目的采用生物信息學對ROP16_Ⅰ基因轉染的A549細胞株的表達譜芯片結果進行數(shù)據挖掘,尋找影響Ⅰ型弓形蟲疾病的差異表達基因,為揭示Ⅰ型弓形蟲疾病的發(fā)病機制提供依據。方法通過生物信息學方法對過表達ROP16_Ⅰ的A549細胞株的表達譜進行研究,從中篩選差異表達基因。將得到的數(shù)據導入在線分析工具ToppGene和STRING中對差異表達基因進行篩選,同時進行GO分析及KEGG分析。結果本研究共獲得了483個差異表達基因,其中上調的基因共有252個,下調的基因共有231個。ToppGene最終篩選得到CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等14個Ι型弓形蟲相關的基因。GO分析和KEGG分析發(fā)現(xiàn),這些候選基因與白介素IL-10、IL-4、IL-13信號通路,細胞因子-細胞因子受體相互作用通路及Toll樣受體信號通路等相關。在蛋白-蛋白互作網絡中,這14個候選基因恰好處于網絡的最核心位置。結論Ⅰ型弓形蟲疾病的發(fā)生可能與CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等基因密切相關。 

【文章來源】：中國人獸共患病學報. 2019,35(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

圖２Ｔｏｐｐｇｅｎｅ篩選的候選基因蛋白互作圖Ｆｉｇ．２ＰＰＩｎｅｔｗｏｒｋｏｆｔｈｅｃａｎｄｉｄａｔｅｇｅｎｅｓｓｃｒｅｅｎｅｄｆｒｏｍｔｈｅＴｏｐｐＧｅｎｅ

【參考文獻】：
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博士論文
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本文編號：3220216