本文關(guān)鍵詞：宿主遺傳信息對腸道微生物菌落成員的影響，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：近年來,很多研究都在關(guān)注腸道菌群的定植影響因素,但是,關(guān)于遺傳因素是否起作用仍未得到一個(gè)明確的答案。大部分研究報(bào)導(dǎo),相比于其他因素(例如食物,生活方式以及年齡等),宿主遺傳信息對腸道菌群的影響較小。隨著越來越多的16S rRNA測序數(shù)據(jù)的產(chǎn)生,本文收集并重新分析了公共數(shù)據(jù)庫的16SrRNA擴(kuò)增子高通量測序數(shù)據(jù),提供樣品的個(gè)體來自五個(gè)大洲,包括亞洲人,非洲人,歐洲人,南美洲人,北美洲人,年齡從初生兒到87歲的老年人。我們的分析從腸道菌群的結(jié)構(gòu)和成員兩個(gè)方面分別進(jìn)行,揭示遺傳因素和非遺傳因素影響腸道菌群結(jié)構(gòu)和成員的程度不同,宿主遺傳信息主要控制微生物在腸道中能否定植,而非遺傳因素,例如飲食,主要調(diào)節(jié)特定微生物的含量。并且,通過比較不同哺乳動(dòng)物的腸道菌群發(fā)現(xiàn),如果哺乳動(dòng)物的基因組越接近人類,那么它們的腸道菌群成員同樣也會(huì)更加接近人類。此外,在追蹤分析不同個(gè)體腸道菌群發(fā)展過程中,我們發(fā)現(xiàn),對于健康成年人,腸道菌群成員長期穩(wěn)定,而對于嬰幼兒,腸道菌群成員隨著年齡的增長而變化。我們的工作不僅明確了遺傳因素和環(huán)境因素對腸道菌群的作用,而且指出不能直接比較遺傳因素和環(huán)境因素對腸道菌群形成的貢獻(xiàn),為理解腸道菌群多樣性和腸道菌群如何通過改變自身組成成分應(yīng)對外界環(huán)境的變化提供了新的理論基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】：腸道菌群成員 腸道菌群結(jié)構(gòu) 遺傳因素 環(huán)境因素 高通量測序
【學(xué)位授予單位】：華東師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R37
【目錄】：

• 摘要6-7
• ABSTRACT7-10
• 第一章 緒論10-12
• 第二章 腸道菌群的研究12-22
• 第一節(jié) 腸道菌群的功能12-15
• 一、腸道菌群與營養(yǎng)物質(zhì)14
• 二、腸道菌群與致病菌14
• 三、腸道菌群與免疫系統(tǒng)14-15
• 四、腸道菌群與腫瘤15
• 五、腸道菌群與炎癥性腸病15
• 六、腸道菌群與肥胖15
• 第二節(jié) 影響腸道菌群的因素15-18
• 一、飲食與腸道菌群17
• 二、遺傳信息與腸道菌群17
• 三、年齡與腸道菌群17-18
• 第三節(jié) 高通量測序技術(shù)的主要應(yīng)用范圍18-20
• 一、全基因組測序19
• 二、外顯子組測序19
• 三、轉(zhuǎn)錄組測序19
• 四、宏基因組測序19-20
• 第四節(jié) 16S rRNA測序技術(shù)20-21
• 第五節(jié) 本文研究的意義21-22
• 第三章 16S rRNA擴(kuò)增子高通量數(shù)據(jù)分析22-41
• 第一節(jié) 材料與方法22-27
• 一、16S rRNA數(shù)據(jù)集22-23
• 二、生物信息分析流程23-27
• 第二節(jié) 結(jié)果與討論27-39
• 一、腸道微生物的存在與否受遺傳信息的調(diào)控27-32
• 二、非遺傳因素對腸道菌群的影響32-36
• 三、遺傳相似性與非加權(quán)unifrac距離成正比36-37
• 四、討論37-39
• 第三節(jié) 結(jié)論39-41
• 一、結(jié)論39-40
• 二、本文的創(chuàng)新之處40
• 三、展望40-41
• 參考文獻(xiàn)41-46
• 附錄46-47
• 在學(xué)期間所取得的科研成果47-48
• 致謝48

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本文編號：314807