受體相互作用蛋白激酶3轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特性研究
本文關(guān)鍵詞:受體相互作用蛋白激酶3轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特性研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的:探討受體相互作用蛋白激酶3(receptor interacting protein kinase 3,RIPK3)基因啟動子功能序列與轉(zhuǎn)錄因子的相互作用及其Cp G島甲基化狀態(tài)與基因表達水平的關(guān)系。方法:(1)采用生物信息學預(yù)測并分析啟動子序列后,行啟動子缺失突變轉(zhuǎn)化分析,即PCR方法對RIPK3基因不同長度的序列片段進行擴增,以熒光素酶載體構(gòu)建質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染人胚腎細胞(293T細胞),采用化學發(fā)光儀檢測區(qū)域啟動活性,鑒定功能啟動子的可能區(qū)域。利用軟件預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,并通過突變轉(zhuǎn)化分析鑒定RIPK3基因核心轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點。(2)在293T細胞中,通過檢測過表達轉(zhuǎn)錄因子刺激蛋白1(stimulating protein 1,Sp1)/刺激蛋白3(stimulating protein 3,Sp3)和Sp1/Sp3顯性負突變體后以及基因選擇性Sp1抑制劑光神霉素處理后啟動子活性的檢測研究轉(zhuǎn)錄因子刺激蛋白家族與RIPK3啟動子之間的關(guān)系。(3)采用凝膠電泳遷移分析(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)檢測轉(zhuǎn)錄因子Sp1/Sp3與RIPK3啟動子之間的相互作用關(guān)系。(4)采用RNA干擾技術(shù)檢測轉(zhuǎn)錄因子Sp1/Sp3在293T細胞中與RIPK3啟動子的相互作用以及在人大腸癌細胞(HT-29細胞)中與RIPK3表達的作用情況。(5)采用亞硫酸氫鹽修飾后測序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)研究在表達與不表達RIPK3的細胞系中以及甲基化抑制劑處理后的不表達RIPK3的細胞系中甲基化在RIPK3基因啟動子區(qū)域的修飾情況。結(jié)果:(1)化學發(fā)光實驗表明:RIPK3基因的5'非翻譯區(qū)(5'-non-translated region,5'UTR)和轉(zhuǎn)錄起始位點(transcriptional start site,TSS)上游19個堿基片段是RIPK3基因啟動子的功能序列;缺失突變轉(zhuǎn)化分析提示該功能序列包含三個GC盒(GC box),其中第二個為RIPK3基因轉(zhuǎn)錄因子Sp1/Sp3的核心結(jié)合位點。(2)過表達研究結(jié)果表明,Sp1/Sp3對RIPK3基因啟動子活性激活起主導(dǎo)作用。(3)凝膠電泳遷移分析的結(jié)果證實轉(zhuǎn)錄因子Sp1/Sp3與GC富集區(qū)特異性相互作用。(4)Sp1小干擾RNA或Sp3小干擾RNA與RIPK3啟動子功能區(qū)和熒光素酶載體構(gòu)建的質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染293T細胞,比較得出RIPK3啟動子活性明顯減低。(5)亞硫酸氫鹽修飾后測序法實驗結(jié)果表明,在表達RIPK3的HT-29細胞系中RIPK3基因啟動子功能序列低度甲基化,在不表達RIPK3的結(jié)腸癌細胞(HCT-116細胞)中RIPK3啟動子功能序列呈現(xiàn)高度甲基化。5-氮-2'-脫氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-aza-Cd R)處理后,HCT-116細胞里RIPK3啟動子功能序列甲基化的頻率明顯下降,RIPK3表達相應(yīng)上調(diào)。結(jié)論:RIPK3基因的5'UTR及TSS上游19個堿基序列片段是RIPK3基因啟動子的功能序列。RIPK3基因的啟動活性受刺激蛋白1和刺激蛋白3劑量依賴調(diào)控。在不表達RIPK3的HCT-116里,RIPK3基因的功能啟動序列呈現(xiàn)的甲基化頻率很高。該細胞系使用5-aza-Cd R處理后,RIPK3基因的功能啟動序列呈現(xiàn)的甲基化頻率較前明顯下降,其蛋白表達相應(yīng)上調(diào)。以上結(jié)果提示,日后在治療RIPK3相關(guān)的臨床疾病過程中,我們可以嘗試通過靶向RIPK3基因,進而調(diào)控其轉(zhuǎn)錄表達,最終達到一定的治療效果。
【關(guān)鍵詞】:受體相互作用蛋白激酶3 轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié) CpG島 5-氮-2'-脫氧胞苷
【學位授予單位】:蘇州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R3416
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-9
- 前言9-11
- 材料與方法11-15
- 結(jié)果15-30
- 討論30-32
- 結(jié)論32-33
- 創(chuàng)新點33-34
- 參考文獻34-38
- 附圖38-40
- 綜述40-50
- 參考文獻46-50
- 中英文對照縮略詞表50-51
- 攻讀學位期間公開發(fā)表的論文51-52
- 致謝52-53
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