結(jié)核分枝桿菌生長緩慢,難以獲得足量的天然蛋白抗原。而利用基因工程技術(shù)制備重組蛋白抗原,存在著表達(dá)量低、不易純化,以及特異性較低等不利因素。隨著生物信息技術(shù)的發(fā)展,研究者可根據(jù)生物信息學(xué)軟件預(yù)測,選擇合成優(yōu)勢抗原肽段,而不需克隆整個蛋白,具有簡便、經(jīng)濟(jì)、特異性高等特點。因此,本研究應(yīng)用生物信息學(xué)方法,預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv1385蛋白的抗原表位并分析其優(yōu)勢表位,對了解Rv1385蛋白的免疫學(xué)特性及其與結(jié)核分枝桿菌致病的關(guān)系具有重要意義。首先,從NCBI數(shù)據(jù)庫下載Rv1385的氨基酸序列,然后采用生物信息學(xué)軟件PSIPRED Server預(yù)測蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu);BepiPred 1.0 Server和ABCpred預(yù)測該蛋白的B細(xì)胞抗原表位;BIMAS、SYFPEITHI及NetCTLpan 1.1 Server預(yù)測該蛋白的CTL表位;SYFPEITHI和NetMHCIIpan 3.2 Server預(yù)測該蛋白的Th細(xì)胞表位。最后綜合分析預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv1385的優(yōu)勢候選抗原表位。結(jié)果顯示,Rv1385蛋白二級結(jié)構(gòu)中,α螺旋占51.8%,β折疊占41.6%,無規(guī)卷曲占6.6%;共有4個B細(xì)胞抗... 

【文章來源】：生物信息學(xué). 2019,17(03)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 氨基酸序列
    1.2 Rv1385的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    1.3 Rv1385的B細(xì)胞抗原表位預(yù)測
    1.4 Rv1385的CTL抗原表位預(yù)測
    1.5 Rv1385的Th抗原表位預(yù)測
    1.6 Rv1385氨基酸序列的同源性預(yù)測
2 結(jié)果與分析
    2.1 Rv1385的二級結(jié)構(gòu)
    2.2 Rv1385的B細(xì)胞抗原表位
    2.3 Rv1385的CTL表位
    2.4 Rv1385的Th表位
    2.5 Rv1385的氨基酸序列同源性分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]結(jié)核分枝桿菌pyrF基因的生物信息學(xué)分析[J]. 黃勁,王潔,牛雪可,邱文,趙亮,王梅竹,康穎倩,馮永紅,秦蓮花.  中國病原生物學(xué)雜志. 2019(02)
[2]翻譯后修飾與結(jié)核分枝桿菌耐藥調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[J]. 謝龍祥,黨藝方,謝建平.  生物工程學(xué)報. 2018(08)
[3]結(jié)核分枝桿菌BfrB蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 袁秋露,付玉榮,伊正君.  中國病原生物學(xué)雜志. 2018(02)



本文編號：3034311