目的采用生物信息學(xué)對(duì)ROP16_Ⅰ基因轉(zhuǎn)染的A549細(xì)胞株的表達(dá)譜芯片結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,尋找影響Ⅰ型弓形蟲(chóng)疾病的差異表達(dá)基因,為揭示Ⅰ型弓形蟲(chóng)疾病的發(fā)病機(jī)制提供依據(jù)。方法通過(guò)生物信息學(xué)方法對(duì)過(guò)表達(dá)ROP16_Ⅰ的A549細(xì)胞株的表達(dá)譜進(jìn)行研究,從中篩選差異表達(dá)基因。將得到的數(shù)據(jù)導(dǎo)入在線分析工具ToppGene和STRING中對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選,同時(shí)進(jìn)行GO分析及KEGG分析。結(jié)果本研究共獲得了483個(gè)差異表達(dá)基因,其中上調(diào)的基因共有252個(gè),下調(diào)的基因共有231個(gè)。ToppGene最終篩選得到CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等14個(gè)Ι型弓形蟲(chóng)相關(guān)的基因。GO分析和KEGG分析發(fā)現(xiàn),這些候選基因與白介素IL-10、IL-4、IL-13信號(hào)通路,細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用通路及Toll樣受體信號(hào)通路等相關(guān)。在蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中,這14個(gè)候選基因恰好處于網(wǎng)絡(luò)的最核心位置。結(jié)論Ⅰ型弓形蟲(chóng)疾病的發(fā)生可能與CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等基因密切相關(guān)。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019,35(10)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

圖２Ｔｏｐｐｇｅｎｅ篩選的候選基因蛋白互作圖Ｆｉｇ．２ＰＰＩｎｅｔｗｏｒｋｏｆｔｈｅｃａｎｄｉｄａｔｅｇｅｎｅｓｓｃｒｅｅｎｅｄｆｒｏｍｔｈｅＴｏｐｐＧｅｎｅ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號(hào)：3220216