomics, Silver Spring, MD 20906, USA. Chinese Science Bulletin. 2005(18)
[2]Identification of true EST alignments and exon regions of gene sequences[J]. ZHOU Yanhong, JING Hui, LI Yanen & LIU Huailan Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Tech- nology, Wuhan 430074, China Correspondence should be addressed to Zhou Yanhong. Chinese Science Bulletin. 2004(23)
[3]多基因遺傳病基因研究的策略和方法[J]. 張奎星,朱鼎良,黃薇. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2001(03)
[4]致病基因的定位候選克隆[J]. 沈巖. 生命科學(xué). 1999(05)
本文編號(hào)：3347499
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