恒河猴增齡過(guò)程中miR-16-5p及靶基因在外周血白細(xì)胞中的表達(dá)變化
發(fā)布時(shí)間:2021-02-10 11:23
目的明確衰老相關(guān)microRNA與恒河猴增齡的相關(guān)性。方法將猴群參照人類(lèi)增齡劃分為幼年、成年、老年和長(zhǎng)壽,提取外周血白細(xì)胞的總RNA;用real-time PCR檢測(cè)外周血白細(xì)胞中的microRNA及VEGFA、GHR、TBP、INSR、CLOCK、IKBKB、PIK3R1、LRP2、SSTR3、IGF1R、BCL2、PPM1D、IRS1、MAPK8、ADCY5、APP、NFE2L1、BDNF和PEX5的表達(dá);利用microRNA靶基因預(yù)測(cè)網(wǎng)站miRwalk、TargetSan、miRecords、miRDB預(yù)測(cè)miR-16-5p的靶基因,并與人類(lèi)衰老基因庫(kù)(http://genomics.senescence.info/)對(duì)接。結(jié)果在增齡過(guò)程中,恒河猴外周血白細(xì)胞中miR-16-5p的表達(dá)量隨年齡增長(zhǎng)而增加(P<0.001);多個(gè)網(wǎng)站對(duì)miR-16-5p靶基因預(yù)測(cè)得到539個(gè)潛在的靶基因,與人類(lèi)衰老基因組庫(kù)對(duì)接后有19個(gè)基因重合;有10個(gè)基因的mRNA在恒河猴增齡過(guò)程中存在差異表達(dá),其中, IKBKB、PIK3R1、IRS1的表達(dá)隨著年齡的增加逐漸下降。結(jié)論在自然衰老恒河猴的外...
【文章來(lái)源】:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2019,39(07)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
mircoRNA在增齡恒河猴血液白細(xì)胞中的表達(dá)量變化A.real-timePCRanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup
RanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup圖1mircoRNA在增齡恒河猴血液白細(xì)胞中的表達(dá)量變化Fig1ExpressionofmicroRNAinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)A.WaynediagramofmiR-16-5ptargetgenepredictedbymiRwalk,TargetSan,miRecordsandmiRDB;B.Waynedia-gramofmiR-16targetgeneandHumanAgeingGenomicResources圖2增齡恒河猴血液白細(xì)胞中miR-16-5p靶基因的預(yù)測(cè)Fig2PredictionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys2.3自然增齡恒河猴外周血白細(xì)胞中miR-16-5p潛在的靶基因的表達(dá)變化情況檢測(cè)了預(yù)測(cè)得到的19條mRNA在增齡恒河猴外周血白細(xì)胞中的表達(dá),其中在樣本中檢測(cè)到了10條mRNA(其余未檢測(cè)到)(圖3):IGF1R和PEX5的表達(dá)均在幼年組、成年組和老年組中逐漸升高,在長(zhǎng)壽組中降低,且相對(duì)于幼年組來(lái)說(shuō)其表達(dá)量?jī)H在老年組呈顯著差異(IGF1RP<0.01;PEX5P<0.05)。而TBP(P<0.01),PIK3R1(P<0.05)僅在長(zhǎng)壽組中顯著降低,其余幾乎沒(méi)有變化;IKBKB的表達(dá)相對(duì)于幼年組來(lái)說(shuō)在成年組(P<0.05),老年組(P<0.05)和長(zhǎng)壽組(P<0.01)中均顯著下降;IRS1的表達(dá)則在老年組(P<0.05),長(zhǎng)壽組(P<0.05)中顯著降低。CLOCK、BCL、APP和NFE2L1的表達(dá)量的差異在各組間則無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。3討論衰老是生物體隨年齡增長(zhǎng)面臨的機(jī)體各個(gè)功能的漸進(jìn)性喪失,而非人靈長(zhǎng)類(lèi)在進(jìn)化上最接近于人類(lèi),所以將恒河猴用作實(shí)驗(yàn)?
ma-2596PPM1Dproteinphosphatase,Mg2+/Mn2+dependent1D8493IRS1insulinreceptorsubstrate13667MAPK8mitogen-activatedproteinkinase85599ADCY5adenylatecyclase5111APPamyloidbetaprecursorprotein351NFE2L1nuclearfactorerythroid2-relatedfactor14779BDNFbrainderivedneurotrophicfactor627PEX5peroxisomalbiogenesisfactor55830Real-timePCRanalysisofmiR-16targetgeneinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood;*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001comparedwithinfantgroup圖3增齡恒河猴外周血白細(xì)胞中miR-16-5p靶基因的驗(yàn)證Fig3DetectionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)計(jì)學(xué)意義,可能是由于APP還受其他因素調(diào)節(jié)。根據(jù)對(duì)19條mRNA的驗(yàn)證結(jié)果發(fā)現(xiàn)PIK3R1、IRS1和IKBKB很可能是miR-16-5p在外周血白細(xì)胞中的靶基因,分別與胰島素信號(hào)通路及NFκB信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)。胰島素通路是調(diào)節(jié)糖代謝的重要通路,可以通過(guò)其受體IR及其受體底物IRS激活PI-3K/AKT信號(hào)通路來(lái)發(fā)揮功能。IRS1的缺失可以延長(zhǎng)小鼠的壽命[9],其在腦部的異位磷酸化也與APP的異常聚集有關(guān)[10]。說(shuō)明胰島素通路與衰老有關(guān),具體則可能是通過(guò)PI-3K/AKT通路及叉頭轉(zhuǎn)錄因子(FoxO)完成的。FoxO能被AKT磷酸化后離開(kāi)細(xì)胞核進(jìn)入到泛素降解途徑。而FoxO在核內(nèi)可以與轉(zhuǎn)錄因子共同激活其基因的表達(dá),通過(guò)保護(hù)機(jī)體免受氧化應(yīng)激侵?jǐn)_[11],增加受損蛋白的移除[12]999
本文編號(hào):3027278
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mircoRNA在增齡恒河猴血液白細(xì)胞中的表達(dá)量變化A.real-timePCRanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup
RanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup圖1mircoRNA在增齡恒河猴血液白細(xì)胞中的表達(dá)量變化Fig1ExpressionofmicroRNAinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)A.WaynediagramofmiR-16-5ptargetgenepredictedbymiRwalk,TargetSan,miRecordsandmiRDB;B.Waynedia-gramofmiR-16targetgeneandHumanAgeingGenomicResources圖2增齡恒河猴血液白細(xì)胞中miR-16-5p靶基因的預(yù)測(cè)Fig2PredictionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys2.3自然增齡恒河猴外周血白細(xì)胞中miR-16-5p潛在的靶基因的表達(dá)變化情況檢測(cè)了預(yù)測(cè)得到的19條mRNA在增齡恒河猴外周血白細(xì)胞中的表達(dá),其中在樣本中檢測(cè)到了10條mRNA(其余未檢測(cè)到)(圖3):IGF1R和PEX5的表達(dá)均在幼年組、成年組和老年組中逐漸升高,在長(zhǎng)壽組中降低,且相對(duì)于幼年組來(lái)說(shuō)其表達(dá)量?jī)H在老年組呈顯著差異(IGF1RP<0.01;PEX5P<0.05)。而TBP(P<0.01),PIK3R1(P<0.05)僅在長(zhǎng)壽組中顯著降低,其余幾乎沒(méi)有變化;IKBKB的表達(dá)相對(duì)于幼年組來(lái)說(shuō)在成年組(P<0.05),老年組(P<0.05)和長(zhǎng)壽組(P<0.01)中均顯著下降;IRS1的表達(dá)則在老年組(P<0.05),長(zhǎng)壽組(P<0.05)中顯著降低。CLOCK、BCL、APP和NFE2L1的表達(dá)量的差異在各組間則無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。3討論衰老是生物體隨年齡增長(zhǎng)面臨的機(jī)體各個(gè)功能的漸進(jìn)性喪失,而非人靈長(zhǎng)類(lèi)在進(jìn)化上最接近于人類(lèi),所以將恒河猴用作實(shí)驗(yàn)?
ma-2596PPM1Dproteinphosphatase,Mg2+/Mn2+dependent1D8493IRS1insulinreceptorsubstrate13667MAPK8mitogen-activatedproteinkinase85599ADCY5adenylatecyclase5111APPamyloidbetaprecursorprotein351NFE2L1nuclearfactorerythroid2-relatedfactor14779BDNFbrainderivedneurotrophicfactor627PEX5peroxisomalbiogenesisfactor55830Real-timePCRanalysisofmiR-16targetgeneinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood;*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001comparedwithinfantgroup圖3增齡恒河猴外周血白細(xì)胞中miR-16-5p靶基因的驗(yàn)證Fig3DetectionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)計(jì)學(xué)意義,可能是由于APP還受其他因素調(diào)節(jié)。根據(jù)對(duì)19條mRNA的驗(yàn)證結(jié)果發(fā)現(xiàn)PIK3R1、IRS1和IKBKB很可能是miR-16-5p在外周血白細(xì)胞中的靶基因,分別與胰島素信號(hào)通路及NFκB信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)。胰島素通路是調(diào)節(jié)糖代謝的重要通路,可以通過(guò)其受體IR及其受體底物IRS激活PI-3K/AKT信號(hào)通路來(lái)發(fā)揮功能。IRS1的缺失可以延長(zhǎng)小鼠的壽命[9],其在腦部的異位磷酸化也與APP的異常聚集有關(guān)[10]。說(shuō)明胰島素通路與衰老有關(guān),具體則可能是通過(guò)PI-3K/AKT通路及叉頭轉(zhuǎn)錄因子(FoxO)完成的。FoxO能被AKT磷酸化后離開(kāi)細(xì)胞核進(jìn)入到泛素降解途徑。而FoxO在核內(nèi)可以與轉(zhuǎn)錄因子共同激活其基因的表達(dá),通過(guò)保護(hù)機(jī)體免受氧化應(yīng)激侵?jǐn)_[11],增加受損蛋白的移除[12]999
本文編號(hào):3027278
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