目的分析登革病毒1型（Dengue virus type 1,DENV-1）Ⅰ～Ⅴ基因亞型基因組全長核苷酸及氨基酸序列差異。方法通過GenBank搜索DENV-1 5個不同基因亞型的全長基因組序列,獲得其相應(yīng)的氨基酸序列。采用BIOEDIT軟件,統(tǒng)計基因亞型間核苷酸突變和氨基酸替代位點,分析其相似度,通過RNA二級結(jié)構(gòu)在線預(yù)測網(wǎng)站預(yù)測DENV-1不同亞型間3′UTR的二級結(jié)構(gòu)差異,蛋白結(jié)構(gòu)在線預(yù)測網(wǎng)站預(yù)測主要流行于中國的Ⅰ及ⅤDENV-1基因亞型結(jié)構(gòu)蛋白的二級結(jié)構(gòu),對其氨基酸組成及編碼序列中可能存在的蛋白結(jié)合區(qū)域等進(jìn)行差異分析。結(jié)果DENV-1 5個基因亞型核苷酸相似性為91. 40%～94. 50%,氨基酸序列相似性為97. 11%～98. 38%,5個基因亞型各自編碼3 392個氨基酸,其中共有195個位點有氨基酸的變化。DENV-1不同亞型的3′UTR的二級結(jié)構(gòu)各不相同。DENV-1基因型為Ⅰ、Ⅴ的775個氨基酸中占組成比例最多的均是蘇氨酸（T）,Ⅰ型可能的蛋白結(jié)合位點有26個,多聚核苷酸結(jié)合位點有9個。Ⅴ型可能的蛋白結(jié)合位點有24個,多聚核苷酸結(jié)合位點有7個。他們均有相同數(shù)量的... 

【文章來源】：中國生物制品學(xué)雜志. 2019,32(02)CSCD

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 DENV-1病毒基因組
    1.2 DENV-1亞型之間基因組核苷酸和氨基酸序列的相似度分析
    1.3 DENV-1不同亞型的3′UTR的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    1.4 DENV-1基因型為Ⅰ、Ⅴ的結(jié)構(gòu)蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2 結(jié)果
    2.1 DENV-1亞型之間基因組核苷酸和氨基酸序列的相似度分析
    2.2 DENV-1不同亞型的3′UTR的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.3 DENV-1基因型結(jié)構(gòu)蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Molecular epidemiology demonstrates that imported and local strains circulated during the 2014 dengue outbreak in Guangzhou,China[J]. Geng Li,Pan Pan,Qiuyan He,Xiujuan Kong,Kailang Wu,Wei Zhang,Yuntao Liu,Huiting Huang,Jianbo Liu,Zhongde Zhang,De Wu,Xiaoping Lai,Xiaohong Liu,Jianguo Wu.  Virologica Sinica. 2017(01)
[2]登革病毒包膜蛋白、衣殼蛋白及膜結(jié)合蛋白結(jié)構(gòu)和功能方面的研究現(xiàn)狀[J]. 閆菲菲,任楊源,周旋,趙衛(wèi).  熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2012(08)
[3]登革2型病毒中國株3′非編碼區(qū)RNA元件對翻譯的影響[J]. 尉雁,姜濤,李曉峰,趙慧,劉忠鈺,鄧永強(qiáng),劉然,秦成峰,秦鄂德.  微生物學(xué)報. 2008(05)
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博士論文
[1]登革熱病毒抗體依賴增強(qiáng)感染分子機(jī)制的體外模型研究[D]. 黃新偉.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015



本文編號：3091180